外泌体分离与表征
验证EC-Exos的形态、大小和标志物表达
从bEND.3细胞培养上清中分离外泌体,通过透射电镜观察形态,纳米颗粒跟踪分析粒径分布,Western blot检测CD63和CD81表达。
Endothelial cell-derived exosomes inhibit high glucose-induced osteoblast ferroptosis by activating microRNA-335-3p/prostaglandin endoperoxide synthase 2.
包含体外细胞实验(外泌体表征、铁死亡标志物检测)、分子机制验证(双荧光素酶报告基因)、临床样本验证(血清miR-335-3p和PTGS2水平及ROC分析),但缺乏体内动物实验验证。
小鼠成骨细胞MC3T3E1 小鼠血管内皮细胞bEND.3 T2DM患者血清样本 DOP患者血清样本
高糖处理浓度25 mmol/L,处理48小时 外泌体处理剂量5 μg蛋白,共培养6小时 miR-335-3p抑制剂转染 PTGS2 3'UTR双荧光素酶报告基因验证 DOP患者血清样本纳入标准
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证EC-Exos的形态、大小和标志物表达
从bEND.3细胞培养上清中分离外泌体,通过透射电镜观察形态,纳米颗粒跟踪分析粒径分布,Western blot检测CD63和CD81表达。
验证PKH26标记的EC-Exos能否被成骨细胞摄取
MC3T3E1细胞与PKH26标记的EC-Exos共培养6小时,荧光显微镜观察摄取情况。
评估EC-Exos对高糖诱导的成骨细胞铁死亡的影响
MC3T3E1细胞分为对照组(5.5 mmol/L葡萄糖)、HG组(25 mmol/L葡萄糖)、HG+EC-Exos组(HG条件下加入外泌体),检测ROS、MDA、GSH和铁死亡标志物表达。
筛选HG+EC-Exos组与HG组中差异表达的miRNAs,并预测靶基因
提取总RNA进行高通量测序,筛选差异表达miRNAs,并通过KEGG富集和靶基因预测识别miR-335-3p靶向PTGS2。
验证miR-335-3p是否直接结合PTGS2 3'UTR
构建野生型和突变型PTGS2 3'UTR荧光素酶报告质粒,与mmu-miR-335-3p共转染MC3T3细胞,检测双荧光素酶活性。
验证miR-335-3p在EC-Exos抑制铁死亡中的必要性
在HG条件下,用miR-335-3p抑制剂或NC转染细胞,再与EC-Exos共培养,检测ROS、MDA、GSH和铁死亡标志物表达。
比较DOP与T2DM患者血清miR-335-3p和PTGS2水平,评估诊断价值
收集DOP和T2DM患者血清,qPCR检测miR-335-3p,ELISA检测PTGS2,进行相关性分析和ROC曲线评估。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | VivaCell | -- |
| 外泌体分离 | 总外泌体分离试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 外泌体标记 | PKH26 | Solarbio | -- |
| RNA提取 | TRIzol | -- | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green定量逆转录PCR试剂盒 | Biosharp | -- |
| 双荧光素酶报告基因 | pEZX-MT06载体 | Gene Copoeia | -- |
| 细胞转染 | Lip3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| MDA检测 | 丙二醛检测试剂盒 | Biyun | -- |
| GSH检测 | 谷胱甘肽检测试剂盒 | BiYuntian | -- |
| RNA提取 | TRI试剂 | Biosharp | -- |
| RT-qPCR | Prime Script RT预混液试剂盒 | TaKaRa | -- |
| Western blotting | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 抗GAPDH抗体 | Zhongshan Jinqiao | -- | |
| 抗PTGS2抗体 | Zhongshan Jinqiao | -- | |
| 抗GPX4抗体 | Zhongshan Jinqiao | -- | |
| 抗SLC7A11抗体 | Zhongshan Jinqiao | -- | |
| 抗SLC3A2抗体 | Zhongshan Jinqiao | -- | |
| 抗CD63抗体 | Zhongshan Jinqiao | -- | |
| 抗CD81抗体 | Zhongshan Jinqiao | -- | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Zhongshan Jinqiao | -- | |
| Western ECL底物试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ELISA | PTGS2 ELISA试剂盒 | Tiande Biotechnology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基成分、培养条件(37°C、5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods,Cell culture小节 |
| 高糖处理与外泌体干预 | 葡萄糖浓度(25 mmol/L vs 5.5 mmol/L)、处理时间(48小时)、外泌体剂量(5 μg蛋白)及共培养时间(6小时) 阅读提示:Materials and Methods,Cell grouping小节 |
| miRNA测序及分析 | 差异表达阈值(|log2FC| ≥ 1,q < 0.05)、样品处理条件(HG vs HG+EC-Exos) 阅读提示:Materials and Methods,High-throughput sequencing小节 |
| 双荧光素酶报告基因 | 质粒构建(野生型和突变型PTGS2 3'UTR)、转染条件(细胞密度、DNA、miR量) 阅读提示:Materials and Methods,Luciferase validation of the target gene小节 |
| miR-335-3p抑制实验 | 抑制剂序列、转染试剂(Lipofectamine 2000)、转染时间和条件 阅读提示:Materials and Methods,Cell transfection小节 |
| 临床样本分析 | 纳入和排除标准、血清采集和处理、检测方法(qPCR、ELISA) 阅读提示:Materials and Methods,Clinical data collection及ELISA for determination of serum PTGS2 levels小节 |