评估LSDV感染对IFN-I反应的影响
确定LSDV感染是否抑制宿主IFN-β诱导的ISG表达和JAK-STAT信号传导。
在Holstein牛病变皮肤和MDBK细胞中,检测LSDV感染后ISG15、ISG56等mRNA水平,以及IFN-β诱导的STAT1/2磷酸化。
Lumpy skin disease virus protein LSDV122 impairs IFN-I receptor complex formation to evade host innate immunity.
包含体外细胞实验(HEK293T、MDBK、HeLa)、体内小鼠和牛模型、病毒基因敲除(LSDVΔ122)、机制验证(Co-IP、域映射、流式)等多层级验证。
HEK293T细胞 MDBK细胞 HeLa细胞 C57BL/6小鼠模型 Holstein牛模型
LSDV122与IFNAR1和IFNAR2相互作用,破坏IFNAR复合物形成 LSDV122抑制IFN-β诱导的ISG转录(如ISG56、RSAD2)和STAT1/STAT2磷酸化 LSDVΔ122在MDBK细胞和小鼠模型中恢复IFN-β信号传导并增强ISG表达 LSDV122的表达在病毒感染早期和晚期均存在,不依赖DNA复制(CHX和Ara-C实验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定LSDV感染是否抑制宿主IFN-β诱导的ISG表达和JAK-STAT信号传导。
在Holstein牛病变皮肤和MDBK细胞中,检测LSDV感染后ISG15、ISG56等mRNA水平,以及IFN-β诱导的STAT1/2磷酸化。
从LSDV编码蛋白中筛选能抑制IFN-β诱导ISG表达的病毒蛋白。
在HEK293T细胞中转染LSDV蛋白表达质粒,检测IFN-β诱导的ISG56转录,选出LSDV122和LSDV135;随后在HEK293T和稳定表达LSDV122的MDBK细胞中验证其抑制多个ISG(IFI44、ISG56、RSAD2、MX2)的诱导。
确认LSDV122是否与IFN-I受体亚基直接结合。
通过共转染和免疫共沉淀实验检测LSDV122与IFNAR1/2的相互作用;在LSDV感染MDBK细胞中检测内源性相互作用;通过共聚焦显微镜观察共定位。
确定LSDV122与IFNAR1/2相互作用所需的关键区域。
构建IFNAR1、IFNAR2和LSDV122的截短突变体,通过Co-IP检测相互作用;在HEK293T细胞中检测突变体对IFN-β诱导ISG表达的影响。
探究LSDV122是否通过影响受体复合物组装来抑制信号传导。
通过流式细胞术检测LSDV122对IFN-I结合的影响;通过Co-IP检测LSDV122对IFNAR1-IFNAR2、IFNAR1-TYK2、IFNAR2-JAK1相互作用的影响。
验证LSDV122缺失是否增强病毒诱导的IFN-I反应。
通过同源重组从LSDV/China/Hainan/2021中敲除LSDV122基因,验证纯度和基因表达;在MDBK细胞中检测复制动力学和IFN-β诱导的ISG转录和STAT1/2磷酸化;在小鼠模型中检测血清ISG15、CXCL10和组织ISG表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 胰蛋白酶 | NCM Biotech | C100C1 |
| 胎牛血清 | Cellmax | SA211.02 | |
| 青霉素和链霉素 | Pricella | PB180120 | |
| DMEM培养基 | Gibco | C11965500BT | |
| 嘌呤霉素 | VWR | AMR-J593 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A+G琼脂糖 | Beyotime | P2055 |
| 细胞处理 | 重组人IFN-β | ThermoFisher Scientific | 300-02BC |
| 重组人IFN-γ | ThermoFisher Scientific | 300-02 | |
| RT-qPCR | SYBR Green预混液 | Vazyme | Q312 |
| HiScript II Select RT SuperMix(qPCR) | Vazyme | R323 | |
| 细胞处理 | 抑肽酶 | MCE | HY-P0017 |
| 亮抑酶肽 | MCE | HY-18234A | |
| β-甘油磷酸二钠盐 | MCE | HY-126304 | |
| 病毒基因表达分析 | 阿糖胞苷 | MCE | HY-13605 |
| 细胞处理 | 原钒酸钠 | MCE | HY-D0852 |
| 免疫印迹 | 抗HA小鼠单克隆抗体 | Proteintech | 66006 |
| 抗HA兔单克隆抗体 | Sigma | H6908 | |
| 抗Flag小鼠单克隆抗体 | Sigma | AP0530 | |
| 辣根过氧化物酶标记抗Flag抗体 | Servicebio | ZB15939 | |
| 免疫球蛋白G | Sigma | I5381和I5006 | |
| 磷酸化JAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3331S | |
| JAK1抗体 | ABclonal | A25841 | |
| 磷酸化TYK2抗体 | Cell Signaling Technology | 9321S | |
| TYK2抗体 | Cell Signaling Technology | 14193S | |
| 磷酸化STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9167S | |
| STAT1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-417 | |
| 磷酸化STAT2抗体 | Cell Signaling Technology | 88410S | |
| STAT2抗体 | Cell Signaling Technology | 72604S | |
| IFNAR1抗体 | ABclonal | A0575 | |
| IFNAR2抗体 | Cell Signaling Technology | 53883s | |
| 流式细胞术 | PE标记抗DYKDDDDK标签抗体 | Biolegend | 637310 |
| 免疫荧光 | 抗小鼠IgG(H+L)F(ab')2片段(Alexa Fluor 594结合物) | Cell Signaling Technology | 8890 |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG(H+L) | Invitrogen | A11008 | |
| ELISA | 小鼠ISG15 ELISA试剂盒 | CUSABIO | CSB-EL011843MO |
| 小鼠CXCL10 ELISA试剂盒 | BOSTER | EK0736 | |
| 组织匀浆 | 钢珠 | Qiagen | -- |
| 组织研磨仪 | -- | -- | |
| 显微镜 | 蔡司共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与病毒株 | 使用的细胞系(HEK293T、MDBK、HeLa)、LSDV毒株(LSDV/China/Hainan/2021)及其培养条件(培养基、血清浓度) 阅读提示:见Materials and methods: Reagents, antibodies, cells and viruses |
| IFN-β刺激实验 | IFN-β浓度(100 ng/ml、200 ng/ml等)、处理时间(3、6、10小时等)、细胞转染量(2×10^5、5×10^6等) 阅读提示:见Figure legends: Fig 2, Fig 6等 |
| 病毒基因敲除株生成 | 同源重组方法、筛选过程(PCR和免疫印迹验证)、LSDVΔ122的纯度 阅读提示:见Materials and methods: Generation of LSDVΔ122 |
| 动物实验 | 使用的动物品系(C57BL/6小鼠、Holstein牛)、年龄、性别、病毒剂量(2.6×10^5 pfu/小鼠、2×10^6 pfu/牛)、感染途径 阅读提示:见Materials and methods: Animal experiments |
| 机制验证实验 | 抗体来源和稀释度、IP缓冲液成分(20 mM Tris-HCl pH 7.4、1% NP-40等)、洗膜缓冲液盐浓度(750 mM NaCl) 阅读提示:见Materials and methods: Coimmunoprecipitation and immunoblotting analysis |