体外药效评估
评估Zea对肺癌细胞恶性表型的影响。
使用A549细胞,设立Blank、NC和Zea组,通过CCK-8、克隆形成、Transwell和流式细胞术检测细胞活力、增殖、迁移和凋亡。
Zeaxanthin targets TOP2A to regulate autophagy and suppress lung cancer progression via the MAPK/ERK pathway.
包含体外细胞实验、转录组测序、分子对接、细胞热位移实验、功能验证、机制验证和动物模型等多个独立证据层级。
A549人肺癌细胞系 HEK293T细胞系 BALB/c裸鼠皮下异种移植瘤模型
Zea处理浓度:98.17 μmol/L,作用24小时 Zea给药方式:50 mg/kg,灌胃,每2天一次,持续14天 MAPK/ERK通路激活剂Ro 67-7476的使用 TOP2A敲低和过表达细胞系的构建及验证 自噬抑制剂3-MA的浓度(文中未明确说明)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Zea对肺癌细胞恶性表型的影响。
使用A549细胞,设立Blank、NC和Zea组,通过CCK-8、克隆形成、Transwell和流式细胞术检测细胞活力、增殖、迁移和凋亡。
探索Zea处理对肺癌细胞转录组的影响,并鉴定潜在靶点和信号通路。
对Zea处理和对照的A549细胞进行RNA测序,分析差异表达基因,并进行GO和KEGG富集分析,发现MAPK信号通路显著富集,并鉴定TOP2A为下调基因。
验证Zea是否直接靶向TOP2A并影响其稳定性。
通过分子对接模拟Zea与TOP2A的结合模式,并通过CETSA实验检测Zea对TOP2A热稳定性的影响。
探究TOP2A对肺癌细胞自噬和恶性表型的影响。
通过siRNA敲低A549细胞中TOP2A,并加入自噬抑制剂3-MA进行拯救实验,检测细胞活力、增殖、迁移和凋亡变化。
验证Zea是否通过抑制TOP2A来阻断MAPK/ERK通路并促进自噬。
构建TOP2A过表达的A549细胞系,并进行Zea处理,通过Western blot检测TOP2A、MAPK/ERK通路蛋白以及自噬相关蛋白的表达,通过免疫荧光检测自噬体和溶酶体的共定位。
在体内模型中验证Zea通过靶向TOP2A抑制肿瘤生长的作用。
使用BALB/c裸鼠皮下接种oe-NC或oe-TOP2A A549细胞,建立异种移植瘤模型,然后通过灌胃给予Zea或PBS,检测肿瘤生长、组织病理、增殖标志物及通路蛋白变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | F-12K培养基 | BNCC | -- |
| DMEM培养基 | BNCC | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 玉米黄质 | MCE | HY-120318 |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| ABScript III RT预混液 | ABclonal | -- | |
| SYBR Green预混液 | Vazyme | -- | |
| 实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| CCK-8 | CCK-8溶液 | Beyotime | -- |
| 酶标仪 | Bio Tek | -- | |
| 克隆形成 | 结晶紫 | Beyotime | -- |
| Transwell | Transwell小室 | -- | -- |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | BD Bio | -- |
| 流式细胞仪 | Agilent | -- | |
| 动物实验 | 异氟烷 | MedChemExpress (MCE) | -- |
| HE染色 | 伊红 | Beyotime | -- |
| IHC | DAB显色液 | Beyotime | -- |
| IF | Triton X-100 | Beyotime | -- |
| 牛血清白蛋白 | Beyotime | -- | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| Western blot | 兔抗p-ERK1/2抗体 | ABclonal | AP0234 |
| 兔抗ERK1/2抗体 | ABclonal | A4782 | |
| 兔抗p-MEK抗体 | ABclonal | AP1349 | |
| 兔抗MEK抗体 | ABclonal | A4868 | |
| Western blot, IF | 兔抗LC3抗体 | ABclonal | A19665 |
| Western blot | 兔抗Beclin 1抗体 | ABclonal | A21191 |
| 兔抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| IF | 兔抗LAMP1抗体 | Abcam | ab320851 |
| WB, IHC | 兔抗TOP2A抗体 | Abcam | ab52934 |
| IP | 兔抗TOP2A抗体 | Abcam | ab12318 |
| IHC | 兔抗Ki67抗体 | Abcam | ab16667 |
| WB, IHC, IP | 山羊抗兔IgG H&L(HRP) | Abcam | Ab205718 |
| IF | 山羊抗兔IgG H&L(Alexa Fluor® 488) | Abcam | ab150077 |
| 细胞处理 | Ro 67-7476 | MCE | -- |
| 3-甲基腺嘌呤 | MCE | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:A549(BNCC337696)和HEK293T(CL-0005) 阅读提示:Methods - Cell cultivation |
| Zea处理 | Zea浓度:98.17 μmol/L;处理时间:24小时;对照组:无水乙醇(ETOH) 阅读提示:Methods - Cell cultivation |
| 转录组测序 | 处理:Zea 98.17 μmol/L,24小时;每组3个重复 阅读提示:Methods - Transcriptome sequencing analysis |
| TOP2A敲低/过表达 | 转染试剂:Lipofectamine 2000;敲低:si-TOP2A;过表达:oe-TOP2A(pLVX-Puro载体) 阅读提示:Methods - Cell transfection |
| 体内实验 | 动物模型:BALB/c裸鼠皮下注射2×10^6个细胞;Zea剂量:50 mg/kg,灌胃,每2天一次,持续14天;对照组:PBS 阅读提示:Methods - Xenograft tumor model construction |
| 通路激活/抑制 | MAPK/ERK激活剂Ro 67-7476;自噬抑制剂3-MA(浓度文中未明确说明) 阅读提示:Results - Zea modulates MAPK/ERK signaling...; Results - TOP2A promotes LC progression... |