外泌体分离与表征
验证HUVEC来源细胞外囊泡为外泌体并评估其基本特性。
从HUVEC培养上清中分离外泌体,通过TEM观察形态,DLS测量粒径,Western blot检测标志物CD9、CD63、TSG101,并进行PKH67标记和摄取实验。
HUVEC-derived exosomes alleviate lipopolysaccharide-induced acute lung injury inflammation by restoring the balance of mitochondrial fusion and division.
包含体外细胞共培养、体内小鼠模型、巨噬细胞清除、RNA-seq、miRNA靶向验证及工程化囊泡体内疗效与机制验证等多个独立证据层级。
THP-1来源巨噬细胞 A549肺上皮细胞 C57BL/6小鼠LPS诱导急性肺损伤模型
ALI模型:C57BL/6小鼠腹腔注射LPS 10 mg/kg 外泌体给药:气管内滴注20 µg(溶于30 µl PBS) 体外M1极化:THP-1经200 ng/mL PMA分化后,1 µg/mL LPS刺激12 h 巨噬细胞清除:尾静脉注射200 µL氯膦酸盐脂质体,在ALI诱导前一天 MARCH5过表达:尾静脉注射AAV9-MARCH5
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证HUVEC来源细胞外囊泡为外泌体并评估其基本特性。
从HUVEC培养上清中分离外泌体,通过TEM观察形态,DLS测量粒径,Western blot检测标志物CD9、CD63、TSG101,并进行PKH67标记和摄取实验。
探究HUVEC外泌体对LPS诱导的巨噬细胞炎症和上皮细胞损伤的影响。
THP-1细胞经PMA分化为巨噬细胞,LPS刺激诱导M1极化,收集条件培养基与A549上皮细胞共培养,并加入外泌体处理,检测细胞活力、凋亡、迁移及炎症因子。
验证HUVEC外泌体在LPS诱导的小鼠ALI模型中的治疗作用。
建立小鼠ALI模型,气管内滴注外泌体,评估肺组织病理、炎症因子、呼吸功能,并通过RNA-seq和Western blot分析信号通路。
验证巨噬细胞是否为HUVEC外泌体发挥作用的主要靶细胞。
使用氯膦酸盐脂质体清除小鼠巨噬细胞,再建立ALI模型并给予外泌体治疗,评估治疗效果是否消失。
探究外泌体对线粒体动力学和炎症通路的影响。
检测线粒体形态、膜电位、mtDNA释放、融合分裂基因表达,以及NF-κB和MAPK通路激活情况。
鉴定外泌体中发挥关键作用的miRNA及其靶基因。
分析miRNA测序数据,进行GO分析,预测并验证miR-520d-3p与MARCH5的相互作用,检测其对Mfn1泛素化的影响。
设计并合成负载IPR的工程化囊泡exosome@IPR,评估其疗效。
通过电穿孔将IPR装载入HUVEC外泌体,表征其形态和释放特性,并在小鼠ALI模型中评估其减轻肺损伤和炎症的效果。
验证MARCH5是否为exosome@IPR发挥治疗作用的关键靶点。
通过AAV9-MARCH5过表达小鼠,评估exosome@IPR疗效是否被阻断,检测线粒体形态、炎症通路和氧化应激标志。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 脂多糖 | -- | -- |
| 外泌体分离 | 外泌体提取试剂盒 | Vazyme | -- |
| BCA蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Glpbio | -- |
| 细胞迁移 | Transwell小室 | Corning | -- |
| 细胞凋亡检测 | FITC和PI凋亡检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1染料 | Beyotime | -- |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | -- | -- |
| 逆转录试剂盒 | Servicebio | -- | |
| SYBR Green染料 | Vazyme | -- | |
| Western blot | 蛋白裂解缓冲液 | Servicebio | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- | |
| ECL化学发光试剂 | -- | -- | |
| 抗体 | CD9抗体 | Proteintech | 20597-1-AP |
| CD63抗体 | Proteintech | 25682-1-AP | |
| TSG101抗体 | Proteintech | 28283-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 6004-1-lg | |
| p-IκKα抗体 | ABconal | AP0506 | |
| t-IκKα抗体 | ABconal | A19694 | |
| p-IκBα抗体 | ABconal | AP0707 | |
| t-IκBα抗体 | ABconal | A19714 | |
| p-NF-κB抗体 | ABconal | AP1294 | |
| t-NF-κB抗体 | ABconal | A19653 | |
| p-P38抗体 | ABconal | AP1508 | |
| t-P38抗体 | ABconal | A4771 | |
| p-ERK1/2抗体 | ABconal | AP0234 | |
| ERK1/2抗体 | Proteintech | 11257-1-AP | |
| IL-6抗体 | Proteintech | 83747-5-RR | |
| TNF-α抗体 | Proteintech | 80258-6-RR | |
| IL-1β抗体 | Proteintech | 66737-1-Ig | |
| PGC-1α抗体 | Abmart | T56630 | |
| MARCH5抗体 | Abmart | PS17816 | |
| Myc抗体 | HUABIO | EM1902-38 | |
| 泛素抗体 | ABconal | A19686 | |
| GFP抗体 | HUABIO | ET1607-31 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG (H+L) | ABconal | AS014 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG (H+L) | ABconal | AS003 | |
| RNA测序 | Illumina NovaSeq平台 | Illumina | -- |
| 动物实验 | AAV9-MARCH5病毒 | -- | -- |
| 药物处理 | 异丙托溴铵 | -- | -- |
| SR-18,292 | -- | -- | |
| 电穿孔 | 电穿孔系统 | -- | -- |
| 透析 | 透析袋 | -- | -- |
| HPLC | 高效液相色谱 | -- | -- |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Pricella | -- |
| F-12K培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物ALI模型 | 小鼠品系、年龄、性别、LPS剂量、给药途径、外泌体剂量和给药途径、取材时间点 阅读提示:Materials and methods: Animals and treatments |
| 体外巨噬细胞极化 | THP-1细胞分化条件(PMA浓度)、LPS浓度和刺激时间、外泌体处理浓度 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment |
| 外泌体分离与表征 | HUVEC培养条件、外泌体分离方法(密度梯度离心)、表征方法(TEM、DLS、Western blot) 阅读提示:Materials and methods: Isolation and characterization of exosomes |
| 巨噬细胞清除 | 氯膦酸盐脂质体剂量和给药途径、给药时间点、清除效率验证 阅读提示:Materials and methods: Macrophage depletion |
| MARCH5过表达 | AAV9-MARCH5血清型、滴度、给药途径、过表达效率验证 阅读提示:Materials and methods: Data analysis; Results: Therapeutic target |
| 线粒体形态和功能检测 | 线粒体染色方法、JC-1工作浓度、PicoGreen染色、mtDNA释放检测方法 阅读提示:Materials and methods: Mitochondrial membrane potential, Mitochondrial staining; Results: HUVEC-derived EVs... |
| 工程化囊泡构建 | 电穿孔参数(电压、电容)、IPR浓度、装载效率、体外释放条件 阅读提示:Materials and methods: IPR loading into HUVEC-EVs |