炎症模型的建立与验证
建立LPS诱导的小鼠睾丸炎模型和细胞炎症模型,确认炎症对精原细胞的影响。
小鼠睾丸内注射LPS或生理盐水,1周后取材;细胞用LPS处理。通过H&E染色、TUNEL、IHC等评估睾丸组织病理、凋亡、精原细胞标志物(C-kit、Oct4)和IL-17A表达。
Inflammation-induced LncRNA SNHG1 orchestrates spermatogonium development in non-obstructive azoospermia via IL-17 A signaling pathway.
研究包含体内动物模型(LPS诱导睾丸炎小鼠)、体外细胞模型(GC-1 spg和TCAM-2)、功能验证(敲低/过表达)、机制验证(ChIP、EMSA、双荧光素酶、RNA-seq及IL-17A通路阻断)。
LPS诱导的睾丸炎小鼠模型 小鼠精原细胞系GC-1 spg 人睾丸精原细胞瘤细胞系TCAM-2
LPS诱导睾丸炎小鼠模型,睾丸内注射100 µg/mL LPS 0.03 mL,6只/组 GC-1 spg和TCAM-2细胞,LPS处理浓度10 µg/mL,时间24小时 SNHG1敲低(shSNHG1)和SP1敲低(shSP1)对细胞增殖、凋亡和干性标志物C-kit、Oct4的影响 SP1与SNHG1启动子的结合(ChIP-qPCR、EMSA、双荧光素酶报告基因) IL-17A受体阻断剂Brodalumab处理(10 µg/mL)对SNHG1过表达细胞功能的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立LPS诱导的小鼠睾丸炎模型和细胞炎症模型,确认炎症对精原细胞的影响。
小鼠睾丸内注射LPS或生理盐水,1周后取材;细胞用LPS处理。通过H&E染色、TUNEL、IHC等评估睾丸组织病理、凋亡、精原细胞标志物(C-kit、Oct4)和IL-17A表达。
验证SP1是否直接结合并激活SNHG1启动子。
在细胞中过表达或敲低SP1,检测SNHG1表达;通过ChIP-qPCR、双荧光素酶报告基因和EMSA验证SP1与SNHG1启动子的结合。
评估SNHG1对精原细胞增殖、凋亡和干性的影响。
在LPS处理的细胞中敲低SNHG1,检测细胞增殖(EdU)、凋亡(流式、TUNEL)和干性标志物(C-kit、Oct4);过表达SNHG1观察相反效果。
揭示SNHG1调控的下游信号通路。
对SNHG1过表达和对照GC-1 spg细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因,GO和KEGG富集分析。
验证IL-17A信号通路是否为SNHG1的下游效应器。
用Brodalumab(IL-17A受体拮抗剂)处理SNHG1过表达细胞,检测细胞增殖、凋亡、干性标志物以及IL-17A下游蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | 脂多糖(LPS) | Sigma | -- |
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基(DMEM) | Gibco | -- |
| GC-1 spg | Pricella | -- | |
| TCAM-2 | YaJi Biological | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript RT预混液 | Takara | -- |
| SYBR Green预混液 | Takara | -- | |
| CFX96 Touch | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| anti-SP1抗体 | Abcam | ab157123 | |
| anti-p-SP1抗体 | Abcam | ab59257 | |
| anti-p-ERK抗体 | Abcam | ab201015 | |
| anti-p-p38抗体 | Abcam | ab178867 | |
| anti-p-NF-κB抗体 | Abcam | ab76302 | |
| anti-NF-κB抗体 | Abcam | ab207297 | |
| anti-p-STAT3抗体 | Abcam | ab76315 | |
| anti-STAT3抗体 | Abcam | ab119352 | |
| anti-TRAF6抗体 | Abcam | ab40675 | |
| anti-ACT1抗体 | Abcam | ab5973 | |
| anti-Histone H3抗体 | Abcam | ab1791 | |
| anti-GAPDH抗体 | Abcam | ab181603 | |
| HRP标记二抗 | Servicebio | GB23404 | |
| ECL化学发光试剂 | Beyotime | -- | |
| 免疫组织化学 | anti-C-kit抗体 | Servicebio | GB113799 |
| anti-Oct4抗体 | Abcam | ab181557 | |
| anti-IL-17A抗体 | Abcam | ab79056 | |
| anti-ZO-1抗体 | Abcam | ab221547 | |
| TUNEL | 原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche | -- |
| 链霉亲和素-辣根过氧化物酶 | Thermo Fisher Scientific | 31491 | |
| Cy3标记一步法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 免疫荧光 | anti-SP1抗体 | Abcam | ab157123 |
| anti-C-kit抗体 | Abcam | ab231780 | |
| anti-Oct4抗体 | Abcam | ab181557 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔二抗 | Abcam | ab150085 | |
| Alexa Fluor 647山羊抗兔二抗 | Abcam | ab150091 | |
| DAPI | Sigma | F6057 | |
| 细胞增殖检测 | BeyoClick EdU细胞增殖检测试剂盒(AF594) | Beyotime | -- |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC和PI | Beyotime | C1062L |
| Hoechst 33342 | Sigma | -- | |
| ChIP | Magna ChIP试剂盒 | Millipore | -- |
| EMSA | NE-PER核质提取试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| 生物素标记DNA探针 | RIBO Bio | -- | |
| 尼龙膜 | Amersham | -- | |
| 化学发光核酸检测模块 | Thermo Fisher | -- | |
| RNA-seq | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- | |
| 基因过表达和敲低 | pcDNA3.1(+)质粒 | Guangzhou IGE Biotechnology | -- |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000150 | |
| shRNA(阴性对照) | Merck | SHC016-1EA |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | 小鼠品系、周龄、体重、性别,LPS浓度、注射体积、部位,对照组注射物,处理时间 阅读提示:Materials and methods, Animal model of orchitis |
| 细胞培养与炎症刺激 | 细胞系来源(GC-1 spg和TCAM-2),培养基,LPS处理浓度和时间,细胞接种密度 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and inflammatory stimulation |
| SP1转录调控验证 | ChIP-qPCR中使用抗体、细胞数量,EMSA中核蛋白量、探针浓度,双荧光素酶报告基因所用的质粒和转染试剂 阅读提示:Materials and methods, ChIP, EMSA 以及结果部分 'SP1 transcriptionally regulates SNHG1' |
| SNHG1功能实验 | shRNA序列、转染剂量,过表达质粒,检测时间点,检测指标(增殖、凋亡、干性标志物) 阅读提示:Materials and methods, Gene overexpression and knockdown, 以及结果部分 'SNHG1 knockdown rescues LPS-induced spermatogonia dysfunction' |
| RNA-seq分析 | 细胞处理条件(SNHG1过表达和对照),差异表达基因筛选阈值,生物学重复数 阅读提示:Materials and methods, RNA-seq |
| IL-17A通路阻断实验 | Brodalumab浓度、处理时间,细胞处理方式,检测增殖、凋亡、干性标志物的时间点 阅读提示:Materials and methods, Gene overexpression and knockdown 以及结果部分 'SNHG1 induced spermatogonia dysfunction via IL-17A signaling pathway' |