检测SCI后CLU表达和铁死亡
确定SCI后神经元CLU表达变化及其与铁死亡的相关性。
免疫荧光检测ACSL4表达,TEM观察线粒体形态,Western blot检测不同时间点CLU和ACSL4蛋白水平,免疫荧光双标检测CLU与神经元共定位。
Clusterin Inhibits Neuronal Ferroptosis via the PI3K-AKT-mTOR-SREBP1 Axis to Promote Functional Recovery after Spinal Cord Injury.
包含体外细胞实验(HT22细胞过表达/敲低CLU)、体内动物模型(SCI小鼠AAV-CLU)、转录组学分析及功能验证(运动功能评分、电生理等)。
HT22小鼠海马神经元细胞系 C57BL/6J小鼠T10脊髓损伤模型
HT22细胞:CLU过表达或敲低后RSL3诱导铁死亡 C57BL/6J小鼠:AAV-CLU注射于T10脊髓节段 RSL3浓度:2.5、5、10 μM处理HT22细胞 mTOR抑制剂雷帕霉素(RAPA)处理 BMS评分、足迹试验、MEP检测评估功能恢复
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定SCI后神经元CLU表达变化及其与铁死亡的相关性。
免疫荧光检测ACSL4表达,TEM观察线粒体形态,Western blot检测不同时间点CLU和ACSL4蛋白水平,免疫荧光双标检测CLU与神经元共定位。
验证重组CLU蛋白是否抑制RSL3诱导的神经元铁死亡。
HT22细胞用RSL3处理,加入重组CLU蛋白,检测细胞活力(CCK-8)、脂质过氧化(BODIPY C11)、铁死亡相关基因表达(qPCR)和蛋白表达(Western blot)。
确定内源性CLU过表达和敲低对神经元铁死亡的影响。
构建CLU过表达和敲低的HT22稳定细胞系,RSL3处理后检测铁死亡相关指标(基因表达、线粒体形态、铁累积、ROS、MDA)。
阐明CLU抑制铁死亡的分子机制。
通过RNA-seq和通路富集分析,Western blot检测PI3K-AKT-mTOR通路磷酸化水平,并使用雷帕霉素抑制mTOR,观察对铁死亡标志物和SREBP1/SCD1表达的影响。
验证CLU过表达在体内对SCI后铁死亡和功能恢复的影响。
AAV-CLU注射至小鼠脊髓,建立SCI模型,检测PI3K-AKT-mTOR通路和铁死亡标志物,TEM观察线粒体,免疫荧光检测ROS和ACSL4,并进行BMS评分、足迹试验、MEP检测和神经组织学分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 三溴乙醇 | Sigma-Aldrich | T48402 |
| Dumont显微镊 | F.S.T | 11295-00 | |
| AAV注射 | 异氟烷 | RWD | R510-22 |
| 细胞培养 | HT22细胞 | Procell | CL-0697 |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| 青霉素-链霉素 | eLGbio | -- | |
| 药物处理 | RSL3 | MCE | HY-100218A |
| 荧光染色 | BODIPY 581/591 C11 | Beyotime | C1022 |
| FerroOrange | MCE | HY-D1913 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | GLPBIO | GK10001 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Sigma-Aldrich | T9424 |
| RNA逆转录 | StarScript II第一链cDNA合成试剂盒-II | GenStar | A214 |
| RT-qPCR | 2× RealStar快速SYBR qPCR预混液 | GenStar | A301 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| ROS检测 | DHE检测试剂盒 | Abcam | ab236206 |
| MDA检测 | MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131S |
| 铁离子检测 | 细胞内铁比色检测试剂盒 | APPLYGEN | E1042 |
| 组织学 | 石蜡 | -- | -- |
| OCT包埋剂 | -- | -- | |
| 透射电镜 | 醋酸铀 | -- | -- |
| 柠檬酸铅 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、体重 阅读提示:Materials and Methods - Animals |
| 脊髓损伤手术 | T10 crush损伤方法、钳夹时间、麻醉剂及剂量 阅读提示:Materials and Methods - Spinal cord injury surgeries |
| AAV注射 | AAV滴度、注射体积、注射坐标 阅读提示:Materials and Methods - AAV injection |
| 细胞培养 | HT22细胞来源、培养基、血清浓度、培养条件 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture |
| 体外药物处理 | RSL3浓度、处理时间 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture |
| 功能评估 | BMS评分时间点、足迹试验条件、MEP检测参数 阅读提示:Materials and Methods - BMS score, Footprint test, MEP detection |