临床样本与数据库分析
探究CEACAM6在膀胱癌组织中的表达水平及与预后的关系。
利用TCGA数据库分析CEACAM6表达,并通过IHC染色验证10例膀胱癌组织和5例正常膀胱组织中的CEACAM6表达。
CEACAM6 regulates glycolytic metabolism in bladder cancer cell by controlling ENO1 stability.
包含体外细胞实验(CCK-8、Transwell、克隆形成、划痕)、分子机制实验(Co-IP、免疫荧光、泛素化)、代谢检测(葡萄糖摄取、ATP、乳酸)及体内裸鼠移植瘤模型,多个独立证据层级。
膀胱癌细胞系EJ、5637、T24 人正常膀胱上皮细胞SV-HUC-1 雄性裸鼠皮下移植瘤模型
细胞系:EJ、5637、T24、SV-HUC-1 CEACAM6敲低或过表达效率验证 ENO1抑制剂AP-III-a4浓度:1.25、2.5、5、10μM MG132处理:10μM,8小时 皮下注射EJ细胞1×10^6个/只,生长22天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究CEACAM6在膀胱癌组织中的表达水平及与预后的关系。
利用TCGA数据库分析CEACAM6表达,并通过IHC染色验证10例膀胱癌组织和5例正常膀胱组织中的CEACAM6表达。
筛选合适的膀胱癌细胞系进行后续功能实验。
Western blot检测多种膀胱癌细胞系及正常膀胱上皮细胞中CEACAM6蛋白表达水平。
评估CEACAM6表达变化对膀胱癌细胞增殖、迁移和克隆形成能力的影响。
在EJ、5637细胞中敲低CEACAM6,在T24细胞中过表达CEACAM6,然后进行CCK-8、Transwell迁移、划痕愈合和克隆形成实验。
探究CEACAM6对膀胱癌细胞糖酵解活性的影响。
检测CEACAM6过表达或敲低细胞中的葡萄糖摄取、ATP含量和乳酸产生。
验证CEACAM6是否通过AKT/mTOR通路发挥作用,并利用ENO1抑制剂验证ENO1的作用。
Western blot检测AKT、p-AKT、mTOR、p-mTOR蛋白水平;使用ENO1抑制剂AP-III-a4处理EJ细胞和CEACAM6过表达的T24细胞,检测相关蛋白变化。
验证CEACAM6与ENO1的相互作用及其对ENO1蛋白稳定性的影响。
Co-IP验证蛋白相互作用,免疫荧光观察共定位,CHX追踪实验分析蛋白稳定性,泛素化实验检测泛素化水平,并鉴定CEACAM6结合ENO1的功能区域。
验证CEACAM6通过ENO1发挥功能,确立因果链。
在CEACAM6敲低的EJ细胞中过表达ENO1,在CEACAM6过表达的T24细胞中敲低ENO1,然后检测细胞增殖、糖酵解指标和AKT/mTOR通路蛋白水平。
验证CEACAM6在体内对膀胱癌生长的影响。
将敲低CEACAM6的EJ细胞和对照细胞皮下注射到裸鼠,观察肿瘤生长,并检测肿瘤组织中的CEACAM6和Ki-67表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | C11875500BT |
| F-12K培养基 | Pricella | PM150810 | |
| 胎牛血清 | Pricella | 1642200 | |
| 青霉素-链霉素 | Pricella | PB180120 | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668-019 | |
| 药物处理 | AP-III-a4 (ENO1抑制剂) | MCE | HY-15858 |
| MG132 (蛋白酶体抑制剂) | MCE | HY-13259 | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| HRP标记抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| HRP标记抗鼠IgG | Proteintech | B900620 | |
| 免疫荧光 | Lab-Tek II腔室玻片 | Thermo Fisher Scientific | 154941 |
| 免疫组织化学 | 抗CEACAM6抗体 | Affinity | DF8029 |
| 抗Ki-67抗体 | Affinity | AF0198 | |
| 蛋白质印迹 | 抗AKT抗体 | Affinity | AF6259 |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Affinity | AF3263 | |
| 抗mTOR抗体 | Affinity | AF7803 | |
| 抗磷酸化mTOR抗体 | Affinity | AF3308 | |
| 代谢检测 | CheKine葡萄糖检测试剂盒 | Abbkine | KTB1300 |
| CheKine ATP检测试剂盒 | Abbkine | KTB1016 | |
| 乳酸检测试剂盒 | Solarbio | BC2235 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(ATCC)及培养条件:培养基、血清浓度、抗生素、温度、CO2浓度 阅读提示:见Methods: Cell lines and culture conditions |
| 基因操作 | shRNA序列、慢病毒滴度(1×10^8 TU/mL)、转染体积(20μL)、质粒转染量(2μg/10^6细胞)及转染试剂 阅读提示:见Methods: Transfection and antagonist |
| 药物处理 | AP-III-a4浓度(0-10μM)、处理时间(24h);MG132浓度(10μM)、处理时间(8h) 阅读提示:见Methods: Transfection and antagonist |
| 体外功能实验 | CCK-8检测每孔细胞数(3000)、检测时间点(24-96h)及孵育条件;Transwell上室细胞数(25000)、孵育时间(48h);克隆形成每孔细胞数(500)、培养天数(10天) 阅读提示:见Methods: CCK8 assay, Transwell migration assay, Clone formation assay |
| 蛋白稳定性实验 | CHX浓度(10μg/mL)及处理时间点(0、4、8、24h) 阅读提示:见Results: CEACAM6 interacts with ENO1 and regulates its stability 及图4C-D |
| 体内动物实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、性别(雄性)、周龄(5周)、细胞注射量(1×10^6个/只)、肿瘤生长时间(22天)、各组动物数(n=5) 阅读提示:见Methods: Animal studies 及图6A-C |