构建potD和arcA缺失及回补菌株
验证PotD和ADI在猪链球菌致病性中的功能。
通过同源重组在SC19背景上构建ΔpotD、ΔarcA及回补菌株CΔpotD、CΔarcA,并经PCR和测序验证。
PotD contributes to Streptococcus suis-induced blood-brain barrier disruption by regulating arcA transcription.
研究包含基因敲除、回补、体外细胞感染、重组蛋白刺激、小鼠感染模型、蛋白互作(pulldown、质谱)及转录分析等多个层次,并具备功能验证和机制验证。
hCMEC/D3细胞 bEnd.3细胞 pBMECs细胞 C57BL/6小鼠感染模型
SC19、ΔpotD、CΔpotD菌株感染MOI=10,处理2小时 重组His-PotD浓度20和40 μg/mL,处理2小时 重组GST–ADI浓度12.5至200 μg/mL,处理2小时 小鼠感染剂量:2×10^8 CFU(生存实验),1×10^8 CFU(EB实验) 小鼠感染时间:48小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PotD和ADI在猪链球菌致病性中的功能。
通过同源重组在SC19背景上构建ΔpotD、ΔarcA及回补菌株CΔpotD、CΔarcA,并经PCR和测序验证。
检测potD缺失对细菌生长和生物膜形成的影响。
测定SC19、ΔpotD、CΔpotD的生长曲线(OD600和CFU计数),并用结晶紫染色定量生物膜。
评估PotD对猪链球菌体内致病性的影响。
小鼠腹腔注射SC19、ΔpotD、CΔpotD,监测7天生存率,感染48小时后检测各组织细菌载量和脑组织病理。
检测PotD对猪链球菌诱导的BBB破坏的影响。
体外感染脑微血管内皮细胞检测ZO-1和Occludin表达;体内使用EB染色和H&E染色评估BBB通透性和脑组织病理。
鉴定与PotD互作的蛋白。
重组His-PotD与SC19总可溶蛋白共孵育,经SDS-PAGE和LC-MS分析,筛选出包括ADI在内的候选蛋白。
验证PotD与ADI互作及其对arcA转录的影响。
GST pull-down实验验证PotD与ADI互作,分子对接预测结合模式;RT-qPCR检测arcA、arcB、arcC在SC19、ΔpotD、CΔpotD中的mRNA水平。
验证ADI是否参与猪链球菌诱导的BBB破坏。
感染ΔarcA或重组GST-ADI刺激hCMEC/D3细胞,检测ZO-1和Occludin表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | Todd-Hewitt肉汤 | OXOID | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA纯化树脂 | Vazyme | -- |
| BeyoGold™ GST标签纯化树脂 | Beyotime | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Vazyme | -- |
| 菌株构建 | Bio-Rad Gene Pulser Xcell系统 | Bio-Rad | -- |
| RT-qPCR | CFX96 Touch实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白表达诱导 | 异丙基β-D-1-硫代半乳糖苷 | BBI | -- |
| 生物膜形成 | 结晶紫 | BBI | -- |
| 动物实验 | 伊文思蓝 | BBI | -- |
| 福尔马林 | BBI | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌培养与感染 | 菌株(SC19、ΔpotD、CΔpotD、ΔarcA、CΔarcA)、MOI=10、感染时间2小时 阅读提示:见Materials and methods中“Bacterial strains, cell line, and culture conditions”和“S. suis infection and protein stimulation in cells” |
| 蛋白刺激 | 重组蛋白His-PotD浓度20、40 μg/mL,GST–ADI浓度12.5、25、50、100、200 μg/mL,处理2小时 阅读提示:见Materials and methods中“S. suis infection and protein stimulation in cells” |
| 动物感染模型 | 小鼠品系(C57BL/6雌性)、感染剂量(生存实验2×10^8 CFU,EB实验1×10^8 CFU)、感染时间48小时、每组动物数(n=3或8) 阅读提示:见Materials and methods中“Bacterial infection in vivo”和“Evans blue blood–brain barrier permeability assay in vivo” |
| BBB通透性检测 | EB注射量(200 μL 1% EB)、循环时间(2小时)、脑组织匀浆及甲酰胺提取条件、632 nm吸光度测定 阅读提示:见Materials and methods中“Evans blue blood–brain barrier permeability assay in vivo” |
| 蛋白互作验证 | GST-ADI与His-PotD用量(GST/ GST-ADI 10 μg,His-PotD 20 μg)、共孵育条件(4°C过夜) 阅读提示:见Materials and methods中“GST affinity-isolation assay” |