建立模型
构建携带HIF-2α突变的动物和细胞模型,以研究该突变对代谢的影响。
利用胚胎干细胞基因打靶技术建立HIF-2α突变(C57BL/6)小鼠,并构建携带野生型或突变HIF-2α的THLE-2和HEK293细胞系。
A Somatic Mutation in HIF-2α Affects Glucose and Lipid Metabolism via CD36 and Ceramide.
包含动物模型、细胞模型、转录组测序、脂质组学、功能验证(IPGTT、组织染色)和机制验证(Co-IP、Western blot)等多个证据层级。
C57BL/6小鼠模型(HIF-2α突变敲入) THLE-2细胞系 HEK293细胞系
HIF-2α突变(c.C2473T,p.R825W) 小鼠模型:C57BL/6,6-8周龄,HFD或SCD喂养12周 IPGTT:葡萄糖2 g/kg腹腔注射,测量0-120分钟 CD36表达:qRT-PCR和Western blot 神经酰胺水平:脂质组学分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建携带HIF-2α突变的动物和细胞模型,以研究该突变对代谢的影响。
利用胚胎干细胞基因打靶技术建立HIF-2α突变(C57BL/6)小鼠,并构建携带野生型或突变HIF-2α的THLE-2和HEK293细胞系。
评估HIF-2α突变对小鼠葡萄糖和脂质代谢表型的影响。
对小鼠进行IPGTT、检测空腹胰岛素、肝脏糖原染色、血脂和肝脏脂质分析。
识别突变小鼠肝脏中差异表达基因和脂质变化,以揭示潜在机制。
对肝脏进行转录组测序和脂质组学分析,鉴定差异表达基因和神经酰胺谱变化。
验证突变对HIF-2α反式激活活性和CD36表达的影响。
通过Co-IP检测HIF-2α与FIH/P300的结合,Western blot检测CD36蛋白水平。
确定神经酰胺在介导代谢紊乱中的作用。
使用神经酰胺合成抑制剂myriocin处理小鼠和细胞,评估其对葡萄糖和脂质代谢的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| THLE-2专用培养基 | Procell | -- | |
| 嘌呤霉素 | Sangon Biotech | -- | |
| 动物实验 | 高脂饮食 | Research Diets | -- |
| IPGTT | 葡萄糖 | Sigma | -- |
| 磷酸盐缓冲液 | Bio-Channel | -- | |
| qRT-PCR | DEPC处理水 | Sangon Biotech | -- |
| Western blot | 预制胶 | GenScript | -- |
| 电泳缓冲液 | GenScript | -- | |
| 蛋白分子量标准 | Thermo Fisher | -- | |
| PVDF膜 | Merck-Millipore | -- | |
| 转膜缓冲液 | GenScript | -- | |
| 油红O染色 | 油红O染色试剂盒 | Jiancheng | -- |
| 糖原染色 | Schiff染色液 | Solarbio | -- |
| 转录组测序 | VAHTS Universal V6 RNA-seq文库制备试剂盒 | -- | -- |
| Illumina NovaSeq 6000平台 | Illumina | -- | |
| 脂质组学分析 | Analyst 1.6.3 | -- | -- |
| 药物处理 | 麦考酚酸 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 模型构建方法、基因型、年龄、性别、饮食方案和持续时间。 阅读提示:见Methods:Animals |
| 细胞模型 | 细胞类型、培养基、转染方法、筛选方法、处理条件(FFA)。 阅读提示:见Methods:Cell Culture |
| IPGTT | 禁食时间、葡萄糖剂量、给药途径、取血时间点。 阅读提示:见Methods:Intraperitoneal Glucose Tolerance Test |
| 转录组测序 | RNA提取方法、建库试剂盒、测序平台、差异表达基因阈值。 阅读提示:见Methods:Transcriptome Sequencing |
| 脂质组学分析 | 样品制备、内标使用、仪器参数、数据分析软件。 阅读提示:见Methods:Lipidomics Analysis |