细胞和动物模型中嘌呤代谢轮廓分析
明确I/R诱导的AKI中嘌呤代谢是否发生紊乱以及分解代谢是否增强。
对正常和H/R处理的HK-2细胞、假手术和I/R小鼠肾组织进行代谢组学分析,比较嘌呤代谢物水平。
Ameliorating Acute Kidney Injury Induced by Ischemia-Reperfusion by Targeting Purine Metabolism.
包含细胞实验(HK-2 H/R模型,观察XO表达、凋亡、ROS)、动物实验(小鼠肾I/R模型,观察组织损伤和XO表达)、临床数据分析(377例AKI患者,相关性分析和随机森林模型),三个独立证据层级且包含功能验证和机制验证。
人肾近端小管上皮细胞系HK-2 C57BL/6小鼠肾缺血再灌注模型 AKI患者临床队列(377例)
HK-2细胞H/R模型:低氧24 h,复氧3 h 非布司他预处理浓度:100 μM 小鼠肾I/R模型:双侧肾动脉夹闭45 min,再灌注24 h 临床队列:377例住院期间发生AKI的患者
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确I/R诱导的AKI中嘌呤代谢是否发生紊乱以及分解代谢是否增强。
对正常和H/R处理的HK-2细胞、假手术和I/R小鼠肾组织进行代谢组学分析,比较嘌呤代谢物水平。
验证在I/R损伤和H/R处理后XO表达是否上调。
通过Western blot检测HK-2细胞复氧后3、12、24 h的XO表达,通过免疫组化染色检测I/R小鼠肾组织XO表达,并通过HE染色评估肾小管损伤。
评估AKI患者血清UA与eGFR和LDH的相关性,并构建eGFR预测模型。
收集377例AKI患者临床数据,分析UA与eGFR、LDH的相关性,使用随机森林模型基于UA、LDH、年龄、糖尿病和高血压预测eGFR。
验证抑制XO是否能减轻H/R引起的肾小管上皮细胞损伤。
HK-2细胞以不同浓度非布司他预处理3 h后经受H/R处理,检测细胞增殖、UA、ROS、炎症因子(TNF-α、IL-1β、IL-6)水平,以及凋亡率和凋亡相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 非布司他 | MedChemExpress | -- |
| 磷酸盐缓冲液 | Boster | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Boster | AR1160 |
| RNA提取 | TRIgent试剂 | Mei5 Biotechnology | MF034 |
| 逆转录 | cDNA逆转录试剂盒 | Mei5 Biotechnology | MF949 |
| qRT-PCR | SYBR Green PCR试剂盒 | Mei5 Biotechnology | MF787 |
| Bio-Rad CFX96实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 抗cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 抗XO抗体 | Wanleibio | WL01013 | |
| 抗Bax抗体 | Wanleibio | WL01653 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Wanleibio | WL01556 | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| HRP标记二抗 | -- | -- | |
| ECL底物 | -- | -- | |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime | S003S |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Nanjing KeyGen Biotech | -- |
| 免疫组化 | 10%山羊血清 | -- | -- |
| 尼康光学显微镜 | Nikon | -- | |
| 代谢组学分析 | Agilent 1290 Infinity液相色谱系统 | Agilent | -- |
| AB Triple TOF 6600质谱仪 | AB SCIEX | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与H/R模型 | HK-2细胞来源;培养条件(MEM+5%FBS,37°C,5%CO2);缺氧条件(5%CO2, 1%O2, 94%N2)持续24 h;复氧条件(正常培养)持续3 h。 阅读提示:Materials and Methods 4.1 Cell Culture and Treatment |
| 非布司他处理 | 非布司他浓度(100 μM)和预处理时间(3 h);溶剂对照(PBS)。 阅读提示:Materials and Methods 4.1 Cell Culture and Treatment;Results 2.4 |
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6,雄性,6-8周龄);缺血时间(45 min)和再灌注时间(24 h);样本量(n=6);麻醉方法(戊巴比妥钠腹腔注射)。 阅读提示:Materials and Methods 4.7 Animal Model |
| 临床数据分析 | AKI诊断标准(KDIGO);纳入排除标准;UA与eGFR及LDH相关性分析方法(Pearson和偏相关);随机森林特征(UA, LDH, age, diabetes, hypertension)。 阅读提示:Materials and Methods 4.12 Study Population and Design, 4.13 Clinical and Laboratory Data, 4.15 Statistical Analysis |