RA大鼠模型建立与USP5敲低效果评估
验证USP5在RA进展和糖酵解中的作用
使用牛II型胶原和弗氏不完全佐剂建立CIA大鼠模型,通过腺病毒介导sh-USP5敲低,评估滑膜病理、关节炎评分、爪厚度、Vimentin/USP5/GLUT1表达和血清乳酸水平。
USP5 promotes glycolysis of fibroblast-like synoviocytes by stabilizing the METTL14/m6A/GLUT1 axis in rheumatoid arthritis.
包含体内RA大鼠模型、体外RA-FLS细胞实验、机制验证(Co-IP、泛素化、MeRIP、双荧光素酶)及临床样本分析,多个证据层级。
胶原诱导关节炎(CIA)大鼠模型 TNF-α刺激的人RA-FLSs(Pricella CP-H248) 人RA滑膜组织和正常对照组织
RA大鼠模型:bovine type II collagen (Chondrex)与Freund's incomplete adjuvant (Sigma-Aldrich)乳化后尾根部皮内注射,第7天加强免疫,第35天处死 腺病毒介导的sh-USP5(1×10^8 PFU)注射到踝关节滑膜 TNF-α处理RA-FLSs浓度10 ng/mL,2-DG处理浓度5 mM,处理24小时 RA-FLSs转染shRNA(100 nM)或pcDNA3.1(30 nM)使用Lipofectamine 3000 METTL14敲低后GLUT1 mRNA稳定性实验使用actinomycin D(5 µg/mL)处理0、4、8小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证USP5在RA进展和糖酵解中的作用
使用牛II型胶原和弗氏不完全佐剂建立CIA大鼠模型,通过腺病毒介导sh-USP5敲低,评估滑膜病理、关节炎评分、爪厚度、Vimentin/USP5/GLUT1表达和血清乳酸水平。
验证USP5通过调控糖酵解影响RA-FLSs的增殖、凋亡、迁移、侵袭和炎症因子产生
使用TNF-α刺激RA-FLSs模拟炎症环境,通过USP5敲低或2-DG处理,检测细胞活力、凋亡、迁移、侵袭、炎症因子、葡萄糖摄取、乳酸产生、GLUT1表达和ECAR。
验证USP5通过抑制泛素化稳定METTL14
通过Western blot检测METTL14表达,Co-IP验证相互作用,泛素化实验检测METTL14泛素化水平,CHX追踪实验检测蛋白稳定性。
验证METTL14是USP5调控RA-FLSs糖酵解和活化的关键下游分子
在TNF-α刺激的RA-FLSs中,通过USP5敲低和METTL14过表达,检测细胞活力、凋亡、迁移、侵袭、炎症因子、葡萄糖摄取、乳酸水平、METTL14和GLUT1表达及ECAR。
验证METTL14通过m6A修饰GLUT1 mRNA影响其表达和稳定性
使用SRAMP预测m6A位点,通过qPCR检测GLUT1表达,MeRIP检测m6A修饰,mRNA稳定性实验(actinomycin D),双荧光素酶报告基因验证位点。
验证METTL14通过GLUT1调控RA-FLSs的糖酵解和活化
在TNF-α刺激的RA-FLSs中,通过METTL14敲低和GLUT1过表达,检测细胞活力、凋亡、迁移、侵袭、炎症因子、葡萄糖摄取、乳酸水平、GLUT1表达和ECAR。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 牛II型胶原 | Chondrex | -- |
| 弗氏不完全佐剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 动物模型与细胞处理 | 携带shRNA的腺病毒载体 | Hanbio | -- |
| 免疫荧光 | 抗GLUT1抗体 | Abcam | ab115730 |
| 抗USP5抗体 | Abcam | ab154170 | |
| 抗Vimentin抗体 | Abcam | ab92547 | |
| DAPI | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞培养 | RA-FLSs细胞系 | Pricella Biotech | CP-H248 |
| 专用培养基 | Pricella | CM-H248 | |
| 细胞处理 | 肿瘤坏死因子-α | Sigma-Aldrich | -- |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 转染 | pcDNA3.1载体 | RiboBio | -- |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录试剂盒 | TaKaRa Bio | -- | |
| SYBR Green预混液 | TaKaRa Bio | -- | |
| ABI 7500 Fast实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Beyotime | -- | |
| 抗METTL14抗体 | Abcam | ab308576 | |
| 抗USP5抗体 | Abcam | ab154170 | |
| 抗GLUT1抗体 | Abcam | ab115730 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8227 | |
| 辣根过氧化物酶标记的二抗 | Abcam | ab6721 | |
| 增强化学发光检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| CCK-8 | CCK-8检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| BioTek酶标仪 | BioTek | -- | |
| Transwell | Transwell小室 | Cornin | -- |
| 基质胶 | Corning | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | BioLegend | -- |
| 流式细胞仪 | BD | FACSCanto | |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H6156 |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0149 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0109 | |
| Seahorse分析 | Seahorse XF糖酵解压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | -- |
| Seahorse XF-96分析仪 | Seahorse Bioscience | -- | |
| 代谢检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Applygen | E1011 |
| 乳酸检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K044-M | |
| 免疫共沉淀 | 抗USP5抗体(免疫沉淀用) | Abcam | ab241311 |
| 抗METTL14抗体(免疫沉淀用) | Abcam | ab309096 | |
| 对照IgG | Abcam | ab172730 | |
| 蛋白A/G磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 泛素化实验 | 抗泛素抗体 | Abcam | ab134953 |
| MeRIP | m6A特异性抗体 | Synaptic Systems | 202003 |
| 双荧光素酶报告实验 | pmirGLO荧光素酶报告载体 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | CIA大鼠模型建立:牛II型胶原与弗氏不完全佐剂乳化,尾根部皮内注射,第7天加强免疫;sh-USP5腺病毒(1×10^8 PFU)注射踝关节滑膜;第35天处死。 阅读提示:Materials and methods: Animal model and treatment |
| 细胞培养与处理 | RA-FLSs(Pricella CP-H248)培养条件;TNF-α(10 ng/mL)或2-DG(5 mM)处理24小时。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment |
| 细胞转染 | shRNA(100 nM)或pcDNA3.1(30 nM)使用Lipofectamine 3000转染,转染效率48小时后验证。 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection |
| 功能实验 | CCK-8、凋亡、Transwell、ELISA、葡萄糖摄取和乳酸检测、ECAR的具体条件。 阅读提示:Materials and methods: CCK-8 assay, Transwell assay, Apoptosis detection, ELISA, Seahorse analysis |
| 机制实验 | Co-IP、泛素化、MeRIP、双荧光素酶、CHX chase的具体条件,包括抗体和试剂。 阅读提示:Materials and methods: Co-immunoprecipitation, Ubiquitination assay, Methylated RNA immunoprecipitation, Dual-luciferase reporter assay, Cycloheximide chase assay |
| 统计分析 | 数据展示为mean±SD,至少三次独立重复;动物每组6只;组间比较用one-way ANOVA或t检验。 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |