CSE处理与线粒体功能检测
评估CSE对BEAS-2B细胞线粒体膜电位和ROS的影响
用不同浓度CSE处理BEAS-2B细胞,通过JC-1染色检测膜电位,MitoSOX Red染色检测ROS。
Involvement of mitochondrial unfolded protein response and activating transcription factor 4 in the mitochondrial damage pathway of BEAS-2B cells induced by cigarette smoke extracts.
包含体外细胞实验(线粒体功能、ROS检测、WB、免疫荧光)及转录组分析,但缺乏功能验证(如敲低或过表达)和体内实验。
BEAS-2B人支气管上皮细胞
CSE浓度:10 μg/mL和20 μg/mL CSE处理时间:2、4、8、12小时 线粒体膜电位检测:JC-1染色 线粒体ROS检测:MitoSOX Red染色 对照组设置:未处理细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CSE对BEAS-2B细胞线粒体膜电位和ROS的影响
用不同浓度CSE处理BEAS-2B细胞,通过JC-1染色检测膜电位,MitoSOX Red染色检测ROS。
鉴定CSE处理后的基因表达变化和相关信号通路
对CSE处理细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因和KEGG通路。
验证Tim23和ATF-4蛋白水平的变化
用Western blot和免疫荧光检测CSE处理后Tim23和ATF-4的表达和定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | BEAS-2B细胞 | Pricella | -- |
| 香烟提取物 | Murty Pharmaceuticals | -- | |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| Western blot | 抗ATF-4抗体(10835) | Proteintech | 10835 |
| 抗Tim23抗体(67535) | Proteintech | 67535 | |
| 免疫荧光 | 抗Alexa Fluor 488抗体 | Proteintech | -- |
| 线粒体标记 | MitoTracker Red CMXRos | Thermo | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL化学发光试剂 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | -- | -- |
| RNeasy Mini试剂盒 | -- | -- | |
| Lexogen mRNA Sense试剂盒 | -- | -- | |
| Ion Torrent Proton测序仪 | -- | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism 9.0软件 | -- | -- |
| ImageJ软件 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 激光共聚焦显微镜(LEICA TCS SP8) | LEICA | TCS SP8 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与CSE处理 | CSE浓度、处理时间、细胞密度、培养条件 阅读提示:Methods: CSE preparation; Cell culture and passaging |
| 线粒体功能检测 | JC-1染色条件、MitoSOX Red染色浓度和时间 阅读提示:Methods: Detection of mitochondrial ROS; Results: Figure legends |
| 蛋白表达检测 | 抗体稀释比例、孵育时间、蛋白上样量 阅读提示:Methods: Western blot; Figure legends |
| RNA-seq分析 | RNA提取、文库构建、测序深度、差异表达基因筛选标准 阅读提示:Results: RNA-seq to detect gene expression after CSE action; Supplementary Methods |