miR-4701-3p表达检测
明确miR-4701-3p在NSCLC组织和细胞系中的表达差异。
采用RT-qPCR检测105例NSCLC患者癌组织和癌旁组织中miR-4701-3p表达,并检测四种NSCLC细胞系(A549、H460、H1299、MES-1)和正常肺上皮细胞BEAS-2B中的表达。
MiR-4701-3p predicts prognosis of non-small cell lung cancer and regulates cell biological behaviors.
包含临床样本表达分析、细胞系功能验证(CCK-8、Transwell、流式凋亡)和预后分析,但缺乏动物模型及机制验证。
NSCLC患者组织样本队列 A549细胞系 H1299细胞系
患者纳入标准:未接受过放化疗或手术,病理确诊,可评估病灶 细胞系:A549和H1299,转染miR-4701-3p抑制剂或模拟物,浓度50 nM 转染后48小时进行后续实验,包括CCK-8、Transwell迁移/侵袭、凋亡检测 5年生存率随访终点:死亡或复发,随访至2024年12月
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确miR-4701-3p在NSCLC组织和细胞系中的表达差异。
采用RT-qPCR检测105例NSCLC患者癌组织和癌旁组织中miR-4701-3p表达,并检测四种NSCLC细胞系(A549、H460、H1299、MES-1)和正常肺上皮细胞BEAS-2B中的表达。
评估miR-4701-3p表达与NSCLC患者临床特征及5年生存率的关系。
根据miR-4701-3p平均相对表达水平(1.43)将患者分为低表达和高表达组,采用χ2检验分析其与临床特征的相关性,采用Kaplan-Meier曲线和Cox回归分析评估预后价值。
验证miR-4701-3p对NSCLC细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的调控作用。
在A549和H1299细胞中分别转染miR-4701-3p抑制剂或模拟物,通过CCK-8、Transwell迁移/侵袭实验和流式细胞凋亡检测评估细胞功能变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| miR-4701-3p抑制剂 | GenePharma | -- | |
| miR-4701-3p模拟物 | GenePharma | -- | |
| 阴性对照 | GenePharma | -- | |
| CCK-8实验 | CCK-8试剂 | Dojindo | -- |
| Transwell迁移实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| Transwell侵袭实验 | Matrigel基质胶 | BD Biosciences | -- |
| Transwell迁移和侵袭实验 | 结晶紫溶液 | Beyotime | -- |
| 凋亡检测 | 细胞凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| Annexin-V FITC | Beyotime | -- | |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Merck | -- |
| RNA定量 | NanoDrop分光光度计 | -- | -- |
| 反转录 | PrimeScript™ RT试剂盒 | Takara Bio | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green PCR预混液 | Takara Bio | -- |
| 96孔PCR板 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集 | 患者纳入标准(未接受治疗、可评估病灶、病理确诊、可手术);样本采集为癌组织和距肿瘤边缘>2cm的癌旁组织;保存条件:液氮速冻后-80°C。 阅读提示:Materials and methods - Study subjects 和 Clinical data collection and tissue sample acquisition |
| 细胞培养 | 细胞系A549、H460、H1299、MES-1和BEAS-2B的来源;培养基RPMI-1640和10% FBS;培养条件:37°C、5% CO2。 阅读提示:Materials and methods - Cell culture |
| 细胞转染 | 转染试剂Lipofectamine 3000用量(2.5 µL/mL);miRNA抑制剂/模拟物终浓度50 nM;转染时间48小时。 阅读提示:Materials and methods - Cell transfection |
| 细胞功能实验 | CCK-8检测时间点(0、24、48、72h)和OD450测定;Transwell迁移细胞数4×10^5/孔,侵袭细胞数8×10^5/孔,预包被Matrigel;凋亡检测使用Annexin-V FITC和PI染色,流式细胞仪检测。 阅读提示:Materials and methods - CCK-8 assay, Transwell migration assay, Transwell invasion assay, Apoptosis assay |
| 预后分析 | 随访周期5年,死亡为终点;miR-4701-3p高/低分组依据平均表达水平1.43;统计方法:χ2检验、Kaplan-Meier、Cox回归。 阅读提示:Materials and methods - Follow-up 和 Statistical methods, 及 Results |