CYP制备与单糖组成分析
获取CYP并确定其单糖组成,为后续活性研究提供材料基础。
采用热水提取、乙醇沉淀、Sevag法脱蛋白制备CYP,通过PMP柱前衍生化HPLC分析单糖组成。
Chinese Yam Polysaccharide Ameliorates Obesity by Promoting Lipolysis Via the cAMP/PKA Signaling Pathway.
包含体外OP9细胞实验、体内斑马鱼模型及网络药理学、分子对接和Western blot验证,多层次实验支持结论。
OP9小鼠骨髓基质细胞 斑马鱼肥胖模型
CYP浓度:0、5、25、125 µg/mL 处理时间:24、48、72小时(细胞);斑马鱼5 dpf 斑马鱼肥胖模型:2 g/L蛋黄溶液处理72小时 斑马鱼分组:4组,CYP浓度与细胞实验一致 统计分析:Student's t-test或单因素方差分析,p<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取CYP并确定其单糖组成,为后续活性研究提供材料基础。
采用热水提取、乙醇沉淀、Sevag法脱蛋白制备CYP,通过PMP柱前衍生化HPLC分析单糖组成。
评估CYP对OP9细胞的毒性,确定安全浓度范围。
用CCK-8法检测不同浓度CYP处理OP9细胞后的活力。
验证CYP在OP9细胞中的促脂肪分解作用。
采用油红O染色和甘油释放检测评估CYP对脂肪分解的影响。
检测CYP处理对脂滴包被蛋白PLIN1表达的影响。
CYP处理OP9细胞后,用PLIN1抗体免疫荧光染色,观察荧光强度和数量。
验证CYP对脂肪分解相关蛋白表达水平的影响。
CYP处理OP9细胞后,提取蛋白,Western blot检测PPAR-γ、PLIN1、ATGL、HSL、p-HSL等蛋白表达。
评估CYP在体内对肥胖斑马鱼脂质积累的影响。
建立斑马鱼肥胖模型,CYP处理后油红O染色观察肠道脂质积累。
预测CYP抗肥胖的潜在靶点和信号通路。
利用SwissTargetPrediction预测CYP活性成分靶点,GeneCards和OMIM获取肥胖相关靶点,Venn分析获得交集靶点,构建PPI网络,进行GO和KEGG富集分析。
验证CYP活性成分与核心靶点STAT3的结合亲和力。
使用CDOCKER方法将CYP活性成分与STAT3蛋白进行分子对接,计算结合能。
验证CYP是否通过STAT3和cAMP/PKA通路发挥作用。
CYP处理OP9细胞后,Western blot检测p-STAT3、STAT3、cAMP和PKA的表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| CYP制备 | 冷冻干燥机 | BUCHI | -- |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Gibco | -- |
| MEM-α培养基 | Gibco | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| 免疫荧光 | 含DAPI的抗淬灭封片剂 | Beyotime | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 油红O染色 | 油红O染色试剂盒 | Solarbio | -- |
| Western blot | PPAR-γ抗体 | Signalway Antibody | -- |
| ATGL抗体 | Signalway Antibody | -- | |
| HSL抗体 | Signalway Antibody | -- | |
| p-HSL抗体 | Signalway Antibody | -- | |
| β-actin抗体 | Signalway Antibody | -- | |
| 免疫荧光/ Western blot | PLIN1抗体 | Abcam | AB3526 |
| Western blot | p-STAT3抗体 | Abcam | -- |
| STAT3抗体 | Abcam | -- | |
| cAMP抗体 | Abcam | -- | |
| PKA抗体 | Abcam | -- | |
| 细胞培养 | OP9小鼠骨髓基质细胞 | Wuhan Pricella Biotechnology | -- |
| 免疫荧光 | 二抗 | Beyotime | A0423 |
| 细胞活力检测 | 酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 油红O染色/斑马鱼实验 | 体视显微镜 | SOPTOP | -- |
| 斑马鱼实验 | 三卡因甲磺酸盐 | Sigma | 06804JE |
| 免疫荧光 | 共聚焦激光扫描显微镜 | Leica Biosystems | -- |
| Western blot | ECL检测系统 | Beyotime | -- |
| 分子对接 | Discovery Studio 2019软件 | -- | -- |
| PyMOL 2.5软件 | -- | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 10.1.2软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CYP制备 | 提取条件:95%乙醇脱脂、水提温度、时间、料液比;醇沉倍数;脱蛋白方法;冻干条件 阅读提示:Experimental Section 4.2 |
| 单糖组成分析 | 水解条件(TFA浓度、温度、时间);PMP衍生化条件;HPLC色谱条件和标准品 阅读提示:Experimental Section 4.3 |
| 细胞活力检测 | 细胞系、接种密度、CYP浓度范围、处理时间、CCK-8孵育时间、检测波长 阅读提示:Experimental Section 4.4 |
| 体外脂肪分解活性评估 | 成脂诱导条件(培养基、诱导剂浓度、时间);CYP处理浓度和时间;油红O染色和甘油检测的具体操作 阅读提示:Experimental Section 4.5和4.6 |
| 免疫荧光检测PLIN1 | CYP浓度和处理时间;固定、透化、封闭条件;一抗和二抗稀释比及孵育时间;显微镜型号 阅读提示:Experimental Section 4.7 |
| Western blot分析 | 细胞处理条件;蛋白提取方法;SDS-PAGE凝胶浓度;转膜条件;抗体稀释比和孵育时间;检测系统 阅读提示:Experimental Section 4.8 |
| 斑马鱼肥胖模型 | 斑马鱼品系;蛋黄溶液浓度和处理时间;CYP浓度和处理时间;MS-222麻醉浓度;固定和染色条件 阅读提示:Experimental Section 4.9 |
| 网络药理学分析 | 活性成分靶点预测数据库及参数;肥胖靶点数据库及关键词;交集靶点筛选标准;PPI网络构建软件及参数;GO和KEGG富集分析平台 阅读提示:Experimental Section 4.10 |
| 分子对接 | 靶蛋白PDB ID;预处理步骤;CDOCKER参数;打分函数 阅读提示:Experimental Section 4.11 |