临床样本收集与miR-188-5p表达检测
评估miR-188-5p在IA患者中的表达水平及其诊断价值。
收集73例IA患者和79例健康对照的血清样本,通过qRT-PCR检测miR-188-5p表达,并进行ROC分析和Logistic回归。
The diagnostic and prognostic value of miR-188-5p in intracranial aneurysm (IA) and its potential regulatory mechanism.
包含临床样本检测、体外细胞模型、双荧光素酶报告实验和功能验证,但缺乏动物模型和体内验证。
颅内动脉瘤患者血清样本 PDGF-BB诱导的血管平滑肌细胞去分化模型 人血管平滑肌细胞(HVSMCs)
患者与对照组样本量:73例IA患者和79例健康对照 PDGF-BB浓度:20 ng/mL用于诱导VSMC表型转换 miR-188-5p相对表达水平:诊断截断值1.28,预测破裂截断值1.43 双荧光素酶报告实验采用wt-IL6ST和mut-IL6ST载体
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估miR-188-5p在IA患者中的表达水平及其诊断价值。
收集73例IA患者和79例健康对照的血清样本,通过qRT-PCR检测miR-188-5p表达,并进行ROC分析和Logistic回归。
研究miR-188-5p在VSMC表型转换和功能损伤中的作用。
使用20 ng/mL PDGF-BB诱导HVSMC去分化,并转染miR-188-5p inhibitor或inhibitor NC,检测VSMC标志物、基质金属蛋白酶、氧化应激和炎症因子表达。
验证miR-188-5p是否直接靶向IL6ST并负调控其表达。
通过TargetScan预测结合位点,双荧光素酶报告实验验证,并在PDGF-BB诱导的VSMC中检测miR-188-5p对IL6ST表达的影响。
验证IL6ST在miR-188-5p影响VSMC功能中的介导作用。
在PDGF-BB诱导的VSMC中,通过si-IL6ST敲低IL6ST,观察miR-188-5p inhibitor对VSMC功能的影响是否被逆转。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与处理 | CM-H116平滑肌生长培养基 | Pricella, China | -- |
| 血小板衍生生长因子BB | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen, USA | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen, USA | -- |
| 氯仿 | -- | -- | |
| 异丙醇 | -- | -- | |
| 75%乙醇 | -- | -- | |
| 无RNA酶DNase I | -- | -- | |
| RT-qPCR | Hieff Unicon® V通用多重一步法RT-qPCR探针试剂盒 | YEASEN, China | -- |
| miR-188-5p、IL6ST、α-SMA、SM22α、MMP-2、MMP-9、IL-1β、IL-18、TNF-α、RNU6-1和GAPDH的引物 | -- | -- | |
| 双荧光素酶报告实验 | pmirGLO双荧光素酶报告载体(wt-IL6ST、mut-IL6ST) | -- | -- |
| 抗氧化活性检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime, China | -- |
| 总超氧化物歧化酶检测试剂盒(WST-8法) | Beyotime, China | -- | |
| RNA定量 | NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 荧光素酶活性检测 | Multiskan FC酶标仪 | Thermo Fisher Scientific, USA | -- |
| RT-qPCR | MX3000P实时荧光定量PCR仪 | Stratagene, Germany | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 患者和对照组样本量、年龄、性别、BMI、吸烟、饮酒等基线特征 阅读提示:Materials and methods, 临床样本和细胞, Table 1 |
| 细胞模型 | HVSMC细胞系、培养基、PDGF-BB浓度(20 ng/mL) 阅读提示:Materials and methods, 临床样本和细胞 |
| 细胞转染 | 使用Lipofectamine 3000,转染的核酸(miR-188-5p inhibitor, inhibitor NC, si-IL6ST, si-NC) 阅读提示:Materials and methods, 临床样本和细胞 |
| 双荧光素酶报告实验 | 载体构建(wt-IL6ST和mut-IL6ST),共转染miR-188-5p mimics或inhibitor等 阅读提示:Materials and methods, The detection of the relationship between miR-188-5p and si-IL6ST |
| RT-qPCR | 引物序列、反应条件(预变性94°C 5分钟,变性94°C 20秒,退火延伸62°C 40秒,40个循环),内参(RNU6-1用于miRNA,GAPDH用于mRNA) 阅读提示:Materials and methods, Quantitative real-time PCR |
| 氧化应激检测 | MDA检测试剂盒、SOD检测试剂盒的型号和来源 阅读提示:Materials and methods, Antioxidant activity assay |