建立胶质瘤条件培养基诱导的小胶质细胞活化模型
模拟胶质瘤微环境中可溶性促炎信号对小胶质细胞的活化作用,并加入R-2HG模拟IDH突变胶质瘤的旁分泌效应。
收集GL261或ALTS1C1胶质瘤细胞的条件培养基,处理BV2细胞或原代小胶质细胞,同时给予R-2HG(20 mM)处理,通过qPCR和ELISA检测炎症因子表达。
The oncometabolite R-2-hydroxyglutarate inhibits microglial activation via the FTO/NF-κB pathway.
包含体外细胞模型(BV2、原代小胶质细胞)、机制验证(NF-κB通路、FTO抑制剂)、功能验证(ELISA、qPCR、Western blot)及挽救实验。
BV2小胶质细胞系 小鼠原代小胶质细胞 GL261和ALTS1C1胶质瘤细胞条件培养基模型
R-2HG浓度:20 mM α-酮戊二酸浓度:0.2、1、5 mM FTO抑制剂FB23-2浓度:5 μM 处理时间:mRNA检测6小时,蛋白检测24小时 样本量:n=3,三次独立实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟胶质瘤微环境中可溶性促炎信号对小胶质细胞的活化作用,并加入R-2HG模拟IDH突变胶质瘤的旁分泌效应。
收集GL261或ALTS1C1胶质瘤细胞的条件培养基,处理BV2细胞或原代小胶质细胞,同时给予R-2HG(20 mM)处理,通过qPCR和ELISA检测炎症因子表达。
确定R-2HG抑制IL-6转录是通过哪条转录因子通路介导的。
使用IL-6转录因子抑制剂(NF-κB抑制剂BAY11-7082和JSH-23,MEK抑制剂selumetinib,CREB抑制剂666-15,AP-1抑制剂SR11302)处理CM激活的BV2细胞,检测IL-6表达;并检测R-2HG与NF-κB抑制剂联合处理的效果。
验证R-2HG是否通过抑制NF-κB通路(p65磷酸化、核转位)来抑制IL-6表达。
通过Western blot检测p65、p-p65、IκBα、p-IκBα水平;通过核质分离和免疫荧光检测p65核转位。
验证R-2HG是否通过竞争α-KG来发挥抑制作用,并确定其下游靶酶。
在R-2HG处理的BV2细胞中加入不同浓度α-KG,检测IL-6表达和NF-κB通路磷酸化;使用多种α-KG依赖性酶抑制剂筛选,确定FTO为关键酶。
确认FTO是R-2HG抑制NF-κB/IL-6通路的关键靶点。
使用FTO抑制剂FB23-2处理CM激活的BV2细胞和原代小胶质细胞,检测IL-6表达和NF-κB磷酸化;并观察R-2HG与FB23-2联合处理的效果,以及α-KG补充能否逆转FTO抑制剂的作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| R-2HG处理 | TFMB-R-2HG | Sigma | -- |
| D-α-羟基戊二酸二钠盐 | Rhawn | R026713 | |
| LPS刺激 | 脂多糖 | Sigma | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | APExBIO | -- |
| NO检测 | 一氧化氮检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | 抗iNOS抗体 | Cell Signaling Technology | 13120S |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242S | |
| 抗磷酸化p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033S | |
| 抗IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 4812S | |
| 抗磷酸化IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 2859S | |
| 抗组蛋白H3抗体 | Cell Signaling Technology | 4499S | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Hangzhou Fude Biotechnology | FD0060 | |
| 免疫荧光 | FITC标记亲和纯化山羊抗兔IgG(H+L) | Proteintech | SA00003-2 |
| ELISA | 小鼠IL-6未包被ELISA试剂盒 | Invitrogen | 88-7064-77 |
| 小鼠TNFα未包被ELISA试剂盒 | Invitrogen | 88-7324-76 | |
| ELISA终止液 | Solarbio | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 抑制剂处理 | BAY 11-7082 | MedChemExpress | HY-13453 |
| JSH-23 | MedChemExpress | HY-13982 | |
| 666-15 | MedChemExpress | HY-101120 | |
| SR11302 | MedChemExpress | HY-15870 | |
| GSK-J4 | MedChemExpress | HY-15648B | |
| PFI-90 | MedChemExpress | HY-139348 | |
| KDM2/7-IN-1 (TC-E 5002) | MedChemExpress | HY-107573 | |
| Bobcat-339 | MedChemExpress | HY-111558 | |
| 司美替尼 | Selleck Chemicals | S1008 | |
| FB23-2 | Selleck Chemicals | S8837 | |
| 细胞培养 | 多聚-D-赖氨酸包被的培养瓶 | -- | -- |
| F12培养基 | Gibco | -- | |
| 木瓜蛋白酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | -- | |
| 40微米细胞筛网 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物片剂 | MedChemExpress | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| Tanon Chemi Dog 5200T成像仪 | Tanon | -- | |
| 免疫荧光 | 玻璃底细胞培养皿 | Nest | -- |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Olympus | -- | |
| 核质分离 | 核浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | -- |
| 细胞培养耗材 | 细胞培养耗材 | NEST | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| R-2HG处理 | R-2HG浓度:20 mM;处理时间:6小时(mRNA)、24小时(蛋白) 阅读提示:Materials and methods 2.1、Results 3.1 图注 |
| 条件培养基制备 | GL261或ALTS1C1细胞接种密度2.5×10^6,10 mL培养基,80%密度换液,培养12小时 阅读提示:Results 3.1 图1A图注 |
| NF-κB通路检测 | p65和IκBα磷酸化检测时间点:0、15、30、60分钟;核质分离方法 阅读提示:Results 3.2 图3图注 |
| α-KG补充实验 | α-KG浓度:0.2、1、5 mM;处理时间:6小时(mRNA)、24小时(蛋白) 阅读提示:Results 3.3 图4图注 |
| FTO抑制剂实验 | FB23-2浓度:5 μM;处理时间:6小时(mRNA)、24小时(蛋白) 阅读提示:Results 3.4 图5图注 |