临床样本分析
比较PE胎盘和正常胎盘中WTAP表达、m6A水平及组织病理差异。
收集20例正常和20例PE胎盘组织,通过qRT-PCR、Western blot、IHC检测WTAP表达,通过m6A试剂盒检测整体m6A水平,HE染色观察组织病理。
WTAP regulates NCOA4-mediated ferroptosis via a YTHDF2-dependent mechanism in preeclampsia.
包括细胞模型(HTR-8/SVneo)功能实验、机制验证(MeRIP/RIP)及PE小鼠模型体内验证,证据层级独立完整。
HTR-8/SVneo人绒毛外滋养层细胞系 L-NAME诱导的PE小鼠模型 人胎盘组织(正常妊娠和PE)
HTR-8/SVneo细胞系来源及培养条件(RPMI-1640+10% FBS) siRNA和过表达质粒转染效率验证(qRT-PCR和Western blot) MeRIP-qPCR和RIP-qPCR实验条件(抗体、磁珠) PE小鼠模型建立:L-NAME剂量(50 mg/kg/day)和给药时间(GD7-GD18) Fer-1处理浓度(体外5 μM,体内2 μmol/kg)及时间
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较PE胎盘和正常胎盘中WTAP表达、m6A水平及组织病理差异。
收集20例正常和20例PE胎盘组织,通过qRT-PCR、Western blot、IHC检测WTAP表达,通过m6A试剂盒检测整体m6A水平,HE染色观察组织病理。
探究WTAP和NCOA4对滋养层细胞增殖、迁移、侵袭、细胞周期和氧化应激的影响。
在HTR-8/SVneo细胞中敲低或过表达WTAP、NCOA4,通过CCK-8、Transwell、划痕实验、流式细胞术、ROS检测、Fe2+检测、Western blot和qRT-PCR评估。
验证WTAP是否通过m6A修饰和YTHDF2结合调控NCOA4 mRNA降解。
过表达或敲低WTAP后,通过MeRIP-qPCR检测NCOA4 mRNA m6A富集,通过RIP-qPCR检测YTHDF2结合,通过放线菌素D实验检测mRNA稳定性。
评估YTHDF2和NCOA4调节对PE小鼠模型血压、蛋白尿、胎儿发育和胎盘铁死亡的影响。
建立L-NAME诱导的PE小鼠模型,通过尾静脉注射siRNA或AAV-NCOA4-OE调节YTHDF2和NCOA4,部分小鼠腹腔注射Fer-1,测量收缩压、尿蛋白、胎儿体重,检测胎盘Fe2+、GSH/GSSG、ROS、IL-6及Nrf2/Gpx4表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Meilunbio | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Meilunbio | -- | |
| 胰酶-EDTA溶液 | Beyotime | -- | |
| 药物处理 | Ferrostatin-1 | MCE | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 | Thermo Fisher | -- |
| Opti-MEM培养基 | -- | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | Beyotime | -- |
| 酶标仪 | Thermo Fisher | -- | |
| 细胞迁移/侵袭检测 | Transwell小室 | -- | -- |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Meilunbio | -- |
| 免疫组化 | 抗WTAP抗体 | Proteintech | -- |
| 抗YTHDF2抗体 | ABclonal | -- | |
| 二抗 | ZSGB | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | -- | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 抗NCOA4抗体 | ABclonal | -- | |
| 抗NRF2抗体 | Abcam | -- | |
| 抗GPX4抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | -- | |
| HRP标记二抗 | ZSGB | -- | |
| ECL化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| 流式细胞术 | PI母液 | -- | -- |
| RNase A | -- | -- | |
| 流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| Fe2+检测 | CheKine™微量亚铁离子含量检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| m6A水平检测 | m6A RNA甲基化试剂盒 | Fankel | -- |
| IL-6检测 | 人IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
| RNA提取 | TRIzol Universal试剂 | TIANGEN | -- |
| Trizol试剂 | -- | -- | |
| DNase I | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA定量 | NanoDrop™分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | Hifair III第一链cDNA合成预混液 | YEASEN | -- |
| Hieff Fast Cell Direct Probe qRT-PCR试剂盒 | YEASEN | -- | |
| CFX96™实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| RNA-seq | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- |
| NanoDrop™ 2000分光光度计 | Thermo Fisher | -- | |
| RIP-qPCR | RIP检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| MeRIP-qPCR | m6A RNA免疫沉淀试剂盒 | Bersinbio | -- |
| 动物实验 | L-NAME | MedChemExpress | -- |
| 尾套血压计 | IITC | -- | |
| AAV-CMV-NCOA4过表达载体 | Genechem | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人胎盘组织收集 | 样本来源、PE诊断标准、样本量(正常20例,PE20例) 阅读提示:Materials and methods: Human placental specimen collection |
| 细胞培养与处理 | HTR-8/SVneo细胞系来源、培养条件(RPMI-1640+10% FBS)、Fer-1处理浓度(5 μM)和时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 细胞转染 | siRNA和质粒序列、转染试剂(Lipofectamine 2000)和用量、转染时间 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection |
| 机制验证实验 | MeRIP和RIP实验条件(抗体、磁珠)、放线菌素D浓度(5 µg/mL)和处理时间点(0,1,2,4,6小时) 阅读提示:Materials and methods: RIP-qPCR, MeRIP-qPCR, Actinomycin D |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、L-NAME剂量(50 mg/kg/day)和给药时间(GD7-GD18)、siRNA和AAV给药方式、Fer-1剂量(2 μmol/kg)和给药方案 阅读提示:Materials and methods: Animals |