体外细胞功能实验
评估TPL对SCLC细胞恶性特征(增殖、迁移、侵袭)的影响。
使用CCK-8、克隆形成、EdU、细胞周期和Transwell实验,分别检测TPL处理后H1688、H1339和H82细胞的活力、增殖、周期分布、迁移和侵袭能力。
Natural compound triptolide induces caspase-3/GSDME-mediated pyroptosis by promoting ROS accumulation in small cell lung cancer.
体外细胞功能实验、网络药理学分析、分子机制验证(Western blot、siRNA敲降、抑制剂)及体内异种移植模型,多层证据验证了机制。
NCI-H1688小细胞肺癌细胞系 NCI-H1339小细胞肺癌细胞系 NCI-H82小细胞肺癌细胞系 BALB/c nude小鼠异种移植模型(H1688细胞皮下接种)
TPL处理浓度(0-200 nM)及处理时间(12、24、48、72小时)影响细胞活力 TPL在H1688和H1339细胞中48小时的IC50值(12.37 nM和32.44 nM) GSDME敲降使用siRNA2,验证了GSDME在焦亡中的关键作用 CASP3抑制剂Z-DEVD-FMK和ROS抑制剂NAC的使用条件 体内实验中TPL剂量(0.5和1.0 mg/kg)及给药频率(隔天腹腔注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估TPL对SCLC细胞恶性特征(增殖、迁移、侵袭)的影响。
使用CCK-8、克隆形成、EdU、细胞周期和Transwell实验,分别检测TPL处理后H1688、H1339和H82细胞的活力、增殖、周期分布、迁移和侵袭能力。
预测TPL抗SCLC的潜在靶点和通路。
从TCMSP和GeneCards获取TPL靶点,GeneCards和OMIM获取SCLC相关靶点,取交集得到166个潜在靶点;进行GO和KEGG富集分析,构建PPI网络并筛选核心靶点。
验证TPL是否诱导SCLC细胞焦亡,并明确其分子机制。
通过Annexin V/PI流式、形态学观察、LDH释放实验、Western blot检测GSDME、GSDMD、CASP3、cleaved CASP3、CASP1表达;使用siRNA敲降GSDME、CASP3抑制剂Z-DEVD-FMK、ROS抑制剂NAC探究上游机制。
验证TPL在体内的抗肿瘤效应和焦亡诱导作用。
将H1688细胞皮下接种至裸鼠,建立SCLC异种移植模型;当肿瘤体积达50 mm³时,随机分为对照组、0.5 mg/kg TPL组和1 mg/kg TPL组,隔天腹腔注射,治疗12天后处死,取肿瘤和主要器官进行H&E和IHC染色。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Procell | -- |
| DMEM培养基 | Procell | -- | |
| 胎牛血清 | NEWZERUM | -- | |
| 药物处理 | 雷公藤甲素 | MedChemExpress | -- |
| Z-DEVD-FMK | MedChemExpress | -- | |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | MedChemExpress | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Abbkine | -- |
| 增殖检测 | EdU Apollo 567体外成像试剂盒 | RiboBio | -- |
| 细胞毒性检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | DOJINDO | -- |
| 细胞周期和凋亡检测 | 细胞周期和凋亡分析试剂盒 | Yeasen | -- |
| 迁移和侵袭实验 | Transwell小室 | Corning Falcon | -- |
| 侵袭实验 | 基质胶 | Corning Inc. | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | SDS-PAGE凝胶 | Yeasen | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| GSDME抗体 | Abcam | ab215191 | |
| GSDME-N抗体 | Abcam | ab222407 | |
| GSDMD抗体 | Abcam | ab219800 | |
| CASP3抗体 | Santa Cruz | sc-56046 | |
| cleaved CASP3抗体 | CST | 9661 | |
| CASP1抗体 | Proteintech | 22915-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| α-微管蛋白抗体 | Proteintech | 1124-1-AP | |
| 二抗 | HUABIO | HA1001 and HA1006 | |
| Western blot成像 | Syngene G:BOX Chemi XT4成像系统 | Syngene | -- |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | S0033S |
| siRNA转染 | siRNA | Sangon Biotech | -- |
| jetPRIME转染试剂 | Polyplus | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TaKaRa | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript RT Master Mix | TaKaRa | #RR036A |
| TB Green Premix Ex Taq | TaKaRa | #RR420A | |
| Quantagene q225实时荧光定量PCR仪 | Kubo Technology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(NCI-H1688、NCI-H82、BEAS-2B来自中科院细胞库,NCI-H1339来自中山大学肿瘤防治中心);培养基类型(RPMI-1640或DMEM);血清浓度(10% FBS);培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Methods中'Cell culture'部分 |
| 药物处理 | TPL浓度范围(0-200 nM);处理时间(24、48、72小时);TPL溶解和稀释方式未明确说明;Z-DEVD-FMK和NAC的使用浓度未明确说明 阅读提示:Methods中'Reagents'和'CCK-8 assay'部分;图4和图5的图注 |
| 体外功能实验 | CCK-8接种密度(5×10³/孔);克隆形成接种密度(1×10³/孔)及处理时间(48小时)和培养时间(14天);EdU浓度(50 µM)和孵育时间(2小时);细胞周期和凋亡分析中细胞数量范围(1×10⁵-1×10⁶);Transwell迁移和侵袭的细胞数(5×10⁴)及处理时间(48小时);Matrigel包被时间(30分钟) 阅读提示:Methods中'CCK-8 assay'、'Clonogenic assay'、'EDU assay'、'Cell migration and invasion assays'、'Cell cycle and apoptosis analysis' |
| 焦亡检测 | LDH释放实验的时间点(12、24、48小时);Western blot检测的蛋白(GSDME、GSDMD、CASP3等)及抗体稀释比例未说明;GSDME siRNA2序列未提供 阅读提示:Methods中'LDH release assay'、'Western blot'、'SiRNA transfection and qRT-PCR';图3图注 |
| 机制验证 | ROS检测使用DCFH-DA浓度(10 µM)和孵育时间(30分钟);NAC处理浓度未明确说明;Z-DEVD-FMK处理浓度未明确说明 阅读提示:Methods中'Measurement of reactive oxygen species';图5图注 |
| 体内实验 | 细胞接种数量(1×10⁷ H1688细胞);小鼠品系和周龄(4-6周龄雄性BALB/c裸鼠);给药剂量(0.5和1.0 mg/kg TPL)和频率(隔天腹腔注射);治疗周期(12天);肿瘤体积测量公式(V=L×W²/2);处理开始时肿瘤体积阈值(50 mm³) 阅读提示:Methods中'In vivo nude mouse xenograft study'部分;图6A |