检测DN模型中SETD7表达
验证SETD7在糖尿病肾病中的表达变化。
利用GSE200322和GSE228727数据集分析STZ诱导T1D和db/db T2D小鼠中SETD7表达;建立STZ和db/db DN模型;Western blot、RT-qPCR、免疫组化检测肾组织中SETD7表达;体外高糖处理MCs检测SETD7表达。
SETD7 exacerbates diabetic nephropathy through activating A2B receptor-JAK2/STAT3 pathway.
包含体外细胞实验(siRNA、过表达、抑制剂)、体内动物模型(STZ诱导DN小鼠)、分子机制验证(ChIP、GST pull-down、Co-IP)等多个独立证据层级。
小鼠系膜细胞系SV40-MES-13 STZ诱导的SETD7敲除小鼠(Setd7−/−)糖尿病肾病模型 db/db 2型糖尿病小鼠
STZ剂量和注射方案:50 mg/kg连续5天腹腔注射 高糖处理:33 mM D-glucose处理24小时 SETD7敲除小鼠来源:CRISPR/Cas9(上海模式动物中心) siRNA敲低和过表达验证:siSetd7、siAdora2b、SETD7过表达慢病毒 抑制剂使用:20 μM sinefungin和5 μM stattic预处理4小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SETD7在糖尿病肾病中的表达变化。
利用GSE200322和GSE228727数据集分析STZ诱导T1D和db/db T2D小鼠中SETD7表达;建立STZ和db/db DN模型;Western blot、RT-qPCR、免疫组化检测肾组织中SETD7表达;体外高糖处理MCs检测SETD7表达。
确定SETD7缺失对DN小鼠肾损伤和纤维化的影响。
使用CRISPR/Cas9产生Setd7−/−小鼠;STZ诱导DN;检测肾功能指标(Ccr、尿白蛋白、ACR、UA、BUN);组织学染色(H&E、PAS、Masson)评估肾小球损伤和纤维化;Western blot检测纤维化和炎症标志物。
验证SETD7对高糖诱导的系膜细胞纤维化和炎症的影响。
使用siRNA敲低SETD7,SETD7抑制剂sinefungin处理,慢病毒过表达SETD7,检测纤维化和炎症标志物表达。
探究SETD7是否通过调控A2BR转录影响下游信号。
检测A2BR在HG、SETD7敲低/过表达/抑制剂下的表达;ChIP-PCR检测SETD7结合于Adora2b启动子;A2BR敲低在SETD7过表达细胞中检测纤维化和炎症标志物。
阐明A2BR如何激活JAK2/STAT3信号通路。
Western blot检测HG和A2BR敲低下p-JAK2、p-STAT3;核质分离和免疫荧光检测STAT3核转位;GST pull-down检测A2BR与JAK2/STAT3相互作用;Co-IP验证A2BR-JAK2结合;构建A2BR截短突变体确定结合域。
在DN小鼠模型中验证SETD7缺失对A2BR/JAK2/STAT3通路的影响。
检测Setd7−/−和Setd7+/+小鼠(STZ诱导或未处理)肾组织和肾小球中A2BR表达、JAK2/STAT3磷酸化、STAT3核转位;免疫组化和免疫荧光染色。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 链脲佐菌素 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞培养 | SV40-MES-13细胞系 | Procell | -- |
| DMEM/F12培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | BasalMedia | -- | |
| 肾小球分离 | 胶原酶A | Sigma-Aldrich | -- |
| 磁珠 | -- | -- | |
| 肾脏功能检测 | 白蛋白检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| 肌酐检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 组织学分析 | Masson三色染色 | -- | -- |
| 显微镜观察 | 光学显微镜 | Carl Zeiss AG | -- |
| GST pull-down | 异丙基硫代半乳糖苷 | Sangon | -- |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 染色质免疫沉淀 | 蛋白G磁珠 | Invitrogen | -- |
| DNA清洁浓缩试剂盒 | ZYMO Research | -- | |
| 核质分离 | NE-PER核质提取试剂盒 | ThermoFisher | -- |
| 细胞处理 | 西奈芬净 | -- | -- |
| Stattic | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型诱导 | STZ剂量和注射方案(50 mg/kg连续5天),小鼠周龄(8周龄),品系(Setd7+/+和Setd7−/−) 阅读提示:见Materials and methods: Mice and animal models |
| 细胞培养和处理 | 高糖浓度(33 mM D-glucose),处理时间(24小时),对照(5.5 mM D-glucose和甘露醇),细胞系(SV40-MES-13) 阅读提示:见Materials and methods: Cell culture and treatment |
| 基因敲低和过表达 | siRNA序列(siSetd7、siAdora2b、siScr),转染方法,过表达载体(SETD7过表达慢病毒) 阅读提示:见Materials and methods: Cell culture and treatment |
| 抑制剂处理 | sinefungin浓度(20 μM)和预处理时间(4小时),stattic浓度(5 μM)和预处理时间(4小时) 阅读提示:见Materials and methods: Cell culture and treatment |
| 分子相互作用 | GST-A2BR构建和表达,Co-IP条件(1 mg总蛋白,1 μg抗体),His-A2BR截短突变体(Mut1/Mut2/Mut3) 阅读提示:见Materials and methods: GST-pull down and Co-immunoprecipitation assay |
| ChIP实验 | ChIP引物序列(Adora2b 0-500 bp),甲醛固定浓度(1%),超声条件,使用蛋白量(200 μg) 阅读提示:见Materials and methods: Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)-PCR |