CTSD表达分析
评估CTSD在多种癌症中的表达及其与预后的关系。
通过GEPIA2数据库分析33种癌症类型的CTSD表达,并对BRCA、LIHC、OV进行生存分析,同时用IHC染色验证患者肿瘤组织中的CTSD表达。
Design and Preclinical Evaluation of First 68Ga-Labeled Cathepsin D-Targeted Radiotracers.
研究包含分子对接、SPR结合实验、细胞摄取、小鼠异种移植模型micro-PET/CT成像、生物分布、阻断实验、组织病理及生物安全性评估等多层次验证。
MCF-7乳腺癌细胞系及异种移植模型 MDA-MB-175VII乳腺癌异种移植模型 MDA-MB-468乳腺癌异种移植模型 A549肺癌异种移植模型
CTSD蛋白来源:MedChemExpress (HY-P7748A) 细胞系来源:中国科学院上海生命科学研究院细胞资源中心 小鼠品系:5周龄雌性BALB/c裸鼠,皮下接种5×10^6细胞 放射性示踪剂注射剂量:3.7-7.4 MBq(micro-PET/CT),2.5-3.7 MBq(生物分布) 成像时间点:注射后0.5、1、1.5小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CTSD在多种癌症中的表达及其与预后的关系。
通过GEPIA2数据库分析33种癌症类型的CTSD表达,并对BRCA、LIHC、OV进行生存分析,同时用IHC染色验证患者肿瘤组织中的CTSD表达。
设计靶向CTSD的NOTA-FZCD-1/2/3前体,并通过分子对接预测其结合模式。
基于CTSD晶体结构(PDB ID: 6QCB)使用AutoDock Vina进行分子对接,分析结合能、氢键相互作用,并评估对pepsin的选择性。
制备68Ga标记的放射性示踪剂并验证其理化性质。
将前体与68Ga标记,通过radio-HPLC和radio-iTLC测量放射化学纯度,并测定Log P/Log D7.4、血浆蛋白结合率、稳定性和药代动力学参数。
评估不同乳腺癌细胞系对[68Ga]Ga-NOTA-FZCD-3的摄取,并验证与CTSD表达的关系。
将MDA-MB-468、MCF-7、MDA-MB-415和MDA-MB-175VII细胞与示踪剂孵育,测定不同时间点的细胞摄取,并进行了阻断实验。
评估[68Ga]Ga-NOTA-FZCDi在肿瘤模型中的摄取和成像性能。
对MCF-7、MDA-MB-468、MDA-MB-415、MDA-MB-175VII和A549荷瘤小鼠进行micro-PET/CT成像,定量分析肿瘤和肌肉的放射性摄取。
评估示踪剂在体内的分布和清除特性。
在MDA-MB-468和MDA-MB-175VII荷瘤小鼠中,注射示踪剂后在不同时间点处死,收集主要器官并测量放射性摄取。
验证肿瘤组织中示踪剂摄取与CTSD表达的一致性。
对MDA-MB-175VII肿瘤组织进行放射自显影、H&E染色和免疫组化染色,分析CTSD表达。
评估示踪剂对小鼠的潜在毒性。
对注射示踪剂后7天的小鼠进行血生化和主要器官的H&E染色,评估肝肾功能和组织损伤。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 分子对接 | CTSD蛋白结构(PDB ID: 6QCB) | RCSB Protein Data Bank | -- |
| 胃蛋白酶结构(PDB ID: 1PSO) | RCSB Protein Data Bank | -- | |
| SPR结合实验 | CTSD蛋白 | MedChemExpress | HY-P7748A |
| 放射性标记 | 68Ge/68Ga发生器 | Eckert & Ziegler | -- |
| C18柱(SEP-PAK) | SEP-PAK | -- | |
| 分析 | 安捷伦1260 Infinity II高效液相色谱系统 | Agilent | -- |
| ZORBAX 300SB-C18色谱柱 | Agilent | -- | |
| Dual Scan-RAM放射性即时薄层色谱平台 | -- | -- | |
| NMR谱 | Bruker AVANCE III 400 MHz核磁共振波谱仪 | Bruker | -- |
| HRMS | Agilent 6545高分辨质谱仪 | Agilent | -- |
| 细胞培养 | 细胞培养基 | Procell Life Science & Technology Co. Ltd. | -- |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | GemPharmatech Co. Ltd. | -- |
| 雌激素缓释片 | -- | -- | |
| 微PET/CT成像 | Inveon PET系统 | Siemens | -- |
| 生物分布 | γ计数器(型号SN-697) | Rihuan Optoelectronic Instrument Co. Ltd. | SN-697 |
| 统计分析 | GraphPad Prism 10 | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 放射性标记 | 68Ga标记条件:1 mL [68Ga]GaCl3,20 μL前体(1 mg/mL),0.16 mL乙酸钠(1.0 M),65°C反应10分钟;C18柱纯化 阅读提示:Experimental Section: Radiochemical Synthesis |
| SPR结合实验 | CTSD蛋白来源(MedChemExpress HY-P7748A);KD值:NOTA-FZCD-3 0.65 μM;前体浓度梯度 阅读提示:Results: Radiolabeling and Affinity; Experimental Section: Surface Plasmon Resonance |
| 细胞摄取实验 | 细胞系:MDA-MB-468, MCF-7, MDA-MB-415, MDA-MB-175VII;细胞数5×10^5/孔;示踪剂浓度180-370 kBq/mL;孵育0.5, 1, 2小时;阻断剂Pepstatin-NH2 1 mg/mL 阅读提示:Experimental Section: Cell Uptake Determination |
| Micro-PET/CT成像 | 小鼠模型:BALB/c裸鼠;细胞接种量5×10^6;示踪剂注射剂量3.7-7.4 MBq;成像时间点0.5, 1, 1.5小时;异氟烷麻醉 阅读提示:Experimental Section: Micro-PET/CT and Imaging Analysis |
| 生物分布 | 示踪剂剂量2.5-3.7 MBq;小鼠数量每组5只;时间点30, 60, 90分钟;器官收集和γ计数 阅读提示:Experimental Section: Ex Vivo Distribution |
| 细胞系 | 细胞系来源:中国科学院上海生命科学研究院细胞资源中心;培养条件:37°C, 5% CO2 阅读提示:Experimental Section: Cell Lines |