BMSCs分离与鉴定
获取并确认BMSCs的干细胞特性,用于后续外泌体提取
从SONFH患者股骨骨髓中分离BMSCs,通过形态学观察、成骨和成脂分化诱导及流式细胞术检测表面标志物(CD34、CD45、CD73、CD90、CD105)进行鉴定。
A novel BMSC-derived Exosomal circrna promotes angiogenesis by targeting miR-34a-5p to regulate Piezo1.
包含体外细胞功能实验、外泌体共培养、机制验证(双荧光素酶、RIP、RAP)及离体主动脉环和体内CAM模型等多个证据层级。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) BMSC来源外泌体 小鼠主动脉环模型 鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)模型
SONFH患者与健康对照BMSC来源外泌体中novel_circ_0001686表达差异 novel_circ_0001686在HUVECs中的过表达与敲低效率(OE约40倍,KD约90%) GW4869抑制外泌体释放的浓度与处理时间(文中未明确说明) 双荧光素酶报告基因验证novel_circ_0001686与miR-34a-5p、miR-34a-5p与Piezo1结合 小鼠主动脉环和CAM实验中OE-exo与KD-exo的处理浓度与时间
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取并确认BMSCs的干细胞特性,用于后续外泌体提取
从SONFH患者股骨骨髓中分离BMSCs,通过形态学观察、成骨和成脂分化诱导及流式细胞术检测表面标志物(CD34、CD45、CD73、CD90、CD105)进行鉴定。
验证外泌体的成功提取,为后续功能实验提供材料
通过超速离心法从BMSC条件培养基中提取外泌体,使用TEM观察形态,NTA分析粒径分布,Western blot检测标志物CD9、CD63、TSG101。
鉴定SONFH患者与健康对照间差异表达的外泌体circRNAs,筛选关键分子
对3例SONFH患者和3例健康对照的BMSC来源外泌体RNA进行测序,使用find_circ和CIRI2鉴定circRNAs,进行差异表达分析和GO/KEGG富集分析。
确认novel_circ_0001686的环状结构和细胞质定位,支持其作为ceRNA的功能
通过Sanger测序、琼脂糖凝胶电泳、RNase R处理验证环状性;通过FISH和核/质分离实验确定其亚细胞定位。
评估novel_circ_0001686对HUVEC增殖、迁移、凋亡和血管生成的影响
通过慢病毒介导的过表达和敲低改变HUVECs中novel_circ_0001686表达,采用CCK8、EdU、划痕、流式、TUNEL、管形成实验检测功能,并用qRT-PCR和Western blot检测血管生成相关标志物。
证明BMSC来源外泌体能够将novel_circ_0001686转移至HUVECs并发挥功能
使用Transwell共培养系统,将PKH26标记的BMSCs与HUVECs共培养,通过荧光显微镜观察外泌体摄取,并通过qRT-PCR检测novel_circ_0001686表达变化。同时用GW4869抑制外泌体释放,观察功能变化。
确认外泌体中的novel_circ_0001686对HUVEC功能起促进血管生成作用
将过表达或敲低novel_circ_0001686的BMSCs与HUVECs共培养,检测HUVEC的增殖、迁移、凋亡和管形成能力,以及血管生成标志物的表达。
验证novel_circ_0001686与miR-34a-5p的直接结合
通过双荧光素酶报告基因实验验证结合位点;通过RIP和RAP实验验证与Ago2的关联。
确认Piezo1是miR-34a-5p的直接靶基因
通过双荧光素酶报告基因实验验证miR-34a-5p与Piezo1的结合,并通过qRT-PCR和Western blot检测Piezo1表达变化。
确认novel_circ_0001686通过miR-34a-5p/Piezo1轴发挥促血管生成作用
在过表达novel_circ_0001686的HUVECs中共转染miR-34a-5p mimic或KD-Piezo1,检测细胞增殖、迁移、凋亡和血管生成能力的变化,以及相关标志物的表达。
在离体和体内模型中验证外泌体novel_circ_0001686促进血管生成
使用小鼠主动脉环和鸡胚CAM实验,评估外泌体处理后的微血管出芽和毛细血管形成。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| BMSCs分离 | Percoll分离液 | -- | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| F-12K培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 外泌体提取 | 贝克曼超速离心机 | Beckman | -- |
| 外泌体鉴定 | 透射电子显微镜 | -- | -- |
| ZetaView纳米颗粒分析仪 | -- | -- | |
| Western blot | 抗CD9抗体 | Abcam | -- |
| 抗CD63抗体 | Abcam | -- | |
| 抗TSG101抗体 | Abcam | -- | |
| 抗VEGFR2抗体 | Abcam | -- | |
| 抗TGFβ抗体 | Abcam | -- | |
| 抗VEGF-A抗体 | Abcam | -- | |
| 抗FGF抗体 | Abcam | -- | |
| 抗Ago2抗体 | CST | -- | |
| 抗Piezo1抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Elabscience | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | -- | -- |
| 逆转录 | RNA逆转录试剂盒 | -- | -- |
| miRNA逆转录试剂盒 | -- | -- | |
| RNA测序 | Epicentre RiboZero™ rRNA去除试剂盒 | Epicentre | -- |
| NEBNext® Ultra™定向RNA文库制备试剂盒 | NEBNext | -- | |
| 安捷伦生物分析仪2100 | Agilent | -- | |
| Illumina测序平台 | Illumina | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞处理 | GW4869 | -- | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | -- | -- |
| EdU检测试剂盒 | Elabscience | -- | |
| 流式凋亡检测 | Annexin V-PE/Cyanine7 | -- | -- |
| 7-AAD | -- | -- | |
| TUNEL检测 | TUNEL检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 管形成实验 | Matrigel基质胶 | -- | -- |
| 外泌体标记 | PKH26染料 | -- | -- |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| BMSCs分离与培养 | 骨髓来源、分离方法、培养条件、传代比例及代数 阅读提示:Methods: Isolation of BMSCs, Cell culture |
| 外泌体提取 | 超速离心各步骤转速与时间,特别是110,000×g 70分钟 阅读提示:Methods: Extraction of exosomes |
| circRNA测序 | 样本量(3例SONFH vs 3例对照)、文库构建方法、测序平台 阅读提示:Methods: Exosomal circrna sequencing, Exosomal circrna analysis |
| novel_circ_0001686过表达/敲低 | 慢病毒载体构建(Genechem)、MOI或转染效率(OE约40倍,KD约90%) 阅读提示:Methods: Cell transfection, Results: Novel_circ_0001686 promotes proliferation... |
| 外泌体功能实验 | GW4869浓度与处理时间、共培养时间(24/48/72h) 阅读提示:Methods: Co-culture of BMSCs and HUVECs |
| 双荧光素酶报告基因 | 报告基因载体构建、共转染方案、检测时间(48h) 阅读提示:Methods: Dual luciferase reporter gene system |
| RIP/RAP | 抗体(Ago2)和探针信息、磁珠类型 阅读提示:Methods: RNA Immunoprecipitation (RIP) assays, RNA antisense purification (RAP) assays |
| 主动脉环实验 | 小鼠周龄(4周)、主动脉环处理时间(2/4/8天)、Matrigel用量 阅读提示:Methods: Mouse aortic ring assays |
| CAM实验 | 鸡胚孵化条件(37°C、70%湿度)、处理时间(24h) 阅读提示:Methods: Chicken Chorioallantoic membrane assays |