临床样本表达分析
验证CXCR4在醛固酮产生病变中的表达水平及其与CYP11B2的相关性。
通过免疫组化检测NFA(20例)和UPA(56例)肾上腺组织样本中CXCR4和CYP11B2的表达,并分析不同基因突变类型和病变类型间的差异;通过免疫荧光检测共定位。
CXCR4 reduces aldosterone synthesis via regulating CYP11B2 expression.
研究包含患者组织样本(NFA和UPA)的免疫组化与免疫荧光验证、H295R细胞中CXCR4过表达/敲低的功能实验、RNA测序及ID3过表达/敲低的机制验证,涉及多层级证据。
醛固酮产生病变患者肾上腺组织样本(NFA和UPA) H295R人肾上腺皮质癌细胞系
患者样本分组:NFA(n=20)和UPA(n=56),包含基因突变亚型(KCNJ5、ATP1A1、ATP2B3、CACNA1D)及病变类型(APA、APN、MAPM) H295R细胞中CXCR4过表达(LV-CXCR4)和敲低(LV-shCXCR4)的稳定细胞系构建,使用嘌呤霉素或杀稻瘟菌素筛选 类固醇激素检测:超高效液相色谱-质谱联用测定孕酮、11-脱氧皮质酮、皮质酮、18-羟皮质酮和醛固酮水平 ID3过表达(LV-ID3-3XFLAG)和敲低(LV-shID3)实验验证ID3对CYP11B2表达的影响 统计分析:两组比较使用Student's t检验,多组比较使用单因素方差分析及Tukey事后检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CXCR4在醛固酮产生病变中的表达水平及其与CYP11B2的相关性。
通过免疫组化检测NFA(20例)和UPA(56例)肾上腺组织样本中CXCR4和CYP11B2的表达,并分析不同基因突变类型和病变类型间的差异;通过免疫荧光检测共定位。
评估CXCR4过表达是否影响H295R细胞的醛固酮合成和CYP11B2表达。
构建稳定过表达CXCR4的H295R细胞系(LV-CXCR4),利用质谱检测类固醇激素水平,并检测CYP11B2的蛋白和mRNA表达。
验证CXCR4敲低是否增强醛固酮合成和CYP11B2表达。
构建稳定敲低CXCR4的H295R细胞系(LV-shCXCR4),检测类固醇激素水平和CYP11B2表达。
鉴定CXCR4过表达后差异表达基因和相关信号通路,寻找潜在机制。
对CXCR4过表达的H295R细胞进行RNA测序,分析差异表达基因(460个,364个上调,96个下调),并进行KEGG和GO富集分析。
验证CXCR4是否通过上调ID3抑制CYP11B2转录和醛固酮合成。
检测CXCR4过表达和敲低后ID3和ID1的表达;构建ID3过表达细胞系(LV-ID3-3XFLAG)和CXCR4过表达+ID3敲低细胞系,检测CYP11B2表达及激素水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒 | Gibco | -- | |
| 慢病毒感染 | 嘌呤霉素 | Gibco | A1113803 |
| 杀稻瘟菌素S | Beyotime | ST018-5 ml | |
| 激素检测 | UltiMate Thermo 3000超高效液相色谱 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| TSQ Endura三重四极杆质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blotting | 含蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 | |
| WesternBright ECL化学发光试剂盒 | Advansta | K-12045-D50 | |
| 小鼠抗CYP11B2抗体 | Millipore | mabs1251 | |
| 兔抗CXCR4抗体 | Abcam | ab124824 | |
| 兔抗GAPDH抗体 | Servicebio | GB11002 | |
| 兔抗FLAG标签抗体 | Cell Signaling Technology | 14793S | |
| 兔抗ID3抗体 | Cell Signaling Technology | 9837 | |
| 小鼠抗ID1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-133104 | |
| 山羊抗兔HRP二抗 | Invitrogen | -- | |
| 山羊抗小鼠HRP二抗 | Invitrogen | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Roche | 11667165001 |
| RT-qPCR | PrimeScript™ FAST RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara | RR092A |
| TB Green® Premix Ex Taq™ II | Takara | RR820A | |
| 免疫组化/免疫荧光 | 奥林巴斯VS200扫描仪 | Olympus | -- |
| 免疫组化 | 兔抗CXCR4抗体(1:500) | Abcam | ab124824 |
| 小鼠抗CYP11B2抗体(1:100) | Millipore | mabs1251 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔Alexa Fluor™ Plus 488二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 山羊抗小鼠Alexa Fluor™ Plus 555二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 测序 | 全外显子组测序 | Novogene Co., Ltd., China | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集 | 样本来源:NFA(n=20)和UPA(n=56),诊断标准需参照指定文献(参考文献30和33);基因突变检测方法(Sanger测序和全外显子测序)涉及的具体条件和引物见表S1 阅读提示:Materials and methods - Subjects |
| 免疫组化/免疫荧光 | 一抗稀释比例、品牌和货号;染色流程标准化及时间窗口(六个月内);FIJI软件量化方法(每张切片三个随机视野,平均积分光密度) 阅读提示:Materials and methods - Immunohistochemical staining and quantification 及 Immunofluorescence staining;图S1 |
| 细胞培养和慢病毒感染 | H295R细胞系来源(Procell);培养基(DMEM/F12+10%FBS+1%ITS);慢病毒感染时细胞融合度(50%)、感染时间(16小时)和筛选条件(嘌呤霉素或杀稻瘟菌素S);shRNA序列(LV-shCXCR4和LV-shID3) 阅读提示:Materials and methods - Cell culture and reagents 及 Lentiviral infection |
| 激素检测 | 质谱检测平台(UPLC和TSQ Endura);激素种类及归一化方式(总蛋白量);生物学重复数(n=6或n=3) 阅读提示:Materials and methods - Assay of aldosterone and related hormones |
| 机制验证(RNA-seq和ID3) | RNA提取方法(Trizol);测序服务提供商;ID3过表达和敲低的构建;关键验证:CXCR4过表达/敲低后ID3和ID1表达变化,ID3过表达/敲低对CYP11B2的影响 阅读提示:Materials and methods - RNA-sequencing data analysis, Western blotting, RNA isolation and quantitative PCR;Results部分 |