人群样本生物标志物鉴定
评估ANGPTL4、SIRT3和D2-HG作为PM2.5相关CHD生物标志物的潜力。
检测CHD病例和对照的脐带血清中ANGPTL4、SIRT3和D2-HG水平,分析其与PM2.5暴露的相关性,并通过ROC曲线评估诊断价值。
Gestational exposure to PM2.5 impaired cardiac development through ANGPTL4-mediated mitochondrial metabolic dysfunction.
包含人群样本、ANGPTL4敲除小鼠模型、转录组分析、体外共培养及机制验证。
人脐带血清样本 C57BL/6J小鼠及ANGPTL4敲除小鼠 HTR-8/SVneo人滋养层细胞 AC-16人心肌细胞
PM2.5暴露浓度(小鼠:平均130.59±50.43 μg/m³,每日6小时;细胞:50 μg/mL)及暴露时间(E6.5至E16.5/P1) ANGPTL4敲除(小鼠模型及shRNA敲低)对PM2.5诱导的心脏结构和功能改变的影响 SIRT3抑制剂(3-TYP, 200 μM)和激动剂(DMY, 100 μM)对LONP1乙酰化的影响 LONP1过表达对PM2.5诱导的线粒体功能障碍和D2HGDH表达的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ANGPTL4、SIRT3和D2-HG作为PM2.5相关CHD生物标志物的潜力。
检测CHD病例和对照的脐带血清中ANGPTL4、SIRT3和D2-HG水平,分析其与PM2.5暴露的相关性,并通过ROC曲线评估诊断价值。
验证母体PM2.5暴露对后代心脏结构和线粒体的影响,并确定ANGPTL4的作用。
对野生型和ANGPTL4敲除小鼠进行PM2.5暴露,通过超声、HE染色和TEM评估心脏结构和线粒体超微结构。
鉴定PM2.5暴露后心脏中差异表达基因及相关通路。
对P1小鼠心脏进行转录组测序,分析差异表达基因,并进行GO和KEGG富集分析。
模拟宫内PM2.5暴露条件,验证ANGPTL4/SIRT3轴在心肌细胞线粒体功能障碍中的作用。
用PM2.5处理HTR-8细胞,收集条件培养基处理AC-16细胞;检测MMP、TEM、线粒体呼吸、蛋白表达和Co-IP。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 人群样本检测 | 人ANGPTL4 ELISA试剂盒 | RayBiotech | -- |
| 人SIRT3 ELISA试剂盒 | RayBiotech | -- | |
| D2-HG ELISA试剂盒 | Abcam | ab83431 | |
| 动物模型构建 | C57BL/6J小鼠 | Vital River Laboratories | -- |
| PM2.5暴露 | 全身吸入系统 | Beijing Huironghe Technology | -- |
| DustTrak™ II气溶胶监测仪 | -- | 8530 | |
| 心脏功能评估 | Vevo 2100超声成像系统 | FUJIFILM VisualSonics Inc. | -- |
| 转录组分析 | Clariom D微阵列 | Affymetrix | -- |
| 代谢物定量 | α-KG ELISA试剂盒 | Abcam | ab211070 |
| D2-HG ELISA试剂盒 | Abcam | ab83431 | |
| 免疫荧光染色 | ANGPTL4一抗 | Proteintech | -- |
| SIRT3一抗 | CST | -- | |
| LONP1一抗 | Proteintech | -- | |
| D2HGDH一抗 | Proteintech | -- | |
| Alexa Fluor偶联二抗 | CST | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 多重染色试剂盒 | Absin | abs50028-100T | |
| 共聚焦显微镜 | Nikon | A1HD25 | |
| 细胞培养 | HTR-8/SVneo人滋养层细胞 | Procell Life Science & Technology Co.,Ltd. | CVCL_7162 |
| AC-16人心肌细胞 | Cyagen Biosciences | CVCL_4U18 | |
| DMEM/F12培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | PM2.5样品 | -- | -- |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒(CCK-8) | Dojindo | -- |
| 基因敲低 | 靶向人ANGPTL4的shRNA浓缩慢病毒 | -- | -- |
| 非靶向对照 | -- | -- | |
| 基因过表达 | 携带人LONP1全长cDNA的浓缩慢病毒 | -- | -- |
| 药物处理 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| SIRT3选择性抑制剂(3-TYP) | -- | -- | |
| 二氢杨梅素(DMY) | -- | -- | |
| TEM | JEOL JEM-2100FL透射电镜 | JEOL | -- |
| 线粒体功能分析 | Seahorse XFe96微孔板 | Agilent | -- |
| Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent | 103015-100 | |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE染料 | Beyotime | -- |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | Becton-Dickinson | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript RT预混液 | Takara | -- | |
| SYBR Green染料 | Roche | -- | |
| QuantStudio 6 Flex实时荧光定量PCR系统 | -- | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL化学发光底物 | Millipore | -- | |
| Co-IP | Protein A/G磁珠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人群样本收集 | 样本量(40例CHD,40例对照)、PM2.5暴露评估方法(1-km分辨率网格数据)、ELISA试剂盒品牌及货号。 阅读提示:Materials and methods - Human participant and exposure assessment; ELISA quantification |
| 小鼠PM2.5暴露 | 小鼠品系(C57BL/6J)、ANGPTL4敲除方法、PM2.5暴露浓度(平均130.59μg/m³)、暴露时间(E6.5起每日6小时)、对照组处理。 阅读提示:Materials and methods - Animals and ethical approval; PM2.5 exposure protocols |
| 胎儿心脏结构评估 | 检测时间点(E16.5和P1)、超声参数(LVAWd, LVAWs, LVPWd, LVPWs, LVIDd, LVIDs, EF, FS)、样本量。 阅读提示:Materials and methods - Cardiac function assessment; Figure 2 legend |
| 转录组分析 | 组织样本(P1心脏)、微阵列类型(Clariom D)、差异表达阈值(|FC|>1.2, p<0.05)、富集分析方法。 阅读提示:Materials and methods - Transcriptomic profiling; Figure 3 legend |
| 体外PM2.5暴露模型 | HTR-8细胞PM2.5处理浓度(50 μg/mL)和时间(24h)、AC-16细胞培养条件、条件培养基收集方法。 阅读提示:Materials and methods - Cell culture and PM2.5 exposure; Figure 5A |
| 线粒体功能检测 | Seahorse试剂盒(103015-100)、OCR/ECAR检测顺序、MMP检测方法(TMRE)、TEM样品制备。 阅读提示:Materials and methods - Mitochondrial function assays; Transmission electron microscopy; Figure 5 |
| 机制验证 | Co-IP抗体(ANGPTL4, SIRT3, LONP1, D2HGDH)、乙酰化检测方法、SIRT3抑制剂/激动剂浓度(3-TYP 200 μM, DMY 100 μM)。 阅读提示:Materials and methods - Co-immunoprecipitation; Western blotting; Figure 6; Figure S3 |