临床样本表达分析
检测脓毒症诱导的AKI患者中FENDRR的表达水平及其与临床指标的相关性。
收集85名AKI患者和90名脓毒症患者血清,通过RT-qPCR检测FENDRR表达,并进行ROC曲线和相关性分析。
lncRNA FENDRR targets miR-3614-5p to promote sepsis-induced acute kidney injury via the pro-inflammatory response.
包含临床样本分析、细胞模型验证、双荧光素酶报告基因实验,但缺乏体内实验验证。
人类肾近端小管细胞系HK-2 LPS诱导的HK-2细胞炎症模型 脓毒症诱导的AKI患者血清样本
LPS处理浓度10 µg/ml LPS处理时间6小时 si-FENDRR转染 双荧光素酶报告基因实验分组 细胞凋亡率检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测脓毒症诱导的AKI患者中FENDRR的表达水平及其与临床指标的相关性。
收集85名AKI患者和90名脓毒症患者血清,通过RT-qPCR检测FENDRR表达,并进行ROC曲线和相关性分析。
验证FENDRR在LPS诱导的HK-2细胞炎症模型中对细胞凋亡、增殖、氧化应激和炎症因子的影响。
使用10 µg/ml LPS处理HK-2细胞6小时构建模型,转染si-FENDRR沉默FENDRR,检测细胞活力、凋亡率、MDA、ROS、炎症因子和肾损伤标志物水平。
验证FENDRR与miR-3614-5p之间的直接结合和负调控关系。
使用ENCORI数据库预测结合位点,通过双荧光素酶报告基因实验验证WT和MUT质粒与miR mimic/inhibitor共转染后的荧光活性变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM完全培养基 | Procell | -- |
| 0.25%胰蛋白酶 | Procell | -- | |
| 药物处理 | 脂多糖 | Solarbio | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| pcDNA3.1载体 | Sangon | -- | |
| 双荧光素酶报告 | pmir-GLO双荧光素酶报告载体 | Promega | -- |
| 海肾荧光素酶检测 | Promega | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8细胞增殖检测试剂盒 | Dojindo | -- |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 细胞凋亡阳性对照试剂盒 | Beyotime | -- | |
| MDA检测 | 脂质氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| ELISA | ELISA试剂盒 | mlbio | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | Takara | -- |
| qPCR | SYBR Premix Ex Taq II试剂盒 | Takara | -- |
| 临床指标检测 | PCT、SCr和BUN检测试剂盒 | Keygenbio | -- |
| 荧光定量PCR | 荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- |
| 微板读取 | 微板读取器 | Tecan | -- |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | BD | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 患者纳入标准:脓毒症诊断标准、AKI诊断标准、排除标准 阅读提示:见Material and methods中Study subjects部分 |
| 细胞模型构建 | HK-2细胞培养条件、LPS处理浓度和处理时间 阅读提示:见Material and methods中Cell model construction and cell transfection部分 |
| 细胞转染 | si-FENDRR和si-NC序列、转染试剂和用量 阅读提示:见Material and methods中Cell model construction and cell transfection部分 |
| 双荧光素酶报告实验 | WT和MUT质粒构建、miR mimic/inhibitor浓度、共转染分组 阅读提示:见Material and methods中Dual luciferase report部分 |
| 细胞功能检测 | CCK-8检测时间点和波长、凋亡检测细胞浓度和染色时间 阅读提示:见Material and methods中Cell viability and apoptosis assay部分 |