检测Wnt对FZD受体细胞表面水平的影响
验证Wnt是否诱导FZD内吞
用Wnt3a/5a条件培养基处理稳定表达V5-FZD1-10的HEK293A细胞,流式细胞术检测细胞表面V5-FZD水平。
Wnt induces FZD5/8 endocytosis and degradation and the involvement of RSPO-ZNRF3/RNF43 and DVL.
研究包含细胞实验、基因敲除/敲入、过表达、流式细胞术、免疫印迹、免疫荧光、邻近标记等多种方法,并进行功能验证和机制验证。
HEK293A细胞 Huh7细胞 U2OS细胞 MCF7细胞 769P细胞
HEK293A细胞系 Wnt3a/5a条件培养基处理 ZNRF3/RNF43双敲除 DVL1/2/3三敲除 IWP-2处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Wnt是否诱导FZD内吞
用Wnt3a/5a条件培养基处理稳定表达V5-FZD1-10的HEK293A细胞,流式细胞术检测细胞表面V5-FZD水平。
验证Wnt是否诱导FZD5/8降解
用Wnt3a/5a处理细胞,免疫印迹检测FZD5/8成熟形式水平,并用巴弗洛霉素A1抑制溶酶体验证。
确定FZD5内吞依赖的结构域
构建FZD5缺失突变体和CRD交换嵌合体,用流式细胞术检测内吞。
验证内源FZD5/8是否发生Wnt诱导的降解,并检测其是否依赖ZNRF3/RNF43
利用CRISPR/Cas9构建FZD5-V5敲入(KI)细胞和ZNRF3/RNF43双敲除(ZRDKO)细胞,结合免疫印迹和流式细胞术检测。
验证RSPO1是否能稳定FZD5/8
用RSPO1条件培养基处理细胞,免疫印迹和流式细胞术检测FZD5/8水平。
验证DVL是否参与Wnt诱导的FZD5/8内吞和降解
构建DVL1/2/3三敲除(DVLTKO)细胞,进行流式细胞术、免疫印迹和抗体标记内吞实验。
区分ZNRF3/RNF43在内吞和降解中的角色
在ZRDKO细胞中检测Wnt处理后的FZD5内吞和降解,并用免疫荧光分析内吞后的命运。
验证ZNRF3/RNF43是否特异性抑制FZD5/8介导的Wnt信号
在ZRDKO细胞中敲除FZD5/8,检测胞质β-catenin水平,并回补FZD5或FZD7观察效应。
验证RSPO1是否通过FZD5/8增强Wnt信号
在FZD5/8双敲除细胞中检测RSPO1对β-catenin的效应,并回补FZD5或FZD8。
验证Wnt是否促进FZD5与RNF43的相互作用
利用miniTurbo邻近标记技术,在ZRDKO或DVLTKO细胞中检测Wnt处理后RNF43ΔRING的生物素化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | boster | -- |
| 胎牛血清 | Genial | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| CRISPR/Cas9敲除 | PEI转染试剂 | -- | -- |
| 药物处理 | IWP-2 | Sigma–Aldrich | I0536 |
| 巴弗洛霉素A1 | Selleck | S1413 | |
| 细胞表面生物素化 | EZ-link Sulfo-NHS-SS-生物素 | -- | -- |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | Millipore | -- |
| SDS-PAGE凝胶 | Epizyme | -- | |
| ECL免疫印迹系统 | BLT Photon Technology | -- | |
| 流式细胞术 | NovoCyte Quanteon流式细胞仪 | Agilent | -- |
| 免疫荧光 | 共聚焦显微镜LSM 980 with Airyscan 2 | ZEISS | -- |
| 抗体标记内吞实验 | 抗V5抗体 | Cell Signaling Technology | 13202 |
| 邻近标记 | NeutrAvidin琼脂糖珠 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 生物素 | -- | B4639 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系(HEK293A, Huh7等)来源和培养条件 阅读提示:Materials and methods, Cell culture |
| Wnt处理 | Wnt3a/5a条件培养基的制备和处理时间(4小时) 阅读提示:Materials and methods, Conditioned medium; Figure 1 legend |
| 基因敲除/敲入 | CRISPR/Cas9敲除和敲入的细胞系(ZRDKO, DVLTKO, FZD5KI等)及验证方法 阅读提示:Materials and methods, Generation of CRISPR/Cas9 knockout cell lines; Generation of KI cell lines |
| 内吞检测 | 流式细胞术和内吞实验的抗体、条件和时间 阅读提示:Materials and methods, Flow cytometry; Immunofluorescence; Figure 3 legend |
| 蛋白降解检测 | 免疫印迹检测FZD5/8成熟形式,溶酶体抑制剂巴弗洛霉素A1的使用 阅读提示:Materials and methods, Immunoblotting; Figure 1 legend |
| 邻近标记实验 | miniTurbo邻近标记条件(生物素浓度200μM,处理时间) 阅读提示:Materials and methods, Biotin labeling with miniTurbo; Figure 7 legend |