细胞培养与分组
建立体外细胞模型并验证ITGA5过表达和沉默的效果
培养FaDu和SAS细胞,并分为对照组、空载体组、ITGA5过表达组、si-NC组和si-ITGA5组;同时培养脂肪细胞用于共培养实验。
Adipocytes promoted anoikis resistance of head and neck cancer cells via overexpressed ITGA5.
包含体外细胞实验,如集落形成、凋亡检测、蛋白印迹和共培养,但缺乏体内模型或临床样本验证,机制研究仅停留在表达水平。
FaDu细胞(人下咽鳞状细胞癌细胞系) SAS细胞(人舌鳞状细胞癌细胞系) 人网膜组织来源脂肪细胞
细胞株:FaDu(HTB-43)和SAS(CL-0849)的来源与培养条件 ITGA5过表达质粒和si-ITGA5的转染效率验证 脂肪细胞与HNSCC细胞共培养条件(matrigel浓度200 μg/mL,细胞数4×10^4/孔,共培养24小时) 失巢凋亡检测方法(Calcein AM/EthD-1双染) 凋亡检测方法(Annexin V-FITC/PI染色流式细胞术)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立体外细胞模型并验证ITGA5过表达和沉默的效果
培养FaDu和SAS细胞,并分为对照组、空载体组、ITGA5过表达组、si-NC组和si-ITGA5组;同时培养脂肪细胞用于共培养实验。
转染ITGA5过表达质粒和si-ITGA5,并验证转染效率
使用Lipofectamine 3000转染试剂进行转染,通过qRT-PCR检测ITGA5 mRNA表达水平,确认转染成功。
评估ITGA5过表达或沉默对细胞集落形成和凋亡的影响
采用集落形成实验检测细胞集落形成率,流式细胞术检测凋亡率,Calcein AM/EthD-1染色检测失巢凋亡。
评估脂肪细胞对HNSCC细胞功能的影响
通过Transwell系统将HNSCC细胞与脂肪细胞共培养,检测共培养对集落形成、凋亡和失巢凋亡的影响。
验证ITGA5在脂肪细胞介导的效应中的关键作用
将si-ITGA5转染的HNSCC细胞与脂肪细胞共培养,检测集落形成、凋亡和失巢凋亡是否被逆转。
检测凋亡相关蛋白和细胞黏附蛋白的表达水平
通过western blotting检测cleaved-caspase-3、ITGA5、ITGB1和CD44蛋白表达,以β-actin作为内参。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Eagle最低必需培养基 | ATCC | 30-2003 |
| Dulbecco改良Eagle培养基 | ATCC | 30-2020 | |
| 胎牛血清 | ATCC | 30-2020 | |
| CO2培养箱 | Beyotime | E2398 | |
| 共培养实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Romics | 15,596,018 |
| PrimeScript RT试剂盒(Perfect Real Time) | Takara Biotechnology | RR037B | |
| SYBR Green实时PCR预混液 | XYBiotechnology | XY-9A-QPK-201 | |
| ABI 7500热循环仪 | Shanghai Tusen Vision Technology | -- | |
| 细胞转染 | ITGA5小干扰RNA | GenePharma | C01004 |
| 阴性对照小干扰RNA | GenePharma | A06001 | |
| pcDNA载体 | Thermo Fisher | 12,489,019 | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | 13,778,030 | |
| Opti-MEM培养基 | Thermo Fisher | 31,985,062 | |
| 油红染色 | 油红O染色试剂盒 | Solarbio | G1262 |
| 集落形成实验 | 显微镜(DMi8) | Leica | -- |
| Western blotting | RIPA裂解缓冲液 | XY Biotechnology | XY9501 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012 | |
| SDS-PAGE凝胶 | Beyotime | P0676-500 ml | |
| PVDF膜 | Cytiva | 10,600,023 | |
| 抗Cleaved Caspase-3抗体 | Abcam | ab32042 | |
| 抗整合素α5抗体 | Abcam | ab150361 | |
| 抗整合素β1抗体 | Abcam | ab52971 | |
| 抗CD44抗体 | Abcam | ab189524 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab6276 | |
| TBST缓冲液 | APPLYGEN | -- | |
| 山羊抗兔IgG H&L二抗 | Abcam | ab205718 | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L二抗 | Abcam | ab205719 | |
| 化学发光试剂盒 | Proand | 10,145-100 ml | |
| ImageQuant密度扫描仪(BH-2) | OLYMPUS | -- | |
| 失巢凋亡检测 | 动物细胞活/死检测试剂盒 | UElandy | L6023M |
| 磷酸盐缓冲液 | Biocomma | -- | |
| 荧光显微镜(CytoFLEX) | BECKMAN COULTER | -- | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡染色/检测试剂盒 | Abcam | ab14085 |
| 流式细胞仪(BriCyte E6) | Mindray | -- | |
| 统计分析 | Graphpad 8.0 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件(培养基、FBS浓度、温度、CO2浓度) 阅读提示:Methods - Cell culture |
| 细胞转染 | 转染试剂类型、ITGA5过表达质粒和si-ITGA5的序列及浓度、转染时长 阅读提示:Methods - Cell transfection |
| 共培养实验 | matrigel浓度、细胞接种密度、共培养时间 阅读提示:Methods - Cell grouping |
| 集落形成实验 | 细胞接种密度、培养时间、固定和染色条件 阅读提示:Methods - Colony formation assay |
| 凋亡和失巢凋亡检测 | 检测试剂盒、细胞密度、染色和孵育时间 阅读提示:Methods - Anoikis assay and Cell apoptosis assay |
| 蛋白表达检测 | 抗体稀释比例、孵育时间、内参蛋白 阅读提示:Methods - Western blotting analysis |