细胞活性检测
评估α-hederin对宫颈癌细胞增殖的影响
使用CCK-8试剂检测不同浓度α-hederin处理后SiHa和HeLa细胞的活力
α-hederin inhibits cervical cancer progression by inducing DNA damage-dependent cell cycle blockade and apoptosis.
包含体外细胞实验(活性、凋亡、迁移、周期)、分子机制验证(Western blot、过表达、CETSA、分子对接)及体内裸鼠模型和代谢组学分析,多层级验证。
SiHa细胞 HeLa细胞 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型 临床宫颈癌组织样本
α-hederin浓度梯度(如0、5、10、20 μM) 药物处理时间(24小时、48小时) 细胞系:SiHa和HeLa 体内实验:BALB/c裸鼠,剂量5 mg/kg,给药方式(腹腔注射或口服),持续21天 化合物:α-hederin、MPA、NAC、CHK1过表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估α-hederin对宫颈癌细胞增殖的影响
使用CCK-8试剂检测不同浓度α-hederin处理后SiHa和HeLa细胞的活力
验证α-hederin对细胞增殖和凋亡的作用
通过EdU染色、Hoechst染色、Annexin V-FITC/PI流式细胞术、克隆形成实验评估
评估α-hederin对线粒体功能的影响
使用JC-1探针通过流式细胞术和荧光显微镜检测线粒体膜电位变化
评估α-hederin对细胞迁移和侵袭能力的影响
通过划痕实验和Transwell实验检测细胞迁移,并通过Western blot检测EMT相关蛋白表达
揭示α-hederin作用的分子通路
对α-hederin处理的HeLa细胞进行RNA-seq,并利用GEO数据库进行差异表达、富集和单细胞分析
检测α-hederin对细胞周期分布的影响
通过PI染色流式细胞术分析细胞周期各阶段比例
验证α-hederin是否诱导DNA损伤
通过Western blot和免疫荧光检测γ-H2AX表达
评估α-hederin对ROS水平的影响
使用DHE和DCFH-DA荧光探针通过荧光显微镜和流式细胞术检测ROS
验证CHK1在细胞周期阻滞中的作用
构建CHK1过表达HeLa稳转细胞系,分析其对α-hederin诱导G2/M阻滞的影响
验证α-hederin与CDK1和CHK1的直接结合
使用AutoDock和PyMOL进行分子对接,并通过CETSA检测蛋白热稳定性变化
评估α-hederin在体内的抗肿瘤效果
建立HeLa细胞裸鼠皮下移植瘤模型,给予α-hederin治疗,检测肿瘤体积、重量和组织学变化
探究α-hederin对肿瘤代谢的影响
对肿瘤组织进行LC-MS代谢组学分析,鉴定差异代谢物和相关通路
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Yeasen | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | α-常春藤皂苷 | MedChemExpress | HY-N0255 |
| 甲基丙胺 | MedChemExpress | HY-15620 | |
| N-乙酰半胱氨酸 | MedChemExpress | HY-B0215 | |
| 二甲基亚砜 | Solarbio | D8371 | |
| Western blot | Caspase3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP |
| Cleaved caspase3抗体 | Proteintech | 25128-1-AP | |
| PARP1抗体 | Proteintech | 13371-1-AP | |
| Cleaved-PARP1抗体 | BOSTER | Clone#HI-16 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Proteintech | 20874-1-AP | |
| N-钙黏蛋白抗体 | Proteintech | 22018-1-AP | |
| γ-H2AX抗体 | Proteintech | 83307-2-RR | |
| ATM抗体 | Proteintech | 27156-1-AP | |
| CHK1抗体 | Biodragon | BD-PT0902 | |
| P-CHK1抗体 | Proteintech | 28805-1-AP | |
| P53抗体 | Proteintech | 10442-1-AP | |
| P21抗体 | Biodragon | BD-PP1849 | |
| CDC25B抗体 | Biodragon | BD-PT0799 | |
| CDC25C抗体 | Proteintech | 16485-1-AP | |
| CyclinB2抗体 | Proteintech | 21644-1-AP | |
| CDK1抗体 | Proteintech | 10762-1-AP | |
| CCK-8实验 | CCK-8试剂 | APEXBIO | -- |
| EdU实验 | EdU | -- | -- |
| EdU检测试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 流式凋亡 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | BD Pharmingen | -- |
| 线粒体膜电位 | JC-1线粒体膜电位探针 | Invitrogen | -- |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning Costar | -- |
| 转录组测序 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| NanoDrop ND-1000分光光度计 | NanoDrop | -- | |
| Bioanalyzer 2100分析仪 | Agilent | -- | |
| Dynabeads Oligo (dT)磁珠 | Thermo Fisher | 25-61005 | |
| NEBNext镁RNA片段化模块 | NEB | E6150S | |
| SuperScript II逆转录酶 | Invitrogen | 1896649 | |
| 大肠杆菌DNA聚合酶I | NEB | m0209 | |
| RNase H | NEB | m0297 | |
| dUTP溶液 | Thermo Fisher | R0133 | |
| UDG酶 | NEB | m0280 | |
| 免疫荧光 | γ-H2AX免疫荧光染色试剂盒 | Beyotime | -- |
| ROS检测 | 二氢乙啶 | Invitrogen | -- |
| 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Beijing Viton Lever Laboratory Animal Science and Technology Co., Ltd. | -- |
| 磺胺噻唑 | -- | -- | |
| 代谢组学 | ACQUITY Premier HSS T3色谱柱 | Waters | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基(DMEM)、血清浓度(10% FBS)、抗生素浓度(100 U/mL青霉素、100 μg/mL链霉素)、培养条件(37°C、5% CO2) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 药物处理 | α-hederin浓度(如0、5、10、20 μM)、处理时间(24h、48h)、溶解溶剂(DMSO)、对照处理(等量DMSO) 阅读提示:Materials and methods: Chemical reagents; Figure legends: Fig.1, Fig.5 |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种密度(CCK-8:5×10^3/孔;EdU:1×10^5/孔;克隆形成:500/孔)、处理时间(CCK-8:48h;EdU:24h;克隆形成:48h处理+14天培养)、检测试剂(CCK-8试剂、EdU试剂盒) 阅读提示:Materials and methods: CCK8 experiments, EdU staining, Clone formation assay |
| 细胞周期分析 | 细胞密度(1×10^5/孔)、处理时间(24h)、固定(70%乙醇)、RNA酶浓度(50 μg/mL)、PI浓度(50 μg/mL)、检测仪器(BD FACSCalibur或LSRFortessa) 阅读提示:Materials and methods: Cell cycle determination using flow cytometry |
| DNA损伤检测 | 处理(α-hederin和/或MPA)、时间(24h)、检测指标(γ-H2AX表达) 阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence experiments; Results: α-hederin blocks G2/M phase via DNA damage |
| ROS检测 | 处理(α-hederin和/或NAC)、时间(24h)、探针(DHE或DCFH-DA)、浓度(10 μM) 阅读提示:Materials and methods: Reactive Oxygen Species experiments |
| CHK1过表达 | 质粒来源(ABM)、转染比例(2:1:1)、转染试剂(Lipofectamine 2000)、筛选抗生素(嘌呤霉素) 阅读提示:Materials and methods: Construction of CHK1 overexpressing stably transfected cell line |
| 动物实验 | 动物品系(BALB/c裸鼠)、周龄(6-8周)、细胞注射量(1×10^6)、给药剂量(5 mg/kg)、给药方式(腹腔或口服)、治疗时间(21天) 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments |
| 代谢组学分析 | 样本量(20 mg)、提取溶剂(甲醇:水=7:3)、色谱柱(T3柱)、梯度条件、质谱参数(正负离子模式) 阅读提示:Materials and methods: Metabolomics analysis |