检测Rap2B表达与西妥昔单抗敏感性的相关性
评估Rap2B表达水平是否与结直肠癌细胞对西妥昔单抗的敏感性相关。
用不同浓度西妥昔单抗处理四种RAS/KRAS野生型CRC细胞系,测定IC50;通过Western blot和qRT-PCR检测Rap2B表达;对西妥昔单抗耐药和敏感的患者组织进行免疫组化染色。
Rap2B-mediated reprogramming of the PI3K/AKT signaling axis drives resistance to cetuximab-targeted therapy in colorectal carcinoma.
包含体外细胞实验、体内异种移植瘤模型、临床样本免疫组化验证,以及通路抑制剂回复实验,多个证据层级支持功能与机制验证。
RKO细胞系 HT29细胞系 RKO异种移植瘤裸鼠模型 结直肠癌患者组织样本
Rap2B表达水平与西妥昔单抗IC50值的相关性 Rap2B敲低和过表达效率 PI3K/AKT通路磷酸化水平 GSK2141795(AKT抑制剂)处理浓度和方式 体内实验中西妥昔单抗和GSK2141795的给药剂量及时间
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Rap2B表达水平是否与结直肠癌细胞对西妥昔单抗的敏感性相关。
用不同浓度西妥昔单抗处理四种RAS/KRAS野生型CRC细胞系,测定IC50;通过Western blot和qRT-PCR检测Rap2B表达;对西妥昔单抗耐药和敏感的患者组织进行免疫组化染色。
建立Rap2B过表达和敲低的CRC细胞模型,用于功能研究。
通过慢病毒载体将Rap2B过表达载体转染至HT29细胞,将shRNA敲低载体转染至RKO细胞,并通过Western blot和qRT-PCR验证。
验证Rap2B表达水平对CRC细胞西妥昔单抗敏感性的功能影响。
对Rap2B过表达和敲低细胞进行CCK-8、克隆形成、EdU和流式凋亡检测,并检测凋亡相关蛋白。
在体内进一步验证Rap2B敲低是否能增强CRC对西妥昔单抗的敏感性。
将Rap2B敲低和对照RKO细胞皮下注射到裸鼠,待肿瘤体积达到约100 mm³后,给予西妥昔单抗或对照治疗,监测肿瘤生长,并检测肿瘤组织的凋亡和增殖指标。
探究Rap2B介导西妥昔单抗耐药的下游信号通路。
对Rap2B敲低和对照细胞进行转录组测序及KEGG富集分析;Western blot检测PI3K/AKT和MAPK/ERK通路蛋白;使用AKT抑制剂GSK2141795处理Rap2B过表达细胞,评估其对西妥昔单抗敏感性的影响。
验证抑制PI3K/AKT通路是否能增强西妥昔单抗在体内的抗肿瘤效果。
使用RKO异种移植瘤模型,分别给予对照、西妥昔单抗、GSK2141795及联合治疗,比较肿瘤体积和重量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 西妥昔单抗 | Merck Millipore | -- |
| Uprosertib (GSK2141795) | MedChemExpress | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | NCM Biotech | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Epizyme | -- | |
| PVDF膜 | Merck Millipore | -- | |
| Amersham Imager 600成像系统 | Cytiva | -- | |
| RT-qPCR | RNAiso试剂 | Takara Bio | -- |
| NovoScriptPlus cDNA合成试剂盒 | Novoprotein | -- | |
| SYBR Green检测试剂盒 | Novoprotein | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Zhongqiao Xinzhou | -- |
| 胎牛血清 | Royacel | -- | |
| 链霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| McCoy's 5A培养基 | Pricella | -- | |
| 青链霉素混合液 | Procell | -- | |
| MEM培养基 | Pricella | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | Kermey | -- |
| EdU试剂盒 | Beyotime | -- | |
| Hoechst染色液 | Beyotime | -- | |
| Axio显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 克隆形成实验 | 6孔板 | Servicebio | -- |
| 组织细胞固定液 | Solarbio | -- | |
| 细胞凋亡检测 | BD FACS Calibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| Annexin V-APC凋亡检测试剂盒 | KeyGEN BioTECH | -- | |
| 免疫组化 | Ki67抗体 | Abcam | -- |
| DAB显色液 | ZSGB-BIO | -- | |
| TUNEL分析 | TUNEL试剂盒 | Beyotime | -- |
| 动物实验 | GSK2141795 | MCE | -- |
| 共聚焦显微镜 | Nikon | -- | |
| 慢病毒转染 | Polybrene | GenePharma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基类型、血清浓度、抗生素浓度 阅读提示:Materials and methods 中 Specimens cell culture |
| 药物处理 | 西妥昔单抗浓度梯度、处理时间、IC50值 阅读提示:Results 中 Fig.1A 和图例,以及细胞活力测定方法 |
| 基因操作 | 慢病毒载体、shRNA序列、转染试剂、敲低效率 阅读提示:Materials and methods 中 Lentivirus construction and transfection |
| 体内实验 | 裸鼠周龄、细胞注射量、肿瘤体积启动治疗阈值、西妥昔单抗和GSK2141795剂量、给药方式及频率 阅读提示:Materials and methods 中 In vivo xenograft studies 和 结果部分 Fig.4, Fig.6 图例 |
| 机制验证 | AKT抑制剂浓度(20 μM)、处理时间、PI3K/AKT通路蛋白检测 阅读提示:Results 中 Fig.5 和图例 |