STE对细胞活力的影响
确定STE的安全浓度范围,以排除细胞毒性对后续实验的影响。
用不同浓度STE处理BMDMs和THP-1细胞12小时,然后加入CCK-8检测细胞活力。
Sophora tonkinensis enhances activation of cGAS-STING pathway and restrains HBV replication.
包含细胞实验(BMDMs、THP-1、HEK293、HepG2.2.15)、机制验证(质粒转染、cGAMP检测)和体内动物模型(HBV小鼠)等多层级实验,并进行功能验证。
BMDMs THP-1细胞 HEK293细胞 HBV小鼠模型
STE浓度:0.25, 0.5, 1 mg/mL处理BMDMs和THP-1 ISD刺激浓度:2.5 μg/mL,处理时间:2.5小时 STE对BMDMs和THP-1的细胞活力影响:浓度达2 mg/mL无细胞毒性 HBV小鼠模型:水动力注射20 μg pAAV-HBV1.2质粒,给药剂量0.2和0.4 g/kg STE,持续4周
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定STE的安全浓度范围,以排除细胞毒性对后续实验的影响。
用不同浓度STE处理BMDMs和THP-1细胞12小时,然后加入CCK-8检测细胞活力。
验证STE是否能促进cGAS-STING通路激活。
用STE预处理BMDMs和THP-1细胞1小时,再用ISD刺激2.5小时,通过免疫印迹检测p-STING、p-IRF3表达;用qPCR检测ISGs表达;用ELISA检测IFN-β水平。
验证STE对cGAS-STING通路是否具有特异性,不影响RIG-I通路。
用STE预处理BMDMs和THP-1细胞1小时,再用Poly(I:C)刺激,检测IRF3磷酸化、IFN-β产生及ISGs表达。
确定STE作用于cGAS-STING通路的上游还是下游。
在HEK293细胞中转染cGAS、STING、TBK1或IRF3-5D质粒,给予STE处理后检测IFN-β表达水平。
验证STE是否通过促进cGAS合成2′3′-cGAMP来激活通路。
用STE和ISD处理BMDMs和THP-1细胞,用ELISA检测细胞中2′3′-cGAMP的水平。
验证STE在体外是否通过激活巨噬细胞抑制HBV复制。
将HepG2.2.15细胞接种于Transwell小室,与STE处理的THP-1细胞共培养24小时,检测HBsAg、HBeAg和IFN-β水平。
通过HBV小鼠模型验证STE对HBV复制的抑制作用。
通过水动力注射pAAV-HBV1.2质粒构建HBV小鼠模型,给予STE或ETV治疗4周,检测血清HBsAg、HBeAg、HBV-DNA、ALT和AST水平,并对肝脏进行免疫组化染色检测HBcAg。
验证STE是否通过增强适应性免疫抑制HBV。
收集小鼠脾脏,通过流式细胞术检测CD4+、CD8+ T细胞及其IFN-γ+亚群的比例;通过qPCR检测肝脏组织中STING、IFN-β、TNF-α和TRIM12C的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Boster | PYG0073 |
| RPMI-1640培养基 | Boster | PYG0006 | |
| GenOpti培养基 | M&C gene technology ltd. | CT007.500 | |
| 胎牛血清 | VivaCell | C04001-500 | |
| 磷酸盐缓冲液 | EallBio | 03.15018C | |
| 小鼠巨噬细胞集落刺激因子蛋白 | MedChemExpress | HY-P7058 | |
| 细胞刺激 | 聚肌胞苷酸 | MedChemExpress | HY-107202 |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Alcatel | 111003 |
| VAMNE磁珠通用总RNA提取试剂盒 | Vazyme | ROA3301-01 | |
| 蛋白提取 | 蛋白酶抑制剂混合物 | TargetMol | C0001 |
| 转染 | StarFect转染试剂 | GenStar | C101-10 |
| 逆转录 | StarScript III逆转录试剂 | GenStar | A230-10 |
| qPCR | 2×RealStar快速SYBR qPCR预混液(低ROX) | GenStar | A304-10 |
| 细胞培养 | 氯化钠 | YangGuangBio | C090701 |
| Western blot | IRF3(磷酸化Ser396)抗体 | GenTex | GTX86691 |
| 抗IRF3(磷酸化S386)抗体 | Abcam | ab76493 | |
| 抗IRF3抗体 | Abcam | ab68481 | |
| 免疫组化 | 乙型肝炎病毒核心抗原抗体 | Abcam | ab8639 |
| Western blot | Hsp90 (5D6) 小鼠单克隆抗体 | Zenbio | 251211 |
| TMEM173/STING多克隆抗体 | Proteintech | 19851-1-AP | |
| 通用抗体稀释液 | EallBio | 02.13451-100 | |
| 流式细胞术 | FITC标记抗小鼠CD3抗体 | BioLegend | 100204 |
| PE标记抗小鼠CD4抗体 | BioLegend | 100408 | |
| PerCP/Cyanine5.5标记抗小鼠CD8a抗体 | BioLegend | 100734 | |
| APC标记抗小鼠IFN-γ抗体 | BioLegend | 505810 | |
| Zombie NIR™可固定活力试剂盒 | BioLegend | 423105 | |
| ELISA | 2′3′-cGAMP ELISA试剂盒 | Cayman Chemical | 501700 |
| LumiKine™ Xpress 小鼠IFN-β 2.0检测试剂盒 | InvivoGen | luex-mifnbv2 | |
| LumiKine™ Xpress 人IFN-β 2.0检测试剂盒 | InvivoGen | luex-hifnbv2 | |
| 蛋白提取 | 核浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0028 |
| ELISA | 人乙型肝炎e抗原ELISA试剂盒 | Wantai biopharm | ZC01803 |
| 人乙型肝炎表面抗原ELISA试剂盒 | Wantai biopharm | ZCY0503 | |
| HBV-DNA检测 | HBV-DNA定量PCR诊断试剂盒(PCR-荧光探针法) | NaGene Diagnosis | B001 |
| 细胞培养 | 骨髓来源巨噬细胞 | 文中未明确说明 | -- |
| 人急性单核细胞白血病细胞系THP-1 | Procell | CL-0233 | |
| 人胚胎肾细胞HEK-293 | Procell | CL-0001 | |
| HepG2 2.2.15细胞系 | -- | -- | |
| 质粒转染 | HA-cGAS质粒 | YouBio | -- |
| HA-STING质粒 | YouBio | -- | |
| HA-TBK1质粒 | YouBio | -- | |
| HA-IRF3-5D质粒 | YouBio | -- | |
| 动物模型 | pAAV/HBV1.2质粒 | XJ Wang (Academy of Military Medical Sciences) | -- |
| 药物处理 | 恩替卡韦 | -- | -- |
| 山豆根提取物 | Taizhou Baicao Chinese Medicine Drinks Slice Co., Ltd. | -- | |
| HPLC | PFchrom EP C18色谱柱 | -- | FX-063 |
| 细胞活力检测 | Synergy H1多功能酶标仪 | BioTek Instruments, Inc. | -- |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| 流式细胞术 | FlowJo 10.8.1软件 | FlowJo LLC | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与活力检测 | BMDMs种子密度:1.2*10^6 cells/mL;THP-1种子密度:1.2*10^6 cells/mL;STE浓度梯度;CCK-8处理时间 阅读提示:参见2.4 Cells、2.5 Cell viability assay |
| cGAS-STING通路激活实验 | STE预处理浓度及时间;ISD浓度:2.5 μg/mL;刺激时间:2.5小时(蛋白)、4小时(mRNA)、8小时(IFN-β) 阅读提示:参见2.4 Cells、3.1 Results |
| RIG-I通路验证 | Poly(I:C)浓度:2 μg/mL;STE处理时间;检测指标 阅读提示:参见2.4 Cells、3.2 Results |
| 质粒转染实验 | 质粒剂量:0.5 μg;转染时间:18小时;STE浓度:1 mg/mL;处理时间:6小时;细胞系:HEK-293 阅读提示:参见2.4 Cells、3.3 Results |
| 体外抗HBV共培养实验 | HepG2.2.15细胞种子密度:2.0*10^5;THP-1种子密度:1.2*10^6;STE浓度:1 mg/mL;共培养时间:24小时 阅读提示:参见2.4 Cells、3.4 Results |
| 动物实验 | 小鼠品系:C57BL/6J雄性,8周龄,体重18-20g;质粒剂量:20 μg;给药剂量:STE 0.2和0.4 g/kg,ETV 1 g/kg;给药方式:尾静脉注射;给药时间:连续4周;每组样本量:n=6 阅读提示:参见2.3 Animals、3.5 Results |
| 流式细胞术 | 脾脏单细胞制备方法;抗体稀释比例;孵育时间 阅读提示:参见2.9 Flow cytometry |