PCOS小鼠模型建立与验证
模拟PCOS相关的NAFLD表型,验证模型是否成功建立。
通过皮下植入DHT诱导PCOS模型,通过动情周期、卵巢组织学、血清激素水平进行验证。
Baicalin mitigates polycystic ovary syndrome‑associated non‑alcoholic fatty liver disease by inhibiting the AR/SREBP1 axis.
包含动物模型、转录组学、分子对接、ITC、荧光素酶报告基因等体外和体内多层次验证。
DHT诱导的PCOS小鼠模型(C57BL/6J小鼠) MDA-kb2细胞系
DHT皮下植入诱导PCOS模型,使用10 mg DHT,每4周更换硅胶管 黄芩苷口服剂量:低100、中200、高400 mg/kg/天,治疗8周 RNA-seq样本量:每组4个,BA中等剂量组 ITC实验:AR蛋白1 μM,BA 20 μM,25°C,确认结合常数 荧光素酶报告基因实验:MDA-kb2细胞,BA 1-30 μM,DHT 1 nM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟PCOS相关的NAFLD表型,验证模型是否成功建立。
通过皮下植入DHT诱导PCOS模型,通过动情周期、卵巢组织学、血清激素水平进行验证。
评估BA对PCOS相关NAFLD代谢异常的影响。
PCOS小鼠口服BA 8周,检测体重、内脏脂肪、血脂、肝脏脂质和肝脏组织学。
探讨BA调节脂质代谢的分子机制。
对肝脏进行RNA-seq,分析差异表达基因及通路富集。
验证BA是否调节SREBP1及其下游脂肪生成酶的表达。
通过RT-qPCR和Western blot检测肝脏中Srebp1 mRNA及SREBP1、FASN、ACC蛋白表达。
预测BA在PCOS相关NAFLD中的潜在直接靶点。
利用BATMAN-TCM预测BA靶点,与疾病靶点取交集,构建PPI网络,筛选核心基因。
预测BA与AR的结合亲和力和位点。
使用AutoDock Vina进行分子对接,分析结合能及相互作用。
通过ITC实验验证BA与AR的直接结合。
表达纯化截短AR蛋白,进行ITC实验测定结合常数。
验证BA是否抑制AR转录活性。
在MDA-kb2细胞中,用DHT激活AR,检测BA对AR活性的抑制作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 双氢睾酮 | -- | -- |
| 血清激素检测 | FSH ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | H101-1-2 |
| LH ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | H206-1-2 | |
| DHT ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | H293-1-2 | |
| 生化分析 | NEFA检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A042-2-1 |
| TG检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A110-1-2 | |
| TC检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A111-1-2 | |
| LDL-C检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A113-1-2 | |
| HDL-C检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A112-1-2 | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | 15596018 |
| Qubit 3.0荧光计 | Thermo Fisher Scientific | Q33216 | |
| 片段分析仪5300 | Agilent Technologies | M5311AA | |
| mRNA捕获磁珠2.0 | Yeasen Biotechnology | 12629ES | |
| 镁离子片段化缓冲液 | Yeasen Biotechnology | 12340ES97 | |
| Hieff NGS DNA筛选磁珠 | Yeasen Biotechnology | 12601ES75 | |
| Illumina Novaseq X Plus测序仪 | Illumina | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| HiScript III RT SuperMix逆转录试剂 | Vazyme Biotech | R333-01 | |
| ChamQ通用SYBR预混液 | Vazyme Biotech | Q711-03 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | MedChemExpress | HY-K0010 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0011 | |
| PVDF膜 | Bio-Rad Laboratories | 1620177 | |
| 抗ACTB抗体 | Proteintech Group | 81115-1-RR | |
| 抗SREBP1抗体 | Abcam | ab28481 | |
| 抗FASN抗体 | CST Biological Reagents | 3180 | |
| 抗ACC抗体 | CST Biological Reagents | 3676 | |
| HRP标记二抗 | ABclonal Technology | AS003 | |
| 化学发光试剂盒 | Yeasen Biotechnology | 36208ES60 | |
| ImageQuant LAS 4000成像系统 | Cytiva | -- | |
| 蛋白表达纯化 | E. coli Tuner (DE3)感受态细胞 | Beyotime Biotechnology | D1091S |
| 异丙基硫代半乳糖苷 | Sangon Biotech | A100487-0025 | |
| GST-Sefinose树脂 | Sangon Biotech | C600326-0500 | |
| 溶菌酶 | Beijing Solarbio Science & Technology | L1080 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Beyotime Biotechnology | D7073 | |
| 氯化镁 | Macklin Biochemical | 7786-30-3 | |
| GST 4FF标签蛋白纯化试剂盒 | Sangon Biotech | C600327-001 | |
| GST-Sefinose树脂(洗脱) | Sangon Biotech | C600325 | |
| SDS-PAGE | BSA标准品 | Beyotime Biotechnology | ST023-50g |
| 考马斯亮蓝 | Sangon Biotech | E607056-0250 | |
| 凝胶成像系统 | Ruicheng Instruments | DH200 | |
| ITC | ITC 200等温滴定量热仪 | MicroCal | -- |
| 细胞培养 | L-15培养基 | Procell Biotechnology | PM151010 |
| 胎牛血清 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 10099141C | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime Biotechnology | C0222 | |
| 活性炭剥离血清 | VivaCell Bioscientific | C3830-0050 | |
| 荧光素酶报告基因实验 | Steady Glo荧光素酶检测试剂 | Promega | E2510 |
| Berthold Junior LB9509发光检测仪 | Berthold | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄、DHT剂量、植入方式、对照组设置、模型验证标准 阅读提示:详见Materials and methods 的 Animal experiments 部分,图1。 |
| BA治疗 | BA剂量、给药途径、治疗周期、动物分组、样本量 阅读提示:详见Materials and methods 的 Animal experiments 部分,图2。 |
| 肝脏转录组测序 | 每组样本量、RNA提取方法、建库方法、测序平台、差异表达基因阈值 阅读提示:详见Materials and methods 的 RNA sequencing analysis 部分,图3。 |
| 蛋白表达验证 | 抗体信息、蛋白上样量、内参、重复次数 阅读提示:详见Materials and methods 的 Western blot analysis 部分,图4。 |
| BA-AR结合验证 | 分子对接参数、蛋白片段选择、ITC实验条件、结合常数计算结果 阅读提示:详见Materials and methods 的 Molecular docking, Protein expression and purification, Isothermal titration calorimetry 部分,图6。 |
| AR转录活性检测 | 细胞系、DHT浓度、BA浓度、处理时间、检测方法 阅读提示:详见Materials and methods 的 Androgen receptor transcriptional activity assay 部分,图7。 |