验证Piezo1对HT22神经元自噬的影响
确定Piezo1激活、抑制或敲低是否影响基础及饥饿诱导的自噬。
使用Yoda1激活Piezo1、GsMTx4抑制Piezo1、siRNA敲低Piezo1,通过Western blotting、PCR、免疫荧光和自噬检测试剂盒检测自噬水平。
Piezo1 regulates autophagy in HT22 hippocampal neurons through the Ca2+/Calpain and Calcineurin/TFEB signaling pathways.
包含体外细胞实验、基因敲低/敲除、药物干预和免疫荧光等多层级验证,并明确机制通路。
HT22小鼠海马神经元细胞系
Yoda1浓度3μM处理 GsMTx4浓度5μM处理 BAPTA-AM浓度10μM处理 PD151746浓度20μM处理 Cyclosporin A浓度1μM处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Piezo1激活、抑制或敲低是否影响基础及饥饿诱导的自噬。
使用Yoda1激活Piezo1、GsMTx4抑制Piezo1、siRNA敲低Piezo1,通过Western blotting、PCR、免疫荧光和自噬检测试剂盒检测自噬水平。
确认Piezo1诱导的LC3 II转化和p62降解依赖于自噬关键基因ATG7。
使用慢病毒介导的ATG7 shRNA敲低ATG7,检测Yoda1和饥饿对LC3 II/LC3 I比值和p62水平的影响。
判断Yoda1诱导的自噬是否依赖于细胞内Ca2+浓度升高。
使用Fluo4-AM检测细胞内Ca2+浓度,并使用BAPTA-AM螯合Ca2+后检测自噬相关蛋白表达。
确定Piezo1通过哪条Ca2+信号通路(Calpain、Calcineurin或CaMKKβ)调控自噬。
在Yoda1存在下,分别使用PD151746抑制Calpain、Cyclosporin A抑制Calcineurin、STO609抑制CaMKKβ,检测自噬标志物变化。
确认TFEB在Piezo1诱导的自噬中的关键作用。
使用TFEB siRNA敲低TFEB,检测Yoda1诱导的自噬是否减弱。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Thermo Scientific | 78510 |
| 蛋白酶磷酸酶抑制剂 | NCM biotech | P002 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 抗PIEZO1抗体 | Abclonal | A4340 | |
| 抗LC3B抗体 | Abcam | ab192890 | |
| 抗SQSTM1/p62抗体 | Abcam | ab109012 | |
| 抗TFEB抗体 | Proteintech | 13372-1-AP | |
| 抗磷酸化TFEB(Ser122)抗体 | CST | 86843S | |
| 抗ATG7抗体 | Proteintech | 10088-2-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 二抗(山羊抗兔) | Proteintech | SA00001-1 | |
| 二抗(山羊抗小鼠) | Proteintech | SA00001-2 | |
| SuperFemto ECL化学发光试剂盒 | Vazyme | -- | |
| 凝胶成像系统 | Bio-Rad | ChemiDoc MP | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Sigma | -- |
| PrimeScript RT试剂盒 | -- | -- | |
| PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 基因敲低 | PIEZO1 siRNA | RIBOBIO | siG171016103537 |
| TFEB siRNA | RIBOBIO | siG14516154705 | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| 慢病毒 | GeneChem | -- | |
| Hitrans聚凝胺 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 玻璃底细胞培养皿 | NEST | 801022 |
| 山羊血清封闭液 | ORIGENE | ZLI-9056 | |
| 抗LC3B抗体 | CST | 83506S | |
| 抗SQSTM1/p62抗体 | Abcam | ab109012 | |
| 抗TFEB抗体 | Proteintech | 13372-1-AP | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L (AF594) | ZEN-BIOSCIENCE | 550042 | |
| 山羊抗兔IgG H&L (AF488) | ZEN-BIOSCIENCE | 550037 | |
| DAPI染液 | Beyotime | C1002 | |
| 自噬检测 | 自噬检测试剂盒 | Abcam | ab139484 |
| Ca2+成像 | Fluo4-AM钙离子荧光探针 | Dojindo | -- |
| 药物处理 | Yoda1 | MCE | HY-18723 |
| GsMTx4 | Selleck | P1205 | |
| 脑源性神经营养因子 | GenScript | Z03208 | |
| BAPTA-AM | Selleck | S7534 | |
| 环孢素A | AbMole | M1831 | |
| STO609 | Selleck | S8274 | |
| PD151746 | MCE | HY-19749 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HT22细胞系,培养基DMEM+10%FBS,37°C,5%CO2 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| Piezo1调控自噬实验 | Yoda1浓度3μM,GsMTx4浓度2.5μM或5μM,饥饿处理6小时,BDNF浓度50ng/ml 阅读提示:Results: Piezo1 regulates HT22 neuronal autophagy |
| 基因敲低实验 | siRNA浓度50或100nM,转染48-72小时;慢病毒感染MOI=20,嘌呤霉素筛选浓度2μg/ml 阅读提示:Materials and methods: Gene knockdown by siRNA 和 Lentiviral infection |
| 信号通路抑制剂实验 | BAPTA-AM浓度10μM,PD151746浓度20μM,Cyclosporin A浓度1μM,STO609浓度10μM 阅读提示:Results: Piezo1 regulates autophagy through Ca2+/Calpain and Calcineurin/TFEB pathways |
| Ca2+成像 | Fluo4-AM浓度5μM,孵育45分钟 阅读提示:Materials and methods: Fluorescent Ca2+ imaging |