分析AOC1和TFAP2A在NSCLC中的表达及临床意义
评估AOC1和TFAP2A在NSCLC组织和细胞系中的表达水平及其与患者生存的关系。
利用TNMplot数据库分析AOC1和TFAP2A在NSCLC组织中的表达及AOC1高/低表达与生存的关系;通过RT-qPCR和Western blot检测临床组织样本和细胞系(16HBE、A-549、NCI-H1299)中AOC1和TFAP2A的表达。
TFAP2A promotes NSCLC malignant progression by enhancing AOC1 transcription.
包含体外细胞功能实验(增殖、迁移、凋亡、线粒体膜电位、ROS、巨噬细胞极化)、体内移植瘤模型及机制验证(CHIP、双荧光素酶报告基因),多层级验证。
非小细胞肺癌细胞系A-549 非小细胞肺癌细胞系NCI-H1299 THP-1来源的M0巨噬细胞 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型
AOC1和TFAP2A在NSCLC组织和细胞系中的表达水平 sh-AOC1和sh-TFAP2A的敲低效率及AOC1过表达效果 细胞增殖、迁移、凋亡、线粒体膜电位和ROS的检测方法及时间点 THP-1细胞经PMA诱导为M0巨噬细胞及与肿瘤细胞条件培养基共培养的条件 裸鼠移植瘤模型中的细胞接种、肿瘤体积测量时间点和IHC检测指标
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估AOC1和TFAP2A在NSCLC组织和细胞系中的表达水平及其与患者生存的关系。
利用TNMplot数据库分析AOC1和TFAP2A在NSCLC组织中的表达及AOC1高/低表达与生存的关系;通过RT-qPCR和Western blot检测临床组织样本和细胞系(16HBE、A-549、NCI-H1299)中AOC1和TFAP2A的表达。
明确AOC1对NSCLC细胞增殖、迁移、凋亡、线粒体膜电位和ROS水平以及巨噬细胞M2极化的影响。
在A-549和NCI-H1299细胞中敲低或过表达AOC1,通过EdU、伤口愈合、流式细胞术检测增殖、迁移和凋亡;使用JC-1和ROS检测试剂盒检测线粒体膜电位和ROS;通过RT-qPCR和流式细胞术检测CD163表达以评估M2极化。
验证AOC1在体内对NSCLC肿瘤生长的影响。
将稳定转染sh-NC、sh-AOC1、vector或AOC1的A-549细胞皮下注射到BALB/c裸鼠,定期测量肿瘤体积,4周后取瘤称重,并通过IHC检测AOC1和Ki-67表达。
验证TFAP2A是否作为转录因子直接结合AOC1启动子并激活其转录。
利用JASPAR数据库预测TFAP2A结合位点;采用CHIP实验验证TFAP2A与AOC1启动子的结合;通过双荧光素酶报告基因实验验证TFAP2A对AOC1启动子活性的影响(野生型和突变型)。
证明TFAP2A促进NSCLC恶性行为是通过上调AOC1实现的。
在A-549和NCI-H1299细胞中共同转染sh-TFAP2A和AOC1过表达质粒(或TFAP2A和sh-AOC1),检测细胞增殖、迁移、凋亡、线粒体膜电位、ROS和M2极化相关指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA提取 | Trizol试剂 | Jude Antai Technology Co., Ltd. | -- |
| 逆转录 | PrimeScript™逆转录试剂盒 | Takara | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green PCR预混液 | Biosharp | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| Western blot封闭 | 封闭液 | Biosharp | -- |
| Western blot(一抗) | 抗AOC1抗体 | Abcam | ab278497 |
| 抗TFAP2A抗体 | Invitrogen | PA5-17,359 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8226 | |
| Western blot(二抗) | 抗兔二抗 | Abcam | ab6721 |
| 抗鼠二抗 | Abcam | ab6728 | |
| Western blot检测 | 增强化学发光检测系统 | JIAPENG | -- |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Yuchun Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 胎牛血清 | Beyotime | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 增殖检测 | EdU检测试剂盒 | RiboBio Inc. | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Vazyme | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 巨噬细胞极化检测 | 抗CD163抗体 | Abcam | ab182422 |
| 巨噬细胞诱导 | 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Selleck | -- |
| 细胞培养(THP-1) | β-巯基乙醇 | Yubo Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| CHIP | EZ-ChIP试剂盒 | Millipore | -- |
| 抗TFAP2A抗体 | Abcam | ab108311 | |
| IHC | 抗Ki-67抗体 | Abcam | ab279653 |
| DAB显色液 | -- | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | pmirGLO载体 | Zeye Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 定点突变试剂盒 | Stratagene | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism 8 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系来源(16HBE、A-549、NCI-H1299、THP-1)及培养基和FBS浓度 阅读提示:Methods: Cell culture and treatments |
| 基因敲低与过表达 | shRNA和过表达质粒的靶序列及转染试剂和转染条件 阅读提示:Methods: Knockdown and overexpression vector construction and transfection |
| 体外功能实验 | EdU、伤口愈合、凋亡、JC-1、ROS检测的具体步骤和时间点 阅读提示:Methods: Detection of proliferation, Wound healing assay, Detection of apoptosis, Detection of mitochondrial membrane potential and ROS |
| 巨噬细胞极化实验 | PMA浓度和诱导时间,条件培养基收集方法,CD163检测抗体 阅读提示:Methods: Detection of M2 polarization marker CD206+ cell rate |
| 体内实验 | 动物品系和年龄,细胞接种数量,肿瘤体积测量频率和时间 阅读提示:Methods: Xenograft study |
| 机制实验 | CHIP实验所用抗体、细胞数量、交联和免疫沉淀条件;双荧光素酶报告基因所用载体和突变位点 阅读提示:Methods: Chromatin immunoprecipitation (CHIP), Dual luciferase reporter gene assay |