分离CAF与NF并提取外泌体
获得CAF和NF来源的外泌体,用于后续功能研究。
从NSCLC患者组织中分离原代CAF和NF,通过超速离心提取外泌体,并用NTA、TEM和Western blot进行表征。
CAF-derived exosomes drive the FGF4/SHH feedback loop by encapsulating GREM1 in non-small cell lung cancer.
包含体外巨噬细胞极化与T细胞共培养、动物原位肿瘤模型、GREM1敲低与拯救实验等多层级证据,并验证了FGF4/SHH反馈机制。
人源CAF和NF及其外泌体 人单核细胞来源的巨噬细胞 小鼠Lewis肺癌(LLC)原位移植瘤模型 C57BL/6J小鼠
CAF与NF分离来源(NSCLC患者肿瘤中心与正常组织) 外泌体注射剂量与频率(5 μg/50 μL PBS/只,隔日一次,持续14天) GREM1敲低(shRNA)及FGF4/SHH过表达(AAV)处理 原位肿瘤接种细胞数(1×10^6)及观察时间(4周)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得CAF和NF来源的外泌体,用于后续功能研究。
从NSCLC患者组织中分离原代CAF和NF,通过超速离心提取外泌体,并用NTA、TEM和Western blot进行表征。
验证CAF-exo在体内的分布及其对PMN形成的影响。
将PKH67标记的外泌体注射入小鼠尾静脉,检测肺和肝组织中巨噬细胞对外泌体的摄取,并通过免疫荧光和RT-qPCR检测PMN标志物(FN、LOX、MMP9)和免疫抑制标志物(PD-L1、CD206)的表达。
评估CAF-exo对巨噬细胞极化和T细胞功能的直接影响。
用人单核细胞来源的巨噬细胞与CAF-exo共培养,通过流式细胞术检测M1/M2标志物和PD-L1表达,ELISA检测细胞因子,并与T细胞共培养检测T细胞增殖和IFN-γ释放。
在动物水平验证CAF-exo对肿瘤生长和转移的影响。
预先用外泌体处理小鼠,然后原位接种LLC-Luc细胞,通过生物发光成像监测肿瘤生长,记录生存期,并通过HE染色和免疫荧光检测肝转移及免疫细胞浸润。
验证CAF-exo中GREM1对巨噬细胞极化和PMN形成的关键作用。
用shRNA敲低CAF中GREM1,提取外泌体,处理巨噬细胞和LLC模型小鼠,检测M2极化、免疫抑制标志物和肿瘤转移情况。
阐明GREM1下游的FGF4/SHH反馈回路及其功能重要性。
在CAF-exo处理的巨噬细胞中敲低FGF4或SHH,观察对GREM1表达和极化影响;在GREM1敲低背景下,用AAV过表达SHH或FGF4,观察对肿瘤转移的拯救效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胶原酶 | ChemeGen | CE12639 | |
| 透明质酸酶 | ChemeGen | C108116 | |
| 霍乱毒素 | ChemeGen | CP60310 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | V900933 | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞过滤器 | JingAn Biological | J00100 | |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 免疫细胞分离 | Dynabeads FlowComp人CD14试剂盒 | Invitrogen | 11367D |
| Dynabeads FlowComp人CD3试剂盒 | Invitrogen | 11365D | |
| 重组人巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- | |
| 免疫细胞激活 | Dynabeads人T细胞活化CD3/CD28 | Invitrogen | 11161D |
| 免疫细胞分离 | EasySep小鼠单核细胞分离试剂盒 | NovoBiotechnology | 19861 |
| 外泌体提取 | BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | -- |
| 外泌体标记 | PKH67绿色荧光细胞连接剂Midi试剂盒 | Sigma-Aldrich | MIDI67 |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| Alexa Fluor 647荧光偶联抗F4/80抗体 | Abcam | ab307470 | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| 抗CD11b抗体 | ABclonal | A1581 | |
| Alexa Fluor 647标记的山羊抗兔二抗 | Beyotime | A0468 | |
| 抗纤连蛋白抗体 | Abcam | ab268020 | |
| 抗赖氨酰氧化酶抗体 | Abcam | ab174316 | |
| 抗MMP9抗体 | Abcam | ab283575 | |
| 抗PD-L1抗体 | ProteinTech Group | 28076-1-AP | |
| 抗CD206抗体 | ProteinTech Group | 18704-1-AP | |
| 抗CD8抗体 | ABclonal | A11856 | |
| 抗GREM1抗体 | Affinity Biosciences | DF15419 | |
| 抗SHH抗体 | Proteintech Group | 20697-1-AP | |
| 抗FGF4抗体 | Invitrogen | PA5-115228 | |
| 抗F4/80抗体 | Proteintech Group | 28463-1-AP | |
| Alexa Fluor 488标记的抗小鼠F4/80抗体 | Novus Biologicals | NB600-404AF488 | |
| 抗小鼠CD3抗体 | Biolegend | 100212 | |
| 流式细胞术 | FITC-PD-L1 | Biolegend | 393605 |
| PE-CD206 | Biolegend | 321105 | |
| PE-CD86 | Biolegend | 374205 | |
| FITC标记的IgG同型对照 | Biolegend | 400109 | |
| FITC-CD68 | Biolegend | 333805 | |
| CytoFlex S流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 细胞因子检测 | TNF-α ELISA试剂盒 | FineTest | EH0302 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | FineTest | EH0201 | |
| IL-10 ELISA试剂盒 | FineTest | EH0173 | |
| TGF-β1 ELISA试剂盒 | FineTest | EH0287 | |
| T细胞增殖实验 | CFSE | Abmole Bioscience | M5117 |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | Cusabio Biotech | CSB-E04577h | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 | -- | -- |
| GREM1 shRNA序列 | VectorBuilder | -- | |
| GREM1敲除质粒 | Beyotime | -- | |
| FGF4/SHH过表达质粒 | VectorBuilder | -- | |
| 携带荧光素酶基因的重组慢病毒质粒 | Miaolingbio | -- | |
| 动物实验 | AAV5-SHH | VectorBuilder | -- |
| AAV5-FGF4 | VectorBuilder | -- | |
| AAV5-NC | VectorBuilder | -- | |
| 腔肠素 | AbMole | M9267 | |
| 组织学染色 | HE染色试剂盒 | Solarbio | G1120 |
| RNA提取与qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript RT试剂盒 | Takara | RR037B | |
| Premix Ex Taq | Takara | RR390A | |
| qPCR | 7500实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂 | Beyotime | -- |
| 抗GREM1抗体 | Affinity Biosciences | DF15419 | |
| 抗SHH抗体 | ProteinTech Group | 20697-1-AP | |
| 抗FGF4抗体 | Invitrogen | PA5-115228 | |
| 抗GAPDH抗体 | ProteinTech Group | 10494-1-AP | |
| 抗CD63抗体 | Abcam | ab134045 | |
| 抗CD81抗体 | Abcam | ab109201 | |
| 抗TSG101抗体 | Abcam | ab133586 | |
| 抗Calnexin抗体 | Abcam | ab22595 | |
| ECL Western blot底物试剂盒 | Abcam | ab65623 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CAF与NF分离 | 组织来源(NSCLC患者肿瘤中心与正常组织距离)、消化酶浓度(300 U/mL胶原酶、100 U/mL透明质酸酶)、培养条件(DMEM+10% FBS、5 μg/mL胰岛素) 阅读提示:方法部分“The isolation of CAF and NF” |
| 外泌体提取与表征 | 超速离心参数(100,000g 90分钟两次)、外泌体蛋白定量(BCA)、标志物(CD63、CD81、TSG101、Calnexin) 阅读提示:方法部分“Exosome extraction and characterization” |
| 外泌体体内注射实验 | 小鼠品系(C57BL/6J)、性别(雌性)、年龄(4周)、注射剂量(5 μg/50 μL PBS)、频率(隔日一次,共2周)、注射途径(尾静脉) 阅读提示:方法部分“Exosome labeling and tracking”及图1A |
| 巨噬细胞极化实验 | 人单核细胞来源(健康供者)、分化因子(M-CSF 100 ng/mL,7天)、外泌体处理浓度(40 μg/mL,24小时)、流式抗体(CD68、CD86、CD206) 阅读提示:方法部分“Isolation of monocytes and T cells”及图2B |
| 原位肺癌模型 | 细胞系(LLC-Luc)、接种细胞数(1×10^6)、接种体积(50 μL)、麻醉(异氟烷)、观察时间(4周)、AAV处理(1012 GC/mL) 阅读提示:方法部分“Metastasis model of lung orthotopic implantation”及图3A |