体外OGD/R损伤模型建立与QCT保护作用验证
评估QCT对缺血再灌注损伤后内皮细胞存活、凋亡、增殖的影响。
使用bEnd.3细胞建立OGD/R模型,不同浓度QCT处理,检测细胞活力、TUNEL凋亡、EdU增殖。
Quercetin promotes angiogenesis and protects the blood-spinal cord barrier structure after spinal cord injury by targeting the PI3K/Akt signaling pathway.
包含体外OGD/R内皮细胞模型、大鼠SCI模型、网络药理学、分子对接及动力学模拟等多个独立验证层级,并进行功能验证和机制验证。
bEnd.3内皮细胞(OGD/R模型) Sprague-Dawley大鼠脊髓损伤模型(动脉夹压迫)
bEnd.3细胞OGD/R建模:无糖DMEM缺氧6小时,再灌注6小时 QCT浓度:体外5和10 μM,体内20和50 mg/kg/天腹腔注射 PI3K抑制剂LY294002:体外10 μM,体内1.5 mg/kg/天 运动功能评估:BBB评分于术后1,3,7,14,21,28天 BSCB渗透性评估:术后第7天伊文思蓝外渗实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估QCT对缺血再灌注损伤后内皮细胞存活、凋亡、增殖的影响。
使用bEnd.3细胞建立OGD/R模型,不同浓度QCT处理,检测细胞活力、TUNEL凋亡、EdU增殖。
评估QCT对OGD/R损伤后内皮细胞迁移和管形成能力的影响。
采用划痕实验、Transwell实验和管形成实验检测细胞迁移和管形成能力。
评估QCT对OGD/R损伤后内皮细胞紧密连接蛋白ZO-1、Occludin、Claudin-5表达的影响。
通过免疫荧光和Western blot检测紧密连接蛋白表达。
评估QCT对SCI大鼠运动功能、组织损伤、血管再生和BSCB完整性的影响。
采用动脉夹压迫建立SCI模型,腹腔注射QCT 28天,评估BBB评分、MEP、H&E染色、EB外渗、Western blot和免疫荧光。
预测QCT治疗SCI的潜在分子靶点和信号通路。
利用TCMSP、Swiss Target Prediction等数据库获取QCT靶点,GeneCards等获取SCI靶点,取交集,构建PPI网络,进行GO和KEGG富集分析。
验证QCT与核心靶蛋白的结合亲和力和稳定性。
使用AutoDock进行分子对接,GROMACS进行100 ns分子动力学模拟。
验证QCT通过PI3K/Akt通路发挥作用。
通过Western blot检测p-PI3K、p-Akt表达,使用LY294002抑制PI3K,观察对细胞功能和动物BSCB的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Solarbio | -- | |
| bEnd.3细胞系 | ProCell | -- | |
| 药物处理 | 槲皮素 | Sigma-Aldrich | -- |
| LY294002 | MCE | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | -- |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | ApexBio | -- |
| 细胞增殖检测 | EdU检测试剂盒 | RiboBio | -- |
| 细胞迁移检测 | Transwell小室 | Corning | -- |
| 结晶紫 | LEAGENE | -- | |
| 管形成检测 | 基质胶 | Corning | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Sigma-Aldrich | -- |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | -- | |
| 抗CD31抗体 | abcam | ab9498 | |
| 抗ZO1抗体 | abcam | ab221547 | |
| 抗Ki67抗体 | abcam | ab15580 | |
| Western blot | 抗PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4257 |
| 抗p-PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4228 | |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4685 | |
| 抗p-Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗Claudin5抗体 | abcam | ab131259 | |
| 抗Occludin抗体 | abcam | ab216327 | |
| 抗CD31抗体 | abcam | ab9498 | |
| 抗GAPDH抗体 | abcam | ab9484 | |
| 抗兔IgG HRP标记二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| 抗小鼠IgG HRP标记二抗 | Proteintech | SA00001-1-A | |
| RIPA裂解液 | Beyotime | -- | |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | -- | |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| ECL化学发光试剂 | Bio-Rad | -- | |
| ChemiDoc™ XRS+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| 动脉夹 | Sugita | -- | |
| BSCB渗透性检测 | 伊文思蓝 | LEAGENE | -- |
| 神经电生理 | 电生理记录系统 | Taimeng Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与OGD/R处理 | bEnd.3细胞系来源(ProCell),培养基(高糖DMEM+10%FBS+1%青霉素/链霉素),OGD条件(无糖DMEM,37°C,95%N2/5%CO2,6小时),再灌注(正常培养基,21%O2,6小时) 阅读提示:Methods 细胞培养和处理部分 |
| 体外药物处理 | QCT浓度(5和10 μM),LY294002浓度(10 μM),溶剂DMSO浓度<0.1% 阅读提示:Methods 细胞培养和处理部分 |
| 细胞活力检测 | CCK-8检测细胞密度(10^4/孔),孵育时间(1小时),波长(450nm),每组5个重复 阅读提示:Methods 细胞活力检测部分 |
| 细胞凋亡和增殖检测 | TUNEL染色试剂盒(ApexBio),DAPI复染,随机6张图像;EdU试剂盒(RiboBio),Hoechst 33342复染,6个重复 阅读提示:Methods TUNEL染色和EdU实验部分 |
| 迁移和管形成实验 | 划痕实验(6孔板,90%融合,P-200枪头,0和12小时),Transwell(8μm孔径,2×10^4细胞/孔,12小时),管形成(Matrigel,4×10^4细胞/孔,12小时) 阅读提示:Methods 划痕迁移、Transwell和管形成部分 |
| 大鼠SCI模型 | 雌性SD大鼠(6-8周,250-300g),动脉夹30g压力压迫T10 1分钟,术前禁食24小时禁水8小时 阅读提示:Methods 大鼠脊髓损伤模型部分 |
| 体内药物处理 | QCT剂量(20和50 mg/kg/天),腹腔注射,28天;LY294002剂量(1.5 mg/kg/天)与QCT(50 mg/kg)联合 阅读提示:Methods 大鼠脊髓损伤模型部分 |
| 行为学评估 | BBB评分时间点(术前、术后1,3,7,14,21,28天),两位独立观察者盲评 阅读提示:Methods 行为学分析部分 |
| 神经电生理 | MEP记录:刺激电极置于运动皮层,记录电极置于后肢肌肉,参数优化以获得清晰信号 阅读提示:Methods 神经电生理部分 |
| 组织学分析 | 脊髓组织固定(4%PFA 24小时),石蜡包埋,10μm切片,H&E染色 阅读提示:Methods 组织学分析和figure legends (Fig. 4E, F) |
| BSCB渗透性 | 术后第7天,2% EB尾静脉注射,2小时后灌注,N,N-二甲基甲酰胺提取,荧光测量(激发610nm,发射680nm) 阅读提示:Methods BSCB渗透性评估部分和figure legends (Fig. 5C, D) |
| Western blot | RIPA裂解液含蛋白酶和磷酸酶抑制剂,BCA定量,SDS-PAGE电泳,抗体孵育,ECL显像;抗体信息和稀释比见表1 阅读提示:Methods Western blot部分和Table 1 |
| 免疫荧光 | 固定(4%PFA 15分钟),透化(0.1% Triton X-100 10分钟),封闭(5%BSA 1小时),一抗4°C过夜,二抗室温1小时;抗体信息和稀释比见表1 阅读提示:Methods 免疫荧光染色部分和Table 1 |
| 网络药理学分析 | 数据库(TCMSP, Swiss Target Prediction, PharmMapper, GeneCards, OMIM, TTD),筛选阈值(Swiss概率>0,PharmMapper fit≥0.7),PPI置信度>0.7 阅读提示:Methods 网络药理学分析部分 |
| 分子对接和动力学模拟 | 对接软件AutoDock 1.5.7,动力学模拟GROMACS 100 ns,300K,力场(Amber99sb和GAFF),水模型SPC 阅读提示:Methods 分子对接和分子动力学模拟部分 |