验证肿瘤微环境中趋化因子表达
确认NSCLC肿瘤微环境中CXCL13和CCL20是否高表达,以及HER2的表达情况。
利用TCGA和GTEx数据库分析HER2、CXCL13、CCL20等表达,并在临床肺腺癌组织及细胞系中通过Western blot、qRT-PCR和ELISA验证。
Enhanced homing and efficacy of HER2-CAR T cells via CXCR5/CCR6 co-expression for HER2-positive NSCLC.
包含体外细胞实验(细胞毒性、增殖、迁移)、体内原位异种移植瘤模型及生存分析,并涉及患者样本验证和机制探讨,多个证据层级。
HCC827细胞系 HCC827-Luc原位肺癌异种移植瘤小鼠模型 NSG小鼠
HER2-CAR T细胞共表达CXCR5和CCR6 体外细胞毒性实验的效靶比(1:1至20:1) 体内实验的T细胞输注剂量(1×10^7细胞/只)和给药时间(第14天和第28天) 肿瘤负荷监测(生物发光≥80,000 p/s)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认NSCLC肿瘤微环境中CXCL13和CCL20是否高表达,以及HER2的表达情况。
利用TCGA和GTEx数据库分析HER2、CXCL13、CCL20等表达,并在临床肺腺癌组织及细胞系中通过Western blot、qRT-PCR和ELISA验证。
构建表达HER2-CAR及共表达CXCR5和CCR6的CAR T细胞,并验证其表面标志物表达。
设计HER2-CAR和HER2-CXCR5-CCR6-CAR慢病毒载体,转导T细胞,通过流式细胞术检测HER2-CAR、CXCR5和CCR6的表达。
评估共表达CXCR5和CCR6对HER2-CAR T细胞抗原识别、细胞毒性、增殖和迁移能力的影响。
通过CD69激活实验、LDH释放实验、CCK-8增殖实验和Transwell迁移实验,比较不同CAR T细胞的功能。
在体内模型中验证共表达CXCR5和CCR6的HER2-CAR T细胞的抗肿瘤效果和安全性。
建立HCC827-Luc原位肺癌小鼠模型,分组静脉输注不同CAR T细胞,监测肿瘤生长、生存率、外周血和肿瘤内CAR T细胞比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | HyClone | -- |
| RPMI 1640培养基 | HyClone | -- | |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | 23225 | |
| SDS-PAGE凝胶 | Epizyme | PG112/PG113 | |
| 分子量标准品 | Epizyme | WJ103 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 抗HER2抗体 | Abcam | ab134182 | |
| 抗CXCL13抗体 | Abcam | ab272874 | |
| 抗CCL20抗体 | Cell Signaling | 769245 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| qPCR | DNeasy血液和组织试剂盒 | TIANGEN | -- |
| ABI 7500实时荧光定量PCR系统 | ABI | -- | |
| CAR构建 | pCDH慢病毒载体 | -- | -- |
| 生工生物 | Sangon Biotech | -- | |
| 流式分析 | 抗人G4S-PE抗体 | Cell Signaling Technology | 38907 |
| 抗人CXCR5-PerCp-Cy7抗体 | BD Biosciences | 562781 | |
| 抗人CCR6-PE-Cy7抗体 | BD Biosciences | 560620 | |
| CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| FlowJo软件 | Tree Star | -- | |
| CD69激活实验 | 抗CD69抗体 | BioLegend | 310906 |
| 细胞毒性实验 | 乳酸脱氢酶释放试剂盒 | Promega | -- |
| 细胞因子检测 | 酶联免疫吸附测定试剂盒 | eBioscience | -- |
| 细胞增殖实验 | 细胞计数试剂盒-8 | Yeasen Biotech | -- |
| 迁移实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| 重组人IL-2 | PeproTech | -- | |
| 重组趋化因子CXCL13 | YEASEN | -- | |
| 重组趋化因子CCL20 | YEASEN | -- | |
| 动物实验 | 三溴乙醇 | -- | -- |
| D-荧光素 | Promega | -- | |
| IVIS Spectrum成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 流式分析 | 抗人CD3-PE | BioLegend | 980008 |
| 抗人CD8-FITC | BioLegend | 98090 | |
| HER-2-PerCP抗体 | BioLegend | 324416 | |
| 肿瘤消化 | 小鼠肿瘤解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-096-730 |
| 流式分析 | PD-1-APC抗体 | BioLegend | 379208 |
| 免疫组化 | 抗CD4抗体 | Abcam | EPR685 |
| CD8α抗体 | Abcam | CAL66 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件,如HCC827使用RPMI 1640加10%胎牛血清,BEAS-2B等使用DMEM 阅读提示:Materials and methods: Cell lines |
| 趋化因子表达分析 | 数据库来源(TCGA、GTEx)和样本数量(483例LUAD vs 347例正常) 阅读提示:Materials and methods: Chemokine expression analysis; Results: Chemokine expression in NSCLC |
| CAR T细胞构建 | 载体构建(pCDH),CAR结构(scFv、CD8α铰链/跨膜、4-1BB/CD28共刺激、CD3ζ),CXCR5和CCR6序列插入 阅读提示:Materials and methods: CAR design and synthesis |
| 体外功能实验 | 效靶比、共培养时间、细胞因子检测方法,如细胞毒性实验采用LDH释放试剂盒,效靶比1:1至20:1 阅读提示:Materials and methods: Cytotoxicity and cytokine release assays in vitro; Figure 2 |
| 体内实验 | 小鼠品系(NSG)、肿瘤细胞接种量(1×10^6)、T细胞输注剂量(1×10^7)和时间(第14、28天) 阅读提示:Materials and methods: Xenograft tumor model and in vivo evaluation; Figure 4 |