构建SAH体外细胞模型
模拟蛛网膜下腔出血后的细胞损伤环境,研究小胶质细胞反应。
用25 μmol/L OxyHb处理BV-2细胞或原代小鼠小胶质细胞24小时。
Ubiquitin-specific peptidase 30-mediated deubiquitination of forkhead box O3 promotes the progression of subarachnoid hemorrhage by regulating cGAS/STING pathway.
包含体外细胞模型(BV-2和原代小胶质细胞)功能及机制验证(去泛素化、mRNA稳定性、通路激活),但无动物模型或临床样本验证。
OxyHb诱导的BV-2小胶质细胞 OxyHb诱导的原代小鼠小胶质细胞
OxyHb处理浓度25 μmol/L、时间24小时 siRNA及过表达质粒转染使用Lipofectamine 3000 MG132处理浓度及时间(24小时) CHX处理浓度25 μg/ml及时间点0、5、10、15、20小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟蛛网膜下腔出血后的细胞损伤环境,研究小胶质细胞反应。
用25 μmol/L OxyHb处理BV-2细胞或原代小鼠小胶质细胞24小时。
验证FOXO3对OxyHb诱导的小胶质细胞损伤的影响。
转染si-FOXO3后检测细胞活力、增殖、炎症因子分泌、M1极化标志物和焦亡相关蛋白表达。
验证USP30是否通过去泛素化调控FOXO3表达。
通过敲低或过表达USP30,检测FOXO3 mRNA和蛋白水平,并使用MG132和CHX分析蛋白质稳定性,通过Co-IP和泛素化实验检测相互作用及泛素化水平。
验证USP30是否通过依赖FOXO3的方式促进小胶质细胞损伤。
在OxyHb诱导的BV-2细胞中共转染si-USP30和OE-FOXO3,检测细胞活力、增殖、炎症、极化和焦亡指标。
验证ELAVL1是否结合FOXO3 mRNA并增强其稳定性。
通过RIP实验验证ELAVL1与FOXO3的相互作用,敲低ELAVL1后检测FOXO3表达,并用Act D处理分析mRNA稳定性。
验证USP30上调FOXO3是否激活cGAS/STING通路。
在OxyHb诱导的BV-2细胞中敲低USP30或同时过表达FOXO3,检测cGAS蛋白和p-STING/T-STING比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Procell | PM150210 |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 小胶质细胞培养基 | Procell | CM-M110 | |
| 氧合血红蛋白 | -- | -- | |
| 转染 | 脂质体3000 | Invitrogen | L3000001 |
| 药物处理 | MG132 | Yeasen | 52801ES08 |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | P0013B |
| 聚偏二氟乙烯膜 | -- | -- | |
| 抗FOXO3抗体 | Abcam | ab70315 | |
| 抗NLRP3抗体 | Abcam | ab263899 | |
| 抗Cleaved-Caspase-1抗体 | Abmart | TA4005M | |
| 抗pro-Caspase-1抗体 | Abcam | ab179515 | |
| 抗GSDMD-F抗体 | CST | 39754 | |
| 抗GSDMD-N抗体 | CST | 10137 | |
| 抗USP30抗体 | Proteintech | 15402-1-AP | |
| 抗ELAVL1抗体 | Abcam | ab200342 | |
| 抗cGAS抗体 | Abcam | ab252416 | |
| 抗磷酸化STING抗体 | CST | 72971 | |
| 抗总STING抗体 | CST | 13647 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| 二抗 | Abcam | ab205718 | |
| 增强化学发光试剂 | Beyotime | P0018S | |
| 细胞增殖检测 | CCK8试剂 | Beyotime | C0037 |
| BeyoClick EdU细胞增殖试剂盒 | Beyotime | C0071S | |
| ELISA | 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0007 |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0034 | |
| 流式细胞术 | 藻红蛋白标记的抗小鼠CD86抗体 | Abcam | ab233571 |
| FACScalibur流式细胞仪 | -- | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| cDNA合成试剂盒 | Takara | RR716 | |
| SYBR Green荧光染料 | Takara | RR820A | |
| Co-IP | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Beyotime | P2197M |
| RIP | 蛋白A/G磁珠 | Beyotime | P1801S |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与SAH模型建立 | 细胞类型、培养基、OxyHb浓度和处理时间 阅读提示:见Materials and methods: Cell culture, treatment, and transfection |
| 基因敲低和过表达 | siRNA和过表达质粒序列、转染试剂、剂量和时间 阅读提示:见Materials and methods: Cell culture, treatment, and transfection |
| 蛋白表达检测 | 抗体稀释比例、孵育条件 阅读提示:见Materials and methods: Western blot |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种密度、CCK8和EdU处理时间 阅读提示:见Materials and methods: Cell counting kit 8 assay, 5-ethynyl-2'-deoxyuridine assay |
| 炎症因子检测 | ELISA试剂盒货号、操作步骤 阅读提示:见Materials and methods: ELISA |
| 流式细胞术检测M1极化 | 细胞数量、抗体孵育时间 阅读提示:见Materials and methods: Flow cytometry |
| 泛素化检测 | 转染HA-Ub、IP抗体、洗脱条件 阅读提示:见Materials and methods: Ubiquitination assay |
| mRNA稳定性检测 | Act D浓度、处理时间点 阅读提示:见Materials and methods: mRNA stability assay |