建立DR体内模型
模拟糖尿病视网膜病变的病理状态,评估TRAP1表达变化。
使用STZ诱导SD大鼠建立DR模型,分为对照组、4周、8周、12周组,高脂饮食喂养,腹腔注射STZ,通过HE染色验证模型成功,并检测视网膜TRAP1表达。
TRAP1 Improves Diabetic Retinopathy by Preserving Mitochondrial Function.
包含STZ诱导的糖尿病大鼠模型、ARPE-19细胞体外模型、TRAP1过表达/敲低、RNA-seq、CO-IP、铁死亡相关检测等多层级实验,并进行功能验证和机制验证。
STZ诱导的糖尿病SD大鼠模型 ARPE-19人视网膜色素上皮细胞系
STZ注射剂量:35 mg/kg,腹腔注射 高糖处理浓度和时间:50 mM葡萄糖处理1-6天 细胞处理分组:对照组、TRAP1过表达、TRAP1敲低 铁死亡抑制剂Fer-1和诱导剂Erastin的使用 线粒体功能检测:JC-1、Calcein AM、TEM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟糖尿病视网膜病变的病理状态,评估TRAP1表达变化。
使用STZ诱导SD大鼠建立DR模型,分为对照组、4周、8周、12周组,高脂饮食喂养,腹腔注射STZ,通过HE染色验证模型成功,并检测视网膜TRAP1表达。
在细胞水平模拟高糖环境,研究TRAP1表达及线粒体功能变化。
使用ARPE-19细胞,在不同葡萄糖浓度(25、33、40、50、100 mM)处理,并选择50 mM处理1-6天作为高糖组,检测细胞活力、ROS、线粒体膜电位、mPTP、线粒体超微结构及TRAP1表达。
验证TRAP1对高糖诱导的细胞损伤和线粒体功能障碍的保护作用。
通过慢病毒转染构建TRAP1过表达和敲低的ARPE-19细胞系,在高糖条件下检测细胞活力、ROS、线粒体膜电位、mPTP、线粒体超微结构等。
探究TRAP1敲低对基因表达和信号通路的影响。
对shTRAP1细胞和对照细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因,并进行GO和KEGG富集分析。
验证TRAP1是否通过抑制铁死亡保护细胞,并探究其分子机制。
在TRAP1过表达或敲低细胞中,加入铁死亡诱导剂Erastin或抑制剂Fer-1,检测细胞活力、MDA、Fe2+、GSH/GSSG、脂质ROS,并通过CO-IP验证TRAP1与ACSL1、ACSL4、CYB5R1的相互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型诱导 | 链脲佐菌素 | Solarbio | S8050 |
| 细胞培养 | 无水葡萄糖 | BioFroxx | 1179GR500 |
| 细胞处理 | Erastin | Selleck Chemicals | S7242 |
| 铁死亡抑制剂-1 | Selleck Chemicals | S7243 | |
| Z-VAD-FMK | Selleck Chemicals | S7023 | |
| 3-甲基腺嘌呤 | Selleck Chemicals | S2767 | |
| Necrostatin-1 | Selleck Chemicals | S8037 | |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | Beyotime | ST551 |
| 蛋白质印迹 | 预染蛋白标记物 | Thermo Fisher | 26617 |
| TRAP1多克隆抗体 | Proteintech | 10325-1-AP | |
| β-肌动蛋白多克隆抗体 | Proteintech | 20536-1-AP | |
| COXIV多克隆抗体 | Proteintech | 11242-1-AP | |
| Tom20多克隆抗体 | Proteintech | 11802-1-AP | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG(H+L) | Proteintech | SA00001-2 | |
| 免疫荧光 | CoraLite594标记的山羊抗兔IgG(H+L) | Proteintech | SA00013-4 |
| CoraLite488标记的山羊抗小鼠IgG(H+L) | Proteintech | SA00013-1 | |
| 动物实验 | 高脂饮食(45%脂肪) | Synergistic Biologics | XTHF45-1 |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Procell | CL-0026 |
| 胎牛血清 | Procell | 164210 | |
| DMEM/F12培养基 | KeyGEN Biotech | KGM12500-500 | |
| RNA提取试剂 | Vazyme | R401-01 | |
| RT-qPCR | HiScript III一步法逆转录预混液 | Vazyme | R333 |
| Taq Pro通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q712 | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | NCM Biotech | WB3100 |
| 蛋白酶抑制剂 | KeyGEN Biotech | KGP603 | |
| 磷酸酶抑制剂 | KeyGEN Biotech | KGP602 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | KeyGEN Biotech | KGP902 | |
| ExpressCast PAGE彩色凝胶快速试剂盒 | NCM Biotech | P2012 | |
| 快速转膜缓冲液 | NCM Biotech | WB4600 | |
| 增强化学发光检测 | NCM Biotech | P2300 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8细胞增殖检测试剂盒 | KeyGEN Biotech | KGA317 |
| ROS检测 | 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | KeyGEN Biotech | KGT010-1 |
| 免疫荧光 | 20×Tris-EDTA抗原修复液(pH9.0) | Servicebio | G1203 |
| Triton X-100 | Beyotime | P0096 | |
| 山羊血清 | Solarbio | SL038 | |
| 通用组织固定液 | Servicebio | G1101 | |
| 抗淬灭封片剂(含DAPI) | Beyotime | P0131 | |
| 显微镜成像 | AxioImager M2显微镜 | Zeiss | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1检测试剂盒 | KeyGEN Biotech | KGA603-1 |
| 线粒体通透性转换孔检测 | 线粒体通透性转换孔检测试剂盒 | Beyotime | C2009S |
| 透射电镜 | 醋酸铀 | -- | -- |
| 柠檬酸铅 | -- | -- | |
| Leica UC-7超薄切片机 | Leica | -- | |
| JEOL JEM-1400透射电镜 | JEOL | -- | |
| Gatan Orius SC1000 CCD相机 | Gatan | -- | |
| MDA检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131S |
| Western和IP细胞裂解液 | NCM Biotech | P70100 | |
| 铁离子检测 | 亚铁离子检测试剂盒 | Solarbio | BC5415 |
| 脂质ROS检测 | C11-BODIPY 581/591探针 | Thermo Fisher | D3861 |
| RNA-seq | NanoPhotometer®分光光度计 | Thermo Fisher | -- |
| Agilent 2100 RNA Nano 6000检测试剂盒 | Agilent Technologies | -- | |
| 统计 | GraphPad Prism 9.5.1 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | SD大鼠性别、周龄、体重;STZ剂量、给药方式、高脂饮食时间 阅读提示:Methods: Experimental Animals |
| 体外高糖模型 | ARPE-19细胞来源;葡萄糖浓度、处理时间 阅读提示:Methods: Cell Culture |
| TRAP1过表达/敲低 | 慢病毒构建、感染MOI、筛选浓度 阅读提示:Methods: Construction of Overexpression and Knockdown Cell Lines |
| 线粒体功能检测 | JC-1检测膜电位、Calcein AM检测mPTP、TEM观察超微结构 阅读提示:Methods: Detection of Mitochondrial Membrane Potential, Detection of Mitochondrial Permeability Transition Pore, Transmission Electron Microscopy |
| 铁死亡检测 | Erastin和Fer-1浓度、处理时间;MDA、Fe2+、GSH/GSSG、脂质ROS检测方法 阅读提示:Methods: Malondialdehyde (MDA) Assay, Iron (Fe2+) Assay, Determination of GSH/GSSG Activity, Lipid ROS Assay |