RAB GTP酶在预测胰腺癌预后和治疗反应中的作用

背景：小GTP酶Rab家族（RABs）调节膜运输，并参与肿瘤进展。胰腺癌（PC）是一种高度侵袭性的恶性肿瘤，缺乏有效的治疗策略。通过生物信息学和实验验证，我们确定了五个RABs（RAB10、RAB11A、RAB39B、RAB28和RAB11B）来构建PC的RAB预后模型（RPM）。方法：使用Cox和LASSO回归分析TCGA和GEO的数据集来建立RPM。开发了将RPM与临床特征相结合的预后列线图。进行了微环境和药物敏感性分析，以预测RPM评分与治疗反应之间的关系。进行了体外实验（CCK8、MDA检测、慢病毒敲低、qPCR和western blot）以验证RAB39B在自噬依赖性铁死亡中的作用。结果：RPM将患者分为高风险和低风险组，高风险患者的总体生存期较短。低风险组表现出更丰富的免疫浸润、更高的HLA表达、更高的功能障碍T细胞评分和更低的肿瘤突变负荷，提示存在耗竭的肿瘤免疫微环境，可能从免疫治疗中获益。高风险组对axitinib、gefitinib、imatinib、methotrexate、nilotinib和sunitinib的反应性显著降低，而对erlotinib、lapatinib和sorafenib的敏感性增强。相关性分析进一步确定RAB39B是治疗反应的关键调节因子。体外实验表明，RAB39B敲低降低了铁死亡诱导性并抑制了LC3-II的积累，表明RAB39B在自噬依赖性铁死亡中的作用。结论：RPM可作为PC的稳健预后工具。RAB39B驱动自噬依赖性铁死亡并影响药物敏感性，为PC提供治疗见解。