建立耐顺铂细胞系并验证耐药性
建立SCC9-CisR细胞系并确认其对顺铂的耐药性及与HIF-1α的关联。
通过逐步增加顺铂浓度处理SCC9细胞建立SCC9-CisR。使用CCK-8检测IC50和细胞活力,流式细胞术检测凋亡,肿瘤球形成实验检测干性,RT-qPCR检测CD44和SOX2 mRNA,Western blot检测HIF-1α蛋白。
Rhaponitin Reverses Cisplatin Resistance and Impairs Cancer Stemness Through HIF-1α/MCT4/Wnt Pathway in Tongue Squamous Cell Carcinoma.
包含体外细胞实验(CCK-8、流式凋亡、肿瘤球、RT-qPCR、Western blot、双荧光素酶报告基因)和体内异种移植模型,并进行HIF-1α敲低/过表达功能验证及机制研究。
SCC9人舌鳞状细胞癌细胞系 SCC9-CisR耐顺铂细胞系 BALB/c裸鼠皮下异种移植瘤模型
SCC9-CisR细胞通过逐步增加顺铂浓度(10^-7 mol/L至10^-5 mol/L)建立 Rha处理浓度:10 μM(体外实验),20 mg/kg(体内实验) 顺铂处理浓度:4.14 μM(体外),4 mg/kg(体内) HIF-1α敲低使用siHIF-1α#2,过表达使用pCMV6-HIF-1α载体 体内实验分组:SCC9-CisR+ saline+DMSO、+Cis、+Rha、+Cis+Rha,每组6只
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立SCC9-CisR细胞系并确认其对顺铂的耐药性及与HIF-1α的关联。
通过逐步增加顺铂浓度处理SCC9细胞建立SCC9-CisR。使用CCK-8检测IC50和细胞活力,流式细胞术检测凋亡,肿瘤球形成实验检测干性,RT-qPCR检测CD44和SOX2 mRNA,Western blot检测HIF-1α蛋白。
检测Rha是否影响HIF-1α mRNA和蛋白水平及其转录活性。
用不同浓度Rha处理SCC9-CisR细胞,RT-qPCR检测HIF-1α mRNA,Western blot检测蛋白,双荧光素酶报告基因检测HIF-1α转录活性。
评估Rha单独或联合顺铂对SCC9-CisR细胞活力、凋亡和干性的影响。
CCK-8检测细胞活力,流式细胞术检测凋亡,肿瘤球形成实验和RT-qPCR检测干性标志物。同时进行HIF-1α过表达和敲低实验验证机制。
在皮下异种移植模型中验证Rha联合顺铂对肿瘤生长和干性的影响。
将SCC9或SCC9-CisR细胞皮下注射到BALB/c裸鼠,分为不同处理组,每日给药30天,测量肿瘤体积和重量,Western blot检测凋亡相关蛋白,RT-qPCR检测干性标志物。
探究Rha是否通过HIF-1α/MCT4轴抑制Wnt/β-catenin信号通路。
利用GSE115119数据库和iRegulon筛选HIF-1α靶基因,Western blot检测MCT4表达,以及细胞质和细胞核中Wnt通路蛋白水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Procell | PM150312 |
| 胎牛血清 | Thermo | 10100 | |
| 氢化可的松 | Invivochem | 50-23-7 | |
| 青霉素-链霉素 | Procell | PB180120 | |
| 药物处理 | 顺铂 | Sigma | P4394 |
| 细胞转染 | RiboFECT CP转染试剂盒 | Ribobio | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | Beyotime | C0037 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/碘化丙啶双染试剂盒 | Solarbio | CA1020 |
| 肿瘤球形成 | B27添加剂 | Thermo | 17504044 |
| 人表皮生长因子 | Yeasen | 92701ES60 | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | Yeasen | 91334ES50 | |
| RNA提取 | MolPure细胞/组织总RNA提取试剂盒 | Yeasen | 19221ES |
| cDNA合成 | Hifair AdvanceFast第一链cDNA合成试剂盒 | Yeasen | 11149ES |
| RT-qPCR | Hieff UNICON通用型蓝色qPCR SYBR Green预混液 | Yeasen | 11184ES |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | P0010 |
| Western blot | QuickBlock封闭液 | Beyotime | P0228 |
| 增强化学发光检测系统 | Beyotime | P0018 | |
| 双荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| 微孔板读数 | Infinite 200 PRO酶标仪 | TECAN | -- |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 显微镜 | 显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | SCC9细胞系来源(Procell, #CL-0571),培养基成分(DMEM/F12 + 10% FBS + 400 ng/mL氢化可的松 + 1%青霉素-链霉素),培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.1 |
| 耐药细胞系建立 | 顺铂浓度梯度(10^-7至10^-5 mol/L),处理时间(未明确说明逐步加药的时间间隔) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.1 |
| 药物处理 | 顺铂处理浓度(4.140 μM),Rha处理浓度(10 μM),处理时间(Rha预处理12小时,顺铂处理24小时) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.3 |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度(1×10^3 cells/well),处理时间(24小时),CCK-8孵育时间(2小时),检测波长(450 nm) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.4 |
| 凋亡检测 | 染色试剂盒(Annexin V-FITC/PI),处理时间(24小时),流式细胞仪型号(BD) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.5 |
| 肿瘤球形成 | 细胞接种密度(1×10^3),培养时间(14天),培养基成分(血清-free DMEM/F12 + B27 + EGF + bFGF各20 ng/mL),计数标准(>50 μm) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.6 |
| RT-qPCR | RNA纯度要求(A260/A280 1.8-2.0),cDNA合成量(1 μg RNA),使用仪器(ABI7500),相对定量方法(2^-ΔΔCq) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.7 |
| Western blot | 蛋白提取缓冲液(RIPA),BCA定量,抗体信息(见表S2),内参蛋白(未明确说明) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.8 |
| 双荧光素酶报告实验 | 质粒(pGL3-HRE, pRL-SV40),细胞接种密度(1×10^3),Rha浓度(0-60 μM),处理时间(24小时) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.9 |
| 动物实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠),性别(雄性),年龄(4-6周),体重(18-23 g),细胞注射量(5×10^5 cells),给药方式(灌胃),剂量(Cis 4 mg/kg, Rha 20 mg/kg),给药频率(每日),持续时间(30天),分组(4组,每组6只) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.10 |
| 生物信息学分析 | GEO数据集GSE115119,差异表达基因阈值(p<0.05, |fold change|≥1),iRegulon插件用于转录因子预测 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.11 |