衍生物合成与筛选
设计并合成90种3,4-断系羽扇豆烷三萜衍生物,筛选出对TNBC细胞具有高细胞毒性的候选化合物。
以chiisanogenin和化合物MH为先导化合物,通过取代反应合成90种衍生物,并通过MTT法检测对七种人肿瘤细胞系的细胞毒性,筛选出活性最高的化合物Ⅰ-27。
Design and synthesis of 3,4-seco-Lupane triterpene derivatives: targeting tumor angiogenesis and inducing apoptosis in triple-negative breast cancer.
包含体外细胞实验(增殖、迁移、侵袭、凋亡)、转录组学、体内小鼠模型(皮下瘤和肺转移模型)及基因敲除验证,证据层级丰富且含机制验证。
MDA-MB-231细胞系 4T1细胞系 BALB/C小鼠4T1移植瘤模型 鸡胚绒毛尿囊膜模型
化合物Ⅰ-27浓度(0.125–2.0 μM)及处理时间(12–48 h) 体内给药剂量(10、20 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续14天) 4T1细胞接种浓度(3×10^6/mL和1×10^7/mL)及小鼠分组 ID1敲低序列(KD-ID1)及转染方法(Lipofectamine 2000)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
设计并合成90种3,4-断系羽扇豆烷三萜衍生物,筛选出对TNBC细胞具有高细胞毒性的候选化合物。
以chiisanogenin和化合物MH为先导化合物,通过取代反应合成90种衍生物,并通过MTT法检测对七种人肿瘤细胞系的细胞毒性,筛选出活性最高的化合物Ⅰ-27。
验证化合物Ⅰ-27对TNBC细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。
通过克隆形成、EDU、Transwell、划痕和Hoechst 33342/PI染色实验,检测化合物Ⅰ-27对MDA-MB-231细胞的作用。
探索化合物Ⅰ-27作用的差异表达基因及相关信号通路。
对化合物Ⅰ-27处理的MDA-MB-231细胞进行转录组测序,分析DEGs、GO和KEGG富集。
验证化合物Ⅰ-27通过ID1/TSP-1通路抑制血管生成、通过PI3K/AKT/FoxO1通路诱导凋亡。
通过RT-qPCR和Western blot检测相关基因和蛋白的表达变化,并通过分子对接分析化合物Ⅰ-27与PI3K的结合。
验证化合物Ⅰ-27在体内对肿瘤生长和肺转移的抑制作用。
建立4T1皮下移植瘤模型和肺转移模型,给予不同剂量化合物Ⅰ-27,检测肿瘤体积、生存期、Ki67、CD31和TUNEL染色等。
验证ID1是化合物Ⅰ-27抑制血管生成和转移的关键靶点。
使用KD-ID1质粒敲低4T1细胞中ID1表达,通过Western blot验证敲低效果,并在体内模型中观察肿瘤生长和转移变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞活性检测 | 噻唑蓝 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| 细胞增殖检测 | 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| 细胞侵袭实验 | 基质胶 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| 细胞染色 | 结晶紫染色液 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| 凋亡检测 | Hoechst 33342/PI凋亡检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript™逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白检测试剂盒 | Solabio | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗ID1抗体 | Wanlei Life Sciences Co., Ltd. | -- | |
| 抗TSP-1抗体 | Wanlei Life Sciences Co., Ltd. | -- | |
| 抗PI3K抗体 | Wanlei Life Sciences Co., Ltd. | -- | |
| 抗p-PI3K抗体 | Wanlei Life Sciences Co., Ltd. | -- | |
| 抗AKT抗体 | Wanlei Life Sciences Co., Ltd. | -- | |
| 抗p-AKT抗体 | Wanlei Life Sciences Co., Ltd. | -- | |
| 抗FoxO1抗体 | Wanlei Life Sciences Co., Ltd. | -- | |
| 抗β-actin抗体 | Wanlei Life Sciences Co., Ltd. | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668030 |
| 体内实验 | 盐酸阿霉素 | -- | -- |
| BALB/C小鼠 | -- | -- | |
| RT-qPCR | SYBR Green预混液 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 化合物合成 | 中间体合成条件:溶解比例(固液比=1:20)、反应温度(95°C)、反应时间(24 h)等;氨基酸保护步骤:Cbz-Cl、Boc2O、H2/Pd-C等条件 阅读提示:见2.1合成方法与路线 |
| 细胞培养 | 细胞系(MCF-7、MDA-MB-231等)来源及培养条件(培养基、血清浓度、CO2浓度、温度) 阅读提示:见2.4细胞培养 |
| 细胞活性检测 | MTT法:细胞密度(1×10^5/mL)、处理时间(48 h)、MTT浓度和时间、测量波长(570 nm) 阅读提示:见2.5细胞毒性实验 |
| 体外功能实验 | 克隆形成、EDU、凋亡、迁移侵袭实验的浓度和处理时间 阅读提示:见2.6-2.9 |
| 转录组学 | RNA提取方法、测序平台及数据分析流程(差异表达基因筛选标准) 阅读提示:见2.10转录组测序 |
| 体内实验 | 动物品系、性别、周龄、细胞接种浓度、给药剂量和途径、实验周期 阅读提示:见2.14体内实验 |