临床样本分析
比较绝经后女性不同骨密度人群血清中维生素K2水平的差异。
收集绝经后女性静脉血样本,通过双重X射线吸收测定法测量骨密度,并使用质谱分析测定血清VK2水平。
Vitamin K2 inhibits PGE2-mediated osteoblast ferroptosis by upregulation of CBR1 via the Nrf2/Keap1 pathway.
包含人群血清样本、OVX小鼠模型、细胞实验、代谢组学与转录组学、分子对接及机制验证等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
去卵巢(OVX)小鼠骨质疏松模型 MC3T3-E1小鼠成骨细胞系 绝经后女性血清样本
人群血清VK2水平与骨密度分组 OVX小鼠分组及VK2给药剂量(20 mg/kg/d,灌胃8周) 细胞实验中VK2浓度(10^-5 M)及RSL-3浓度(1 μM) siRNA敲低CBR1和FPN PGE2处理浓度(10 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较绝经后女性不同骨密度人群血清中维生素K2水平的差异。
收集绝经后女性静脉血样本,通过双重X射线吸收测定法测量骨密度,并使用质谱分析测定血清VK2水平。
验证维生素K2对卵巢切除(OVX)小鼠骨质疏松的改善作用。
通过OVX建立小鼠骨质疏松模型,给予VK2灌胃8周,通过micro-CT、Goldner trichrome染色、钙黄绿素标记评估骨量和骨形成率。
评估维生素K2对成骨细胞活性和分化的影响。
使用MC3T3-E1成骨细胞,通过CCK-8检测细胞活力,Western blot检测RUNX2和COL1表达,茜素红染色和ALP染色评估矿化和分化。
探索VK2作用的分子通路和差异代谢物及基因。
对小鼠骨组织进行非靶向代谢组学分析,对成骨细胞进行转录组学测序,通过KEGG富集分析等筛选关键代谢物和基因。
阐明VK2上调Nrf2并促进CBR1表达的分子机制。
使用Western blot、RT-qPCR、分子对接、EMSA、ChIP-qPCR、免疫沉淀(IP)、Co-IP和免疫荧光实验验证VK2与Nrf2的结合、抑制Nrf2泛素化以及Nrf2对CBR1的转录调控。
验证维生素K2对成骨细胞铁死亡的抑制作用及其依赖的CBR1/FPN途径。
使用RSL-3诱导铁死亡,检测GPX4、TFRC、FPN、xCT表达,线粒体形态,Fe2+、MDA、ROS水平,及线粒体膜电位。并用siRNA敲低CBR1或FPN验证通路依赖性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与处理 | α-MEM培养基 | Viva Cell | C04001-050×10 |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Biological Industries | C04001-050×10 |
| 药物处理 | 维生素K2(甲萘醌-4) | MedChemExpress | HY-B2156 |
| 染色 | 苏木素染色试剂盒 | Beyotime | C0138 |
| 碱性磷酸酶染色试剂盒 | Solarbio | G1481 | |
| 铁死亡诱导 | RSL-3 | Solarbio | IR1120 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | Beyotime | C2003S |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| 药物处理 | 前列腺素E2 | MedChemExpress | HY-B2156 |
| 动物实验 | 钙黄绿素 | Servicebio | G1278 |
| 细胞活力检测 | CCK-8细胞活力检测试剂盒 | APExBIO | K1018 |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 | |
| ELISA | PGE2 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-0034 |
| RNA提取 | RNAiso Plus | Takara | -- |
| qRT-PCR | RNA提取试剂 | TaKaRa | 9767 |
| Prime Script RT试剂盒 | TaKaRa | RR047A | |
| Trans Start Green qPCR预混液 | TransGen | AQ101-01 | |
| 免疫共沉淀 | 免疫沉淀试剂盒 | Proteintech | PK10008 |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG(HRP) | Servicebio | GB23301 |
| FITC-酪胺 | Servicebio | G1222 | |
| 山羊抗兔IgG(CY3) | Servicebio | GB21303 | |
| EMSA | EMSA化学发光试剂盒 | Beyotime | GS009 |
| ChIP-qPCR | ChIP-qPCR检测试剂盒 | Beyotime | P2083S |
| 荧光显微镜 | 荧光倒置显微镜 | Nikon | Eclipse |
| 流式细胞术 | FACScan流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 铁死亡检测 | C11-BODIPY 581/591 | Invitrogen | -- |
| 铁离子检测 | FerroOrange | Cell Signaling Technology | 36104S |
| siRNA转染 | Opti-MEM减血清培养基 | Gibco | -- |
| Lipofectamine 2000试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| micro-CT | SkyScan1276 | Bruker | -- |
| 质谱分析 | SCIEX 6500 QTRAP | SCIEX | -- |
| 代谢组学 | Hypesil Gold色谱柱 | Thermo Fisher | -- |
| Q Exactive HF-X | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 绝经后女性年龄范围、骨密度分组标准、血清VK2测定方法及样本量。 阅读提示:Materials and methods: Postmenopausal women: collection of venous blood and determination of VK2 levels; Bone density measurement |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别、分组(ctrl, OVX, VK2)、VK2给药剂量(20 mg/kg/d)、给药途径、给药时间(8周)。 阅读提示:Materials and methods: Animal experiment |
| 细胞培养与分化 | 细胞系(MC3T3-E1 subclone 14)、培养条件(10% FBS/α-MEM)、分化培养基成分、VK2处理浓度(10^-5 M)、分化时间。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, induction of differentiation, and cell viability assay; Figure 1 legend |
| 代谢组学分析 | 骨组织样本处理、色谱柱型号、质谱仪型号、组别样本量(ctrl n=9, OVX n=8, VK2 n=9)。 阅读提示:Materials and methods: Non-targeted metabolomics sequencing; Figure 2 legend |
| 分子机制研究 | Western blot、RT-qPCR、EMSA、ChIP-qPCR、IP、Co-IP、免疫荧光等实验条件,包括抗体、试剂盒、浓度、时间。 阅读提示:Materials and methods: Western blotting, qRT-PCR, Immunoprecipitation, ChIP-qPCR, EMSA; Figures 3 legends |
| 铁死亡验证 | RSL-3浓度(1 μM)、VK2浓度(10^-5 M)、PGE2浓度(10 μM)、siRNA敲低CBR1和FPN序列及浓度。 阅读提示:Materials and methods: siRNA transfection, Detection of intracellular Fe2+ and lipid peroxidation; Figures 5 and 6 legends |