菌株发酵与提取
大量培养Penicillium sp. NX-S-6以获得次级代谢产物
使用30 L固体大米培养基进行发酵,发酵产物用乙酸乙酯提取,获得粗提物。
Anti-Inflammatory Secondary Metabolites from Penicillium sp. NX-S-6.
包含化合物分离纯化、结构鉴定、体外抗炎活性筛选及机制研究,但缺乏体内实验验证,证据层级相对单一。
RAW264.7巨噬细胞 LPS诱导的iBMDMs
LPS刺激RAW264.7细胞和iBMDMs 化合物处理浓度(2.5-50 μM) NLRP3炎症小体通路 qRT-PCR和Western blot检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
大量培养Penicillium sp. NX-S-6以获得次级代谢产物
使用30 L固体大米培养基进行发酵,发酵产物用乙酸乙酯提取,获得粗提物。
从粗提物中分离纯化单一化合物
采用硅胶柱色谱、Sephadex LH-20柱色谱和制备型高效液相色谱进行分离纯化,得到五个新化合物和十三个已知化合物。
确定新化合物的平面结构和绝对构型
通过1D/2D NMR、HRESIMS、ECD实验及TDDFT计算,确定化合物1、2、10、11、14的结构和绝对构型。
评价所有分离化合物对LPS诱导的RAW264.7细胞中NO和IL-6产生的抑制作用
采用Griess法检测NO,ELISA检测IL-6,评估化合物的抗炎活性。
探讨活性化合物4和8的抗炎作用机制
在LPS诱导的iBMDMs中,通过qRT-PCR和Western blot检测炎症因子表达和NLRP3炎症小体通路相关蛋白水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 光学旋转测定 | MCP 5100数字旋光仪 | Anton Paar | -- |
| 圆二色谱测量 | J-810圆二色谱仪 | Jasco | -- |
| 核磁共振测量 | Avance AV500核磁共振波谱仪 | Bruker | -- |
| 高分辨质谱测量 | Zeno TOF 7600质谱仪 | AB SCIEX | -- |
| HPLC分析 | Agilent 1260高效液相色谱系统 | Agilent Technologies | -- |
| 制备型HPLC分离 | Waters 1525EF液相色谱系统 | Waters | -- |
| 柱色谱分离 | Sephadex LH-20凝胶 | GE Healthcare | -- |
| 硅胶 | Qingdao Marine Chemical Co., Ltd. | -- | |
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | VIVA Cell | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | KeyGEN Bio TECH | -- | |
| 二甲基亚砜 | KeyGEN Bio TECH | -- | |
| 细胞刺激 | 脂多糖 | Sigma | -- |
| 一氧化氮检测 | 一氧化氮检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| IL-6检测 | 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 细胞活性检测 | CCK-8试剂盒 | 文中未明确说明 | -- |
| qRT-PCR | FreeZol试剂盒 | Vazyme Biotech Co., Ltd. | -- |
| HiScript II QRT SuperMix for qPCR (+qDNA wiper) 试剂 | Vazyme Biotech Co., Ltd. | -- | |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme Biotech Co., Ltd. | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| SDS-PAGE蛋白上样缓冲液(5×) | Beyotime | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 发酵与提取 | 种子培养条件、发酵培养基组成(大米和水比例)、发酵时间(25天)、提取溶剂 阅读提示:Materials and Methods 3.2节 |
| 抗炎活性筛选 | RAW264.7细胞密度、化合物浓度梯度、LPS刺激浓度和时间 阅读提示:Materials and Methods 3.4节 |
| 机制研究 | iBMDMs细胞培养条件、LPS刺激浓度、化合物浓度、qRT-PCR和Western blot检测的蛋白和基因 阅读提示:Materials and Methods 3.4节和Figure 6图注 |