生物信息学分析
分析骨肉瘤中CD40表达与免疫浸润及STING激活的相关性。
利用GEO数据集GSE87624,通过CIBERSORTx评估免疫细胞浸润,比较STING相关基因和共刺激分子的表达差异。
BSA-LDHs-cGAMP In Situ Sensitization of Osteosarcoma: Enhancing Antitumor Efficacy with CD40 Agonist Antibodies.
包含纳米颗粒合成表征、体外细胞实验、流式分析、免疫荧光、动物模型及联合治疗等实验层级,并有功能验证和机制验证。
小鼠骨肉瘤K7M2细胞系 小鼠RAW264.7巨噬细胞系 小鼠骨髓来源树突状细胞(BMDC) BALB/c小鼠皮下K7M2移植瘤模型
BSA与LDHs的质量比为5:2,BSA-LDHs与cGAMP的质量比为40:1 纳米颗粒粒径(约140 nm)和ζ电位(+40.29 mV) K7M2细胞接种量为5×10^6,肿瘤体积达250-300 mm³时开始治疗 BSA-LDHs-cGAMP瘤内注射剂量为25 μg,αCD40腹腔注射剂量为100 μg 流式细胞术检测CD40+细胞比例(如CD11c+CD40+细胞)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析骨肉瘤中CD40表达与免疫浸润及STING激活的相关性。
利用GEO数据集GSE87624,通过CIBERSORTx评估免疫细胞浸润,比较STING相关基因和共刺激分子的表达差异。
制备BSA-LDHs-cGAMP纳米颗粒并验证其理化性质。
合成Mg-Al LDH,与BSA交联,再负载cGAMP,通过DLS和TEM表征粒径、ζ电位和形态。
验证BSA-LDHs-cGAMP对DC和巨噬细胞CD40表达的影响。
将BMDC和RAW264.7细胞与BSA-LDHs-cGAMP共培养,通过流式细胞术检测CD40表达。
评估BSA-LDHs-cGAMP联合αCD40的抗肿瘤效果。
建立K7M2皮下移植瘤模型,分别给予PBS、BSA-LDHs-cGAMP、αCD40或联合治疗,监测肿瘤体积和生存期。
评估BSA-LDHs-cGAMP对肿瘤微环境免疫细胞浸润和功能的影响。
通过流式细胞术和免疫荧光分析肿瘤和淋巴结中的CD40+DC和巨噬细胞浸润,以及IFN-γ产生和抗原吞噬能力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 纳米颗粒合成 | 硝酸镁 | Sigma-Aldrich | -- |
| 牛血清白蛋白 | absin | -- | |
| 2'3'-cGAMP | InvivoGen | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Hyclone | -- |
| 流式细胞术 | APC/Cyanine7抗小鼠CD3抗体 | BioLegend | -- |
| FITC抗小鼠CD4抗体 | BioLegend | -- | |
| PE/Dazzle 594抗小鼠CD8a抗体 | BioLegend | -- | |
| APC抗小鼠CD11c抗体 | BioLegend | -- | |
| PE抗小鼠CD123抗体 | BioLegend | -- | |
| PE/Cyanine7抗小鼠CD40抗体 | BioLegend | -- | |
| PerCP抗小鼠CD45抗体 | BioLegend | -- | |
| Zombie Aqua固定化活力试剂盒 | BioLegend | -- | |
| Fc受体阻断剂 | BioLegend | -- | |
| FITC标记卵清蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 免疫荧光 | CD11c抗体 | -- | -- |
| CD86抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| CD40抗体 | Abcam | -- | |
| 纳米颗粒表征 | Zetasizer Advance | Malvern | -- |
| Tecnai G2 F30透射电子显微镜 | FEI | -- | |
| 流式细胞术 | CytoFLEX S流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| FlowJo软件 | BD Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 纳米颗粒合成 | Mg(NO3)2和Al(NO3)3的浓度(0.7 M和0.3 M)、反应温度(80 °C)和时间(5 h)、BSA与LDH的质量比(5:2)、BSA-LDHs与cGAMP的质量比(40:1) 阅读提示:详见Materials and Methods 2.5节 |
| 细胞培养 | K7M2细胞培养条件(DMEM+10%FBS)、细胞接种数(5×10^6)和接种部位(右背皮下) 阅读提示:详见Materials and Methods 2.8节 |
| 体内治疗 | BSA-LDHs-cGAMP瘤内注射剂量(25 μg)和时间(第0、2天)、αCD40腹腔注射剂量(100 μg)和时间(第2、9天) 阅读提示:详见Materials and Methods 2.12节及Figure 4A |
| 流式细胞术 | 抗体组合及荧光标记、Fc Block浓度(2.5 μg)、细胞染色步骤 阅读提示:详见Materials and Methods 2.10节 |
| 免疫荧光 | 组织固定(4%多聚甲醛48 h)、抗体及稀释度、染色步骤 阅读提示:详见Materials and Methods 2.11节 |