动物模型构建与验证
构建髓系特异性EP4敲除小鼠并验证敲除效率。
通过CRISPR-Cas9生成EP4Flox小鼠,与Lyz2-Cre小鼠杂交获得EP4MKO小鼠,再与ApoE-/-小鼠杂交获得ApoE-/-EP4MKO小鼠;通过qRT-PCR和Western blot确认敲除。
Macrophage EP4 Deficiency Drives Atherosclerosis Progression via CD36-Mediated Lipid Uptake and M1 Polarization.
包含细胞模型(BMDM、HMDM)、动物模型(ApoE-/-EP4MKO小鼠)、转录组学、蛋白质组学、功能验证(泡沫细胞形成、极化)及体内外机制验证。
骨髓来源巨噬细胞(BMDM) 人单核细胞来源巨噬细胞(HMDM) ApoE−/−EP4MKO小鼠 ApoE−/−EP4Flox小鼠
髓系特异性EP4敲除(EP4MKO)小鼠构建 Western diet喂养16周诱导动脉粥样硬化 CD36抑制剂SSO(25 mg/kg/week)腹腔注射4周 oxLDL(50 μg/mL)处理24小时诱导泡沫细胞 LPS(100 ng/mL)和IFN-γ(20 ng/mL)诱导M1极化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建髓系特异性EP4敲除小鼠并验证敲除效率。
通过CRISPR-Cas9生成EP4Flox小鼠,与Lyz2-Cre小鼠杂交获得EP4MKO小鼠,再与ApoE-/-小鼠杂交获得ApoE-/-EP4MKO小鼠;通过qRT-PCR和Western blot确认敲除。
评估EP4缺陷对动脉粥样硬化斑块形成和稳定性的影响。
对小鼠主动脉进行油红O染色、H&E染色、Masson染色,免疫荧光检测α-SMA和CD68。
探究EP4缺陷对巨噬细胞M1/M2极化的影响。
分离BMDM,用LPS/IFN-γ或IL4/IL13刺激,通过流式细胞术、qRT-PCR和Western blot检测标志物。
检测EP4缺陷对泡沫细胞形成和oxLDL摄取的影响。
BMDM和HMDM用oxLDL处理,进行油红O染色和Dil-oxLDL摄取实验。
验证EP4是否通过调节CD36表达影响泡沫细胞形成和极化。
通过转录组和蛋白组学分析筛选CD36,Western blot和qPCR验证;使用CD36 siRNA和SSO抑制剂进行功能验证。
确认EP4激活对巨噬细胞极化和泡沫细胞形成的抑制作用。
用CAY10580预处理BMDM,然后刺激极化或oxLDL处理,检测相关指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | CRISPR-Cas9系统 | -- | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | Procell | 164210-50 | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | 315-02 | |
| 药物处理 | CAY10580 | MCE | HY-135259 |
| 泡沫细胞诱导 | 氧化低密度脂蛋白 | Yiyuan biotechnologies | YB-002 |
| 脂质摄取分析 | Dil标记的氧化低密度脂蛋白 | Yiyuan biotechnologies | YB-001 |
| 染色 | 油红O | Servicebio | G1015 |
| 细胞核染色 | Hoechst染料 | Thermo Scientific | H3570 |
| 流式细胞术 | 抗CD16/CD32单克隆抗体 | Invitrogen | 14-0161-85 |
| 抗CD11b-PE-Cy7抗体 | Biolegend | 101216 | |
| 抗F4/80-FITC抗体 | Biolegend | 123108 | |
| 抗CD86-PE抗体 | Biolegend | 105007 | |
| 抗CD206-APC抗体 | Biolegend | 321110 | |
| 基因分型 | 直接小鼠基因分型试剂盒Plus | APExBio | K1027 |
| RNA提取 | Trizol试剂 | -- | -- |
| RNA测序 | NEBNext® UltraTM RNA文库制备试剂盒 | NEB | E7770 |
| NEBNext® UltraTM 定向RNA文库制备试剂盒 | NEB | E7760s | |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012 |
| 蛋白质电泳 | 考马斯亮蓝R-250 | Bestbio | BB-3720 |
| 蛋白质组学 | nanoElute超高效液相色谱系统 | Bruker | -- |
| timsTOF Pro质谱仪 | Bruker | -- | |
| MaxQuant软件 | Max Planck Institute of Biochemistry | -- | |
| KOALA软件 | Kanehisa Laboratories | -- | |
| 极化诱导 | 脂多糖 | Sigma | -- |
| 干扰素-γ | Peprotech | 315-05 | |
| 白细胞介素-4 | Peprotech | 214-14 | |
| 白细胞介素-13 | Peprotech | 210-13 | |
| 组织学 | Tissue-Tek O.C.T.包埋剂 | SAKURA | 4583 |
| Masson三色染色 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 抗CD68抗体 | Proteintech | 25747-1-AP |
| 抗EP4抗体 | Proteintech | 24895-1-AP | |
| Alexa Fluor 594偶联IgG抗体 | Abcam | ab150116 | |
| Alexa Fluor 488偶联IgG抗体 | Abcam | ab150077 | |
| Hoechst染料 | Thermo Scientific | H3570 | |
| Leica SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | Cytiva | SH30256.01B | |
| 正常山羊血清 | Gibco | 16210-64 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | B2064-100G | |
| 抗CD36抗体 | Proteintech | 18836-1-AP | |
| 抗Arg1抗体 | Proteintech | 16001-1-AP | |
| 抗F4/80抗体 | Servicebio | GB113373-100 | |
| 抗α-SMA抗体 | Abcam | ab7818 | |
| Alexa Fluor 594偶联IgG二抗 | Abcam | ab150160 | |
| DAPI染料 | Vector Laboratories | H-1200 | |
| RT-qPCR | RNeasy试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| PrimeScriptTM反转录试剂盒 | Takara | RR037A | |
| SYBR-Green荧光染料 | Takara | RR820A | |
| Applied Biosystems Q6快速实时荧光定量PCR系统 | Thermo Scientific | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Merck | 539131 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 | |
| 抗EP4抗体 | Proteintech | 24895-1-AP | |
| 抗CD36抗体 | Abcam | ab133625 | |
| 抗Arg1抗体 | Proteintech | 16001-1-AP | |
| 抗iNOS抗体 | Abcam | ab178945 | |
| 抗Hsp90抗体 | Abcam | ab203126 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| 增强化学发光检测试剂盒 | Merck | WBKLS0500 | |
| ImageLab软件 | Bio-rad | -- | |
| siRNA转染 | LipofectamineTM RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher | 13778150 |
| 动物实验 | 磺基琥珀酰亚胺油酸钠(SSO) | MCE | HY-112847A |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 髓系特异性EP4敲除小鼠的构建方法及基因型确认 阅读提示:Methods 2.1 Animals |
| 动脉粥样硬化诱导 | 西方饮食喂养时间(16周)及饮食组成(40% kcal% Fat, 1.25% Cholesterol, 0.5% Cholic) 阅读提示:Methods 2.1 Animals |
| 巨噬细胞培养 | BMDM分化条件(M-CSF浓度10 ng/mL,时间7天) 阅读提示:Methods 2.3 Macrophage Culture and Treatments |
| 泡沫细胞形成 | oxLDL处理浓度(50 μg/mL)和时间(24小时) 阅读提示:Methods 2.6 Foam Cell Induction and Uptake Assay |
| 巨噬细胞极化 | M1极化刺激物(LPS 100 ng/mL, IFN-γ 20 ng/mL)和M2极化刺激物(IL4 20 ng/mL, IL13 20 ng/mL) 阅读提示:Methods 2.7 Macrophage Polarization |
| CD36机制验证 | CD36 siRNA转染和SSO抑制剂使用剂量(25 mg/kg/week,腹腔注射4周) 阅读提示:Methods 2.13 siRNA Transfection, 2.1 Animals, Figure 7 legend |