构建HAX1敲低/过表达HL-60细胞系
体外验证HAX1对中性粒细胞分化和凋亡的影响。
使用pSicoR-shRNA载体敲低HAX1,PCDH-CMV-HAX1-3Flag过表达,经逆转录病毒感染HL-60细胞,嘌呤霉素筛选或FITC分选。
HAX1 inhibits apoptosis and promotes maturation of neutrophils.
包含体外细胞模型(HL-60敲低/过表达)、体内条件敲除小鼠模型(Hax1-cKO),并通过流式、集落形成、Western blot、RNA-seq、透射电镜等多层级验证功能与机制。
HL-60细胞系(HAX1敲低和过表达) Hax1fl/fl; Lyz2-Cre+条件敲除小鼠(C57BL/6J)
HL-60细胞:HAX1敲低和过表达载体构建及慢病毒感染(MOI 100-150,10 μg/mL polybrene) HL-60分化诱导:0.75% DMSO和0.5 μM all-trans-retinoic acid处理4天 小鼠模型:Hax1fl/fl与Lyz2-Cre+杂交,获得髓系特异性敲除 凋亡检测:Annexin V/DAPI染色,JC-1法检测线粒体膜电位 RNA-seq分析:差异基因筛选标准(P<0.05且|log2FC|≥1),KEGG富集分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
体外验证HAX1对中性粒细胞分化和凋亡的影响。
使用pSicoR-shRNA载体敲低HAX1,PCDH-CMV-HAX1-3Flag过表达,经逆转录病毒感染HL-60细胞,嘌呤霉素筛选或FITC分选。
评估HAX1对早幼粒细胞向中性粒细胞分化的影响。
使用DMSO和ATRA诱导HL-60分化4天,通过Wright-Giemsa染色和CD11b流式分析分化比例。
在体内验证HAX1对中性粒细胞成熟和髓系分化的影响。
将Hax1fl/fl小鼠与Lyz2-Cre+小鼠杂交,获得Hax1-cKO小鼠,通过基因型鉴定和Western blot/RT-qPCR确认敲除效率。
检测HAX1缺失对骨髓和外周血中髓系细胞及中性粒细胞发育的影响。
通过血常规、流式细胞术分析骨髓和外周血中的粒细胞、单核细胞、中性粒细胞各阶段,以及祖细胞比例;通过集落形成实验检测CFU-GM, BFU-E, CFU-GEMM。
验证HAX1是否通过线粒体介导的凋亡通路调控中性粒细胞凋亡。
通过Western blot检测BAX, cleaved Caspase-9, Caspase-9水平;透射电镜观察线粒体超微结构;JC-1法检测线粒体膜电位。
探索HAX1调控中性粒细胞凋亡和成熟的分子机制。
对骨髓髓系祖细胞和终末分化细胞进行RNA测序,分析差异表达基因、KEGG富集及蛋白相互作用,并通过RT-qPCR验证关键基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Iscove改良Dulbecco培养基 | Life Technologies | 12440053 |
| 胎牛血清 | Life Technologies | A5670701 | |
| DMEM培养基 | Cytiva | SH30022.01 | |
| HL-60细胞 | Procell | CL-0110 | |
| HEK293T细胞 | -- | -- | |
| Hela细胞 | Procell | CL-0005 | |
| 载体构建 | pSicoR载体 | Addgene | 11579 |
| PCDH-CMV-HAX1-3Flag-EF1a-CopGFP-T2A-Puro过表达载体 | SyngenTech | -- | |
| 病毒包装 | 逆转录病毒包装质粒 | Addgene | 12260 |
| 逆转录病毒包装质粒 | Addgene | 12259 | |
| 病毒感染 | 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | TR-1003 |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | Life Technologies | A1113803 |
| 细胞分化 | 二甲基亚砜 | Solarbio | D8371 |
| 全反式维甲酸 | Sigma-Aldrich | R2625 | |
| 凋亡检测 | PE-Annexin V | -- | -- |
| BV421-DAPI | -- | -- | |
| 流式分析 | APC/Cy7-CD11b抗体 | -- | -- |
| FACSAria II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| JC-1线粒体膜电位流式检测试剂盒 | MedChemExpress | -- | |
| 集落形成实验 | 甲基纤维素培养基 | STEMCELL | 03434 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | 78440 | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 近红外成像系统Odyssey CLx | LI-COR Biosciences | -- | |
| Image Studio Lite 5.2.5软件 | -- | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026CN |
| PrimeScript RT Master Mix试剂盒 | TaKaRa | RR036A | |
| TB Green PCR试剂盒 | TaKaRa | RR820A | |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | HL-60细胞培养条件(IMDM+20% FBS)、分化诱导剂浓度(0.75% DMSO和0.5 μM ATRA)及处理时间(4天) 阅读提示:Methods: Cell lines, Morphological and apoptotic analysis |
| 病毒转导与筛选 | MOI(100-150)、polybrene浓度(10 μg/mL)、嘌呤霉素浓度(4-10 μg/mL)及筛选时间(72小时后开始筛选) 阅读提示:Methods: Expression plasmid production and retroviral infection |
| 小鼠模型构建 | 小鼠品系(C57BL/6J)、年龄(约10周)、Hax1fl/fl与Lyz2-Cre+杂交策略,以及基因型确认方法 阅读提示:Methods: Mice, Results: Fig.2 |
| 流式细胞术分析 | 用于中性粒细胞亚群和祖细胞分析的抗体组合(详见补充表S2)、样本制备(骨髓和外周血)、计数方法(绝对计数管) 阅读提示:Methods: Flow cytometry analysis, Results: Fig.3 |
| 凋亡与线粒体检测 | 蛋白检测目标(BAX、cleaved Caspase-9等)、JC-1染色条件(37℃ 30分钟)及透射电镜样本处理 阅读提示:Methods: Western blot, Morphological and apoptotic analysis; Results: Fig.5 |