利用V-ATPase激活的非炎性脂质纳米颗粒增强RNA纳米疗法以治疗慢性肺损伤

Boosting RNA nanotherapeutics with V-ATPase activating non-inflammatory lipid nanoparticles to treat chronic lung injury.

作者信息Zhiqiang Zhao, Xinzhu Shan, Jing Ding, Bin Ma, Buyao Li, Wendi Huang, Qingqing Yang, Yian Fang, Junhe Chen, Chenglin Song, Chenlong Wei, Shuai Liu, Xingdi Cheng, Shengran Zhang, Yunxuan Liu, Hongkun Wu, Cong Luo, Shaokun Shu, Xue Qiao, Zefeng Wang, Xueguang Lu, Lei Miao
PMID40659631
发布时间2025-07-14
DOI10.1038/s41467-025-61688-z

实验完整度

高

包含体外细胞实验、CRISPR筛选、动物模型(BPD、IPF、ALI)、犬类模型及组学分析,且涉及功能和机制验证。

主要模型

A549肺上皮细胞 RAW264.7巨噬细胞 支气管肺发育不良(BPD)大鼠模型 特发性肺纤维化(IPF)小鼠模型

重点核对

LNP配方中PL32与熊果酸(UA)的摩尔比例 给药剂量:0.2或0.6 mg/kg mRNA 给药方式:气管内滴注或雾化吸入 雾化吸入给药时P-UA LNPs的稳定性(低盐缓冲液,如PB-蔗糖) 冻干制剂的重构与稳定性(4°C储存3个月)

摘要

脂质纳米颗粒(LNPs)是mRNA递送的有前景的平台。然而,它们在炎性肺部疾病中的应用受到反应原性和次优递送的限制。在这里,我们通过将源自天然产物库的熊果酸掺入可生物降解的阳离子磷酰胺衍生的LNP配方中,开发了一种非炎性LNP(NIF-LNP)。与含有ALC-0315的LNP相比,NIF-LNP在肺部蛋白表达方面表现出40倍的增强,且未引起显著的反应原性。我们的CRISPR-KO机制研究发现,熊果酸通过激活V-ATP酶复合物促进内体酸化,该复合物作为LNPs内体运输和炎症控制的中枢。此外,我们确定了封装在NIF-LNP中的细胞内昼夜节律调节基因NR1D1,在支气管肺发育不良和肺纤维化中显示出显著的治疗效果。为了增强临床可行性,我们开发了一种冻干制剂,可保持稳定性超过90天,并确保在临床前雄性小鼠、幼鼠和雄性犬模型中的有效雾化。总的来说,这种V-ATP酶激活的雾化NIF-LNP为治疗多种慢性炎性肺部疾病提供了一种可行的策略。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何提高mRNA脂质纳米颗粒的递送效率并减少其反应原性,以用于治疗慢性炎性肺部疾病?
核心机制
熊果酸通过激活V-ATP酶促进内体酸化,从而增强内体逃逸和mRNA释放,同时维持内体稳态,减少炎症反应。
主要证据
基于CRISPR敲除筛选和siRNA敲低实验,证明ATP6V0B和ATP6V1B2等V-ATP酶亚基是P-UA LNP高效转染所必需的;P-UA LNP增强内体酸化(溶酶体示踪剂荧光增强)、ALIX招募和ESCRT修复,降低ROS和NF-κB激活。
研究意义
该研究提供了一种通过V-ATPase激活实现高表达和低反应原性的LNP策略,并为治疗支气管肺发育不良和特发性肺纤维化等慢性炎性肺病提供了候选mRNA疗法。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

筛选可生物降解的磷酰胺脂质库

鉴定高效递送mRNA至肺部的可离子化阳离子脂质。

合成了包含不同酯键和酰胺键的PLs,制备包载荧光素酶mRNA的LNPs,经气管内给药后检测肺部荧光素酶表达。

2

筛选天然抗炎产物(NAIPs)

确定能够增强mRNA表达并减轻炎症的天然产物成分。

将22种NAIPs以20%摩尔比例掺入PL32 LNP,检测在A549细胞中的表达和巨噬细胞炎症基因表达。

3

评估P-UA LNP的体内表达和炎症反应

验证最优配方P-UA LNP在肺部的高效表达和低炎症特性。

气管内给予mLuc P-UA LNPs至健康小鼠、ALI和IPF模型,检测荧光素酶表达、细胞因子水平和肺组织学。

4

机制研究:CRISPR筛选和V-ATPase验证

揭示P-UA LNP增强表达和降低炎症的分子机制。

利用全基因组CRISPR敲除筛选鉴定差异表达基因,通过siRNA敲低验证V-ATPase亚基对mRNA表达和细胞内pH的影响。

5

BPD大鼠模型中的治疗评估

评估mNR1D1 P-UA LNP对支气管肺发育不良的治疗效果。

在BPD大鼠中气管内给予mNR1D1或mFGF10 P-UA LNPs,检测体重、炎症因子、氧化应激、肺组织结构。

6

IPF小鼠模型中的治疗评估

评估mNR1D1 P-UA LNP对特发性肺纤维化的治疗效果。

在IPF小鼠中气管内给予mNR1D1 P-UA LNPs,检测生存率、细胞因子、免疫细胞浸润、纤维化标志物和组织学。

7

优化雾化和冻干制剂

提高P-UA LNP在雾化和冻干后的稳定性。

使用不同缓冲液和冻干保护剂,检测雾化后粒径、包封率和肺部表达,并进行冻干储存稳定性测试。

8

大动物模型验证

评估P-UA LNP在大型动物(犬)中的递送效率和安全性。

雾化吸入mLuc P-UA LNPs至比格犬,检测肺部表达、炎症反应和血常规。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DLin-MC3-DMAAvanti Polar Lipids, Inc.--
ALC-0315Avanti Polar Lipids, Inc.--
cKK-E12MedChemExpress (MCE)--
1,2-二硬脂酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱AVT (Shanghai) Pharmaceutical Tech Co., Ltd.--
胆固醇AVT (Shanghai) Pharmaceutical Tech Co., Ltd.--
DMG-PEG2000AVT (Shanghai) Pharmaceutical Tech Co., Ltd.--
熊果酸----
T7聚合酶Hongene Biotech Inc., China--
1-甲基假尿苷三磷酸----
RPMI-1640培养基----
胎牛血清Procell Life Science & Technology Co., Ltd.--
青霉素-链霉素Meilunbio Co., Ltd.--
DMEM培养基----
小鼠IL-6、TNF-α、IL-1β和IFN-γ ELISA试剂盒Solarbio Science & Technology Co., Ltd.--
大鼠IL-1β、IL-6、TNF-α和CXCL1 ELISA试剂盒Solarbio Science & Technology Co., Ltd.--
人炎性细胞因子流式微球阵列(CBA)- I试剂盒----
Quant-iT RiboGreen RNA检测Invitrogen--
Zetasizer Nano ZSPMalvern--
微流控设备Micro&Nano Biologics Co., Ltd.--
LyoBeta-15 II 050-359冻干机Telstar Co., Ltd.--
Lipofectamine 2000Invitrogen--
jetPRIMEPolyplus--
萤火虫荧光素酶报告基因检测试剂盒Yeasen Biotechnology Co., Ltd.--
BioTek synergy H1酶标仪BioTek--
TransZol Up Plus RNA试剂盒TransGen Biotech--
HiScript III一步法逆转录预混液Vazyme Biotech Co., Ltd.--
qPCR预混液TransGen Biotech--
QuantStudio 6 Flex仪器Applied Biosystems--
H3慢病毒文库Addgene--
TIANamp基因组DNA试剂盒TiangenDP304
2×EasyTaq PCR预混液TransGen BiotechAS111-11
TIANgel纯化试剂盒TiangenDP219
Illumina NovaSeq S4Illumina--
蔡司LSM880共聚焦显微镜Carl Zeiss AG--
Vectra PolarisAkoya--
Hoechst 33342----
溶酶体示踪剂----
BODIPY-脂质----
DAPI----
二氢乙啶(DHE)探针----
RIPA裂解液----
一抗----
二抗----
脂多糖----
硫酸博来霉素----
水合氯醛----
异氟烷----
I型胶原酶----
中性蛋白酶----
脱氧核糖核酸酶I----
gentleMACS Octo组织处理器Miltenyi Biotec--
Aeroneb振动网筛雾化器----
AerogenSolo雾化器----
IVIS成像系统Perkin Elmer--
Promega荧光素酶检测系统Promega--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
LNP制备
离子化脂质(PL32)、DSPC、胆固醇、DMG-PEG2000和熊果酸(UA)的摩尔比例
阅读提示:Methods: Lipid nanoparticle preparation and characterization
mRNA合成
mRNA序列(mLuc, mGFP, mNR1D1, mFGF10, mCre)及加帽类似物(CleanCap AG)
阅读提示:Methods: mRNA synthesis
细胞实验
细胞系(A549、RAW264.7等)、培养条件、mRNA剂量和孵育时间
阅读提示:Methods: Cells culture and assays
体内给药
动物品系(C57BL/6J小鼠、SD大鼠、比格犬)、性别、年龄、模型诱导方法、给药剂量(0.2或0.6 mg/kg)、给药方式(气管内滴注或雾化)
阅读提示:Methods: Animal models and In vivo expression
雾化和冻干
缓冲液(如PBS、PB-蔗糖)、冻干保护剂(如蔗糖)种类和浓度、冻干循环参数、储存温度和稳定性测试时间点
阅读提示:Methods: Lyophilization of LNPs and Inhaled delivery
机制研究
siRNA序列(靶向ATP6V0B、ATP6V1B2等)、siRNA递送方法(MC3 LNP)、敲低效率和检测时间点
阅读提示:Methods: CRISPR screening, Detecting acidity of endosomal compartment, V-ATPase activity