CD131表达分析
检测CD131(Csf2rb)在结肠炎中的表达变化。
通过分析基因表达数据集和RT-qPCR检测DSS处理小鼠结肠组织中Csf2rb mRNA水平。
CD131 contributes to ulcerative colitis pathogenesis by promoting macrophage infiltration.
包含体外细胞实验、小鼠模型、临床样本和组学分析,但缺乏细胞特异性敲除等直接功能验证,且部分实验细节不完整。
DSS诱导的小鼠结肠炎模型(C57BL/6J野生型及CD131杂合敲除小鼠) RAW 264.7小鼠巨噬细胞系 溃疡性结肠炎患者结肠组织标本
DSS浓度2%(wt/vol)和给药时间7天 CD131缺陷小鼠为杂合敲除(Csf2rb+/-) 巨噬细胞耗竭采用氯膦酸脂质体腹腔注射(200 μl,DSS开始前3天和开始后2天) 抗CCL4抗体尾静脉注射(200 μg,DSS开始当天和3天后) RAW 264.7细胞用rm-GM-CSF(20 ng/ml)刺激24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测CD131(Csf2rb)在结肠炎中的表达变化。
通过分析基因表达数据集和RT-qPCR检测DSS处理小鼠结肠组织中Csf2rb mRNA水平。
评估CD131缺失对DSS诱导结肠炎的影响。
比较野生型和CD131杂合敲除小鼠在DSS处理后的体重变化、结肠长度、组织学损伤、中性粒细胞浸润和炎症因子表达。
探索CD131相关的免疫细胞浸润和信号通路。
对结肠组织进行RNA-seq,进行免疫细胞浸润分析、GSEA和差异表达基因分析。
验证巨噬细胞在CD131介导结肠炎中的作用。
通过流式细胞术检测结肠巨噬细胞数量,使用氯膦酸脂质体耗竭巨噬细胞,并检测巨噬细胞TNF表达。
验证CD131信号对巨噬细胞促炎功能的影响。
用rm-GM-CSF刺激RAW 264.7细胞,检测Tnf mRNA表达和细胞增殖。
验证CCL4是否介导CD131对巨噬细胞和T细胞趋化的影响。
检测结肠组织中Ccl4 mRNA表达,并用抗CCL4抗体处理小鼠观察巨噬细胞和T细胞浸润及炎症指标。
评估CD131表达与UC患者临床严重程度的相关性。
分析UC患者结肠组织CSF2RB表达和CD131免疫组化染色,并与内镜和病理指数及巨噬细胞、T细胞浸润相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小鼠结肠炎模型 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | 160110 |
| 巨噬细胞耗竭对照 | PBS脂质体 | Liposoma BV | -- |
| 趋化因子阻断 | 抗小鼠CCL4抗体 | BioLegend | -- |
| 趋化因子阻断对照 | IgG2b-κ同型对照抗体 | BioLegend | -- |
| 组织消化 | 胶原酶I | Sigma-Aldrich | -- |
| 胶原酶XI | Sigma-Aldrich | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | GlpBio | -- | |
| 透明质酸酶 | Solarbio | -- | |
| 细胞过滤 | 40微米细胞滤网 | Biosharp | -- |
| 红细胞裂解 | 红细胞裂解液 | Solarbio | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Solarbio | 11995 |
| 胎牛血清 | Procell | -- | |
| 体外细胞刺激 | 重组小鼠GM-CSF | Peprotech | -- |
| 增殖实验 | CFSE细胞分裂示踪试剂盒 | BioLegend | -- |
| 固定 | 甲醛 | Solarbio | -- |
| 流式细胞术 | LSRFortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| Zombie UV可固定活力试剂盒 | BioLegend | -- | |
| 抗CD16/CD32抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗CD326(EpCAM)-APC抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗CD45.2-FITC抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD11b-Pacific Blue抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗Ly-6G-PerCP-Cy5.5抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗F4/80-Brilliant Violet 510抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗I-A/I-E-Brilliant Violet 605抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗Ly-6C-Brilliant Violet 650抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD3-APC-Cy7抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗CD19-PE-CF594抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗CD11c-PE-Cy7抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗CD131-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗TNF-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗IgG1, κ-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 染色缓冲液 | 牛血清白蛋白 | Solarbio | -- |
| 透化 | 透化缓冲液 | eBioscience | -- |
| 组织学 | ECLIPSE Ci数字扫描仪 | Nikon | -- |
| 免疫组化 | 抗CD131抗体 | Proteintech | -- |
| 抗CD68抗体 | eBioscience | 克隆号KP1 | |
| 抗CD3抗体 | eBioscience | 克隆号UCHT1 | |
| 基因分型 | Willy缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白酶K | GlpBio | -- | |
| 2×快速Taq预混液 | Vazyme | -- | |
| 琼脂糖 | -- | -- | |
| 引物对 | Sangon Biotech | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Vazyme | -- |
| NanoPhotometer N50分光光度计 | Implen | -- | |
| HiScript III逆转录预混液 | Vazyme | -- | |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| 7500 Fast实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒(Illumina) | New England Biolabs | -- | |
| NovaSeq 6000测序系统 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠结肠炎模型 | DSS浓度2%(wt/vol),处理7天,小鼠周龄8-10周,体重至少18g,每组至少5只 阅读提示:Methods: Chemically induced experimental colitis and in vivo interventions |
| CD131缺陷小鼠 | CD131杂合敲除小鼠(Csf2rb+/-)的基因型确认,Csf2rb mRNA表达水平 阅读提示:Methods: Mice; PCR genotyping |
| 巨噬细胞耗竭 | 氯膦酸脂质体剂量200μl腹腔注射,时间点(DSS开始前3天和开始后2天) 阅读提示:Methods: Monocyte depletion |
| 趋化因子阻断 | 抗CCL4抗体剂量200μg尾静脉注射,时间点(DSS开始当天和3天后) 阅读提示:Methods: Anti-CCL4 |
| 体外细胞刺激 | RAW 264.7细胞培养条件(DMEM+10%FBS),rm-GM-CSF浓度20 ng/ml,刺激24小时 阅读提示:Methods: Cell culture and in vitro interventions |
| 临床样本分析 | UC患者纳入标准(手术及病理确诊),样本量29例,CD131免疫组化评分方法 阅读提示:Methods: Human; Histology |