患者队列构建与基线特征分析
纳入符合标准的非小细胞肺癌患者并比较不同病理亚型的临床特征。
回顾性收集2018年5月至2023年11月武汉大学中南医院142例不可切除III-IV期NSCLC患者的临床数据和肿瘤标志物水平,进行基线特征比较。
The heterogeneous expression patterns of serum tumor markers in non-small cell lung cancer patients are predictive factors for progression-free survival.
包含临床回顾性队列分析、SOM聚类、生存分析、体外共培养实验及CCK-8增殖检测,但功能验证仅限于CA125对鳞癌细胞系的影响,未在其他模型或体内验证。
142例不可切除III-IV期非小细胞肺癌患者队列 H520人肺鳞状细胞癌细胞系 PC9人肺腺癌细胞系 A549人肺腺癌细胞系
队列纳入标准:不可切除III-IV期NSCLC,接受化疗,排除TKI靶向治疗和原发灶手术 肿瘤标志物检测:基线水平CEA、CA125、NSE、SCC SOM参数:rlen=20000,聚类数=4 体外实验:H520与PC9/A549共培养,CA125浓度及H520增殖检测时间点(第4天和第8天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
纳入符合标准的非小细胞肺癌患者并比较不同病理亚型的临床特征。
回顾性收集2018年5月至2023年11月武汉大学中南医院142例不可切除III-IV期NSCLC患者的临床数据和肿瘤标志物水平,进行基线特征比较。
评估不同病理亚型中血清肿瘤标志物的表达分布及差异。
使用Spearman相关分析、热图和ROC曲线分析CEA、CA125、NSE、SCC在LUAD和LUSC患者中的表达及相关性。
通过无监督学习识别新的肿瘤标志物表达模式。
分别对LUSC和LUAD患者使用SOM算法进行聚类,并分析不同模式与PFS及临床特征的关系。
将SOM模式转化为临床可用的简易模式,并验证其预后价值。
定义L、C、S模式及其亚型,使用单因素和多因素Cox回归分析评估各模式对PFS的预测能力,并构建列线图。
验证高CA125环境是否促进鳞状细胞癌细胞的恶性行为。
将H520细胞与PC9或A549细胞共培养,收集上清液检测CA125浓度,并评估H520细胞活力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Hyclone | SH30809.01B |
| 胎牛血清 | Hyclone | 30401.01 | |
| 细胞培养小室 | LABSELECT | 14111 | |
| 细胞系 | A549 | ATCC | CCL-185 |
| PC9 | Procell | CL-0668 | |
| H520 | Procell | CL-0402 | |
| ELISA | CA125 ELISA试剂盒 | Abclonal | RK05026 |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | MeilunBio | MA0218 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者队列纳入标准 | 患者必须为不可切除III-IV期NSCLC,接受化疗,排除TKI靶向治疗和原发灶手术。 阅读提示:详见Methods中的"Study population"部分 |
| 肿瘤标志物检测 | 基线标志物CEA、CA125、NSE、SCC的检测方法和时间点(初次诊断时)。 阅读提示:详见Methods中的"Study population"和Results中的"Patient baseline characteristic" |
| SOM分析 | SOM参数(rlen=20000,聚类数=4),以及高低表达的定义(高于50%为高表达,低于20%为低表达)。 阅读提示:详见Methods中的"SOM"和"Identification of tumor biomarker patterns" |
| 体外共培养实验 | 共培养体系(PET膜小室)、细胞比例(未明确说明)、培养时间(第4天和第8天)、CA125检测和CCK-8实验条件。 阅读提示:详见Methods中的"Culture of cell lines"、"ELISA"和"CCK-8 assay",以及Figure 6图例 |
| 统计分析 | Cox回归模型调整的协变量、统计显著性阈值(p<0.05)。 阅读提示:详见Methods中的"Statistical analysis" |