评估PAH对胃癌细胞活力的影响
确定PAH对胃癌细胞增殖的抑制效果及剂量和时间依赖性。
使用MTT法检测不同浓度PAH处理HGC27、AGS和MFC细胞24 h或48 h的细胞活力,并计算IC50;通过克隆形成实验和Calcein-AM/PI染色评估细胞增殖和存活。
Perillaldehyde synergizes with ferroptosis inducers to promote ferroptotic cell death in gastric cancer.
包含体外细胞实验(MTT、克隆形成、划痕、ROS、铁死亡指标)、体内小鼠移植瘤模型、RNA-seq及机制验证(siRNA敲低、抑制剂)等多个证据层级,并进行功能验证。
HGC27人胃癌细胞系 AGS人胃癌细胞系 MFC小鼠胃癌细胞系 MFC细胞BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型
PAH处理浓度与时间:HGC27(50/100/150 μmol/L,24 h)、AGS(150/200/250 μmol/L,24 h)、MFC(300/400/500 μmol/L,48 h) 动物模型:BALB/c裸鼠皮下注射MFC细胞(1.5×10^5),随机分为对照组、5-FU组(20 mg/kg)、低剂量PAH组(50 mg/kg)、高剂量PAH组(100 mg/kg),每组4只 联合用药浓度:Fer-1(2 μmol/L)、RSL3(10 μmol/L?文中未明确,但图中显示) siRNA敲低Nrf2序列及转染条件 RNA-seq处理条件:AGS细胞200 μmol/L PAH处理24 h
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定PAH对胃癌细胞增殖的抑制效果及剂量和时间依赖性。
使用MTT法检测不同浓度PAH处理HGC27、AGS和MFC细胞24 h或48 h的细胞活力,并计算IC50;通过克隆形成实验和Calcein-AM/PI染色评估细胞增殖和存活。
测定PAH是否抑制胃癌细胞的迁移能力。
使用划痕实验检测HGC27和AGS细胞在不同浓度PAH处理24 h后的迁移率。
验证PAH在体内对胃癌肿瘤生长的抑制作用及安全性。
在BALB/c裸鼠皮下注射MFC细胞建立肿瘤模型,随机分组后给予PAH或5-FU处理,测量肿瘤体积、重量,并进行HE染色检查主要器官。
评估PAH对胃癌细胞ROS产生和线粒体膜电位的影响。
使用DCF和DHE荧光染色检测ROS水平,JC-1染色检测线粒体膜电位。
鉴定PAH处理后差异表达基因及相关通路。
对AGS细胞进行200 μmol/L PAH处理24 h后提取RNA,进行RNA-seq,并进行KEGG和Reactome通路富集分析。
确认PAH诱导的细胞死亡类型为铁死亡。
使用FerroOrange检测Fe2+,BODIPY 581/591 C11检测脂质过氧化,GSH检测试剂盒检测GSH水平,Western blot检测铁死亡相关蛋白(GPX4、SLC7A11、TFRC、FTH1、FTL)表达。
确定PAH诱导的铁死亡是否涉及系统Xc(−)/GSH/GPX4轴和P62-Keap1-Nrf2通路。
使用铁死亡抑制剂Fer-1、诱导剂RSL3与PAH联合处理细胞,检测细胞活力、克隆形成、迁移、ROS、MMP以及铁死亡相关蛋白和P62-Keap1-Nrf2通路蛋白表达。
通过敲低Nrf2评估其对PAH诱导铁死亡的调控作用。
使用siRNA转染敲低Nrf2后,用PAH处理细胞,检测细胞活力和蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 紫苏醛 | Selleck | S3205 |
| 二甲基亚砜 | MCE | HY-Y0320 | |
| Z-VAD-FMK | Selleck | S7023 | |
| Necrostatin-1 | Selleck | S8037 | |
| Ferrostatin-1 | MCE | HY-100579 | |
| RSL3 | MCE | Y-100218A | |
| 多柔比星 | TargetMol | T1020 | |
| 顺铂 | Selleck | S1166 | |
| 5-氟尿嘧啶 | MCE | HY-90006 | |
| 细胞活力检测 | MTT | Aladdin | M158055 |
| 细胞染色 | 结晶紫 | Aladdin | C110703 |
| 氧化应激检测 | H2DCFDA | MCE | HY-D0940 |
| 二氢乙啶 | Yeasen Biotechnology | 50102ES02 | |
| JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | UE Landy Biotechnology | J6004S | |
| 细胞活力检测 | Calcein/PI细胞活力与细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C2015M |
| siRNA转染 | Hieff Trans体外siRNA/miRNA转染试剂 | Yeasen Biotechnology | 40806ES02 |
| Fe2+检测 | FerroOrange | Dojindo | F374 |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11 | Invitrogen | D3861 |
| 免疫学检测 | GPX4重组兔单克隆抗体 | Abcam | ab125066 |
| SLC7A11兔多克隆抗体 | Proteintech | 26864-1-AP | |
| FTH1兔多克隆抗体 | Proteintech | 11682-1-AP | |
| FTL兔多克隆抗体 | Proteintech | 10727-1-AP | |
| GAPDH小鼠单克隆抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| SQSTM1/P62兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 39749 | |
| Nrf2兔单克隆抗体 | Abcam | ab62352 | |
| Nrf2兔多克隆抗体 | HUABIO | R1312-8 | |
| 山羊抗兔IgG(H+L)荧光二抗 | Elabscience | E-AB-1055 | |
| Keap1兔单克隆抗体 | Abcam | ab227828 | |
| NQO1兔单克隆抗体 | Abcam | ab80588 | |
| HO-1/HMOX1兔单克隆抗体 | Abcam | ab189491 | |
| Western blotting | Western和IP细胞裂解液 | Beyotime | P0013 |
| BCA蛋白检测试剂盒 | Elabscience | -- | |
| 5X上样缓冲液 | Elabscience | LT101S | |
| 一步法PAGE凝胶快速制备试剂盒 | Elabscience | PG212 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Pricella | -- |
| 胎牛血清 | Life-iLab | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Pricella | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:AGS和HGC27来自中国科学院上海细胞库,MFC来自武汉普诺赛生命科技有限公司;培养基:RPMI-1640添加10% FBS和100 U/mL青霉素/100 μg/mL链霉素;培养条件:37°C、5% CO2 阅读提示:2.2 Cell culture |
| MTT细胞活力检测 | 细胞接种密度、PAH浓度、处理时间、MTT浓度及孵育时间、490 nm吸光度测量 阅读提示:2.3 MTT cell viability assay; 3.1 Results, Figure 1B-D |
| 克隆形成实验 | 细胞接种密度(1000 cells/well)、PAH浓度、处理时间、培养天数(10-14天)、结晶紫染色时间 阅读提示:2.4 Colony formation assay |
| 划痕愈合实验 | 细胞密度、划痕时间点(0和24 h)、PAH浓度、迁移率计算 阅读提示:2.5 Wound healing assay |
| 动物实验 | 小鼠品系、性别、周龄(雌性BALB/c裸鼠,4周龄)、细胞接种数(1.5×10^5)、分组、剂量、给药方式、频率、肿瘤体积计算公式、处理时间 阅读提示:2.7 Animal experiments; Figure 2 |
| ROS检测 | 染料浓度(DCF和DHE均为10 μmol/L)、孵育时间(30 min)、PAH处理浓度和时间 阅读提示:2.9 ROS assay; Figure 3 |
| MMP检测 | JC-1染色工作液配制、孵育时间(30 min)、PAH处理 阅读提示:2.8 MMP assay; Figure 3A-B |
| RNA-seq | AGS细胞处理浓度(200 μmol/L)和时间(24 h)、RNA提取方法、测序平台、差异基因筛选阈值 阅读提示:2.10 RNA sequencing; Figure 4 |
| 免疫荧光 | 细胞处理、固定、透化、封闭、一抗浓度、二抗浓度、DAPI染色 阅读提示:2.11 Immunofluorescence analysis; Figure 4E |
| Fe2+检测 | 细胞密度(3×10^5/孔)、FerroOrange浓度(1 μmol/L)、孵育时间(30 min) 阅读提示:2.12 Intracellular Fe2+ assay; Figure 5B,E |
| GSH检测 | 试剂盒操作步骤、412 nm吸光度测量 阅读提示:2.13 Intracellular GSH level assay; Figure 5F |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY浓度(10 μmol/L)、孵育时间(30 min)、胰酶消化、流式细胞仪 阅读提示:2.14 BODIPY-581/591 C11 lipid peroxidation assay; Figure 5C,D |
| Western blotting | 抗体稀释比例、上样量、电泳条件、转膜条件、封闭时间、一抗孵育时间 阅读提示:2.15 Western blotting; Figures 4F,G, 5G,H, 7F, 8C-F |
| siRNA转染 | siRNA序列、转染试剂、转染时间、换液时间、后续培养时间 阅读提示:2.16 siRNA transfection; Figure 8A,B |
| 联合用药实验 | Fer-1和RSL3的浓度(文中未明确,但显示为2 μmol/L和1 μmol/L?需核对图注) 阅读提示:2.3, 3.4, 3.5; Figures 5A, 6, 7 |