检测ISG15在DKD中的表达
验证ISG15在DKD肾脏和HG处理的TECs中的表达变化
使用qPCR和Western blot检测DKD小鼠(STZ/HFD和db/db)及HG处理的TECs中Isg15 mRNA、ISG15蛋白和ISGylation水平。
Elevation of ISG15 promotes diabetic kidney disease by modulating renal tubular epithelial cell pyroptosis.
包含体内DKD小鼠模型(ISG15 KO、db/db)和体外细胞模型(TECs),并进行了功能验证(焦亡、纤维化、炎症)和机制验证(mtDNA–cGAS–STING通路、ISGylation)。
ISG15敲除(ISG15 KO)小鼠(C57BL/6背景) STZ/HFD诱导的DKD小鼠模型 db/db糖尿病小鼠模型(C57BLKS/JGpt背景) 小鼠肾小管上皮细胞(TECs)
ISG15表达水平:DKD小鼠和HG处理的TECs中ISG15 mRNA和蛋白水平升高 ISG15敲除效果:ISG15 KO小鼠中肾功能、纤维化、炎症和焦亡标志物的变化 HG处理条件:TECs用40 mM d-葡萄糖处理48小时 信号通路激活:cGAS–STING通路蛋白(cGAS、STING、p-TBK1、p-p65)的表达变化 ISGylation依赖性:ISG15野生型与ISG15AA突变体的差异效应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ISG15在DKD肾脏和HG处理的TECs中的表达变化
使用qPCR和Western blot检测DKD小鼠(STZ/HFD和db/db)及HG处理的TECs中Isg15 mRNA、ISG15蛋白和ISGylation水平。
确定ISG15缺失对DKD小鼠肾功能、纤维化和炎症的影响
使用ISG15 KO小鼠,通过STZ/HFD诱导DKD,检测肾功能指标(BUN、UAER)、组织学染色(PAS、Masson)和纤维化/炎症标志物。
探究ISG15是否通过调节焦亡影响TECs损伤
在HG处理的TECs中敲低ISG15,检测焦亡相关蛋白(NLRP3、CASP1、GSDMD)、Annexin V/PI双阳性率、LDH释放、IL-18和ROS水平。
确定ISG15通过NLRP3–CASP1–GSDMD轴促进TECs损伤和纤维化
通过siRNA敲低GSDMD或使用NLRP3抑制剂MCC950,检测ISG15过表达或HG处理下的焦亡、纤维化和炎症指标。
探究ISG15是否通过破坏线粒体稳态促进mtDNA释放
检测线粒体膜电位(JC-1)、线粒体质量(MitoTracker)、mtROS(MitoSOX)、mtDNA拷贝数及亚细胞分布。
评估cGAS–STING通路在DKD和HG条件下的激活状态及其在ISG15调节中的作用
通过Western blot检测cGAS、STING、p-TBK1/TBK1、p-p65/p65水平;使用STING抑制剂C-176处理TECs,检测焦亡、纤维化和炎症变化。
探究ISG15和STING之间的双向调控关系及其在维持TECs损伤中的作用
在TECs中敲低ISG15并过表达STING,或过表达ISG15并抑制STING,检测cGAS–STING通路和焦亡、纤维化、炎症标志物。
确定ISG15是通过ISGylation而非单体形式发挥功能
比较过表达ISG15野生型、ISG15AA突变体(不能结合)或空载体对cGAS–STING通路和焦亡、纤维化、炎症标志物的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | ISG15敲除小鼠 | Cyagen Biosciences | -- |
| db/db小鼠 | GemPharmatech | -- | |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Biosharp | -- |
| 胎牛血清 | Viva cell | -- | |
| D-葡萄糖 | Sigma | -- | |
| 甘露醇 | Sigma | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| siRNA合成 | 小干扰RNA | TSINGKE Biotech | -- |
| 质粒构建 | 质粒 | miaolingbio | -- |
| 药物处理 | Mito-TEMPO | TargetMol | -- |
| MCC950 | TargetMol | -- | |
| C-176 | TargetMol | -- | |
| 流式分析 | MitoTracker线粒体探针 | Beyotime | -- |
| MitoSOX Red线粒体超氧化物指示剂 | YEASEN | -- | |
| JC-1染料 | Beyotime | -- | |
| DCFH-DA活性氧探针 | Beyotime | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Meilunbio | -- |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V/PI检测试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| LDH释放检测 | LDH检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| NLRP3抗体 | ZEN-BIOSCIENCE | -- | |
| CASP1抗体 | BOSTER | -- | |
| GSDMD抗体 | HuaBio | -- | |
| Cleaved caspase-1抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| STING抗体 | Proteintech | -- | |
| cGAS抗体 | Abclone | -- | |
| TBK1抗体 | Proteintech | -- | |
| p-TBK1抗体 | Proteintech | -- | |
| p65抗体 | absin | -- | |
| p-p65抗体 | absin | -- | |
| ISG15抗体 | BOSTER | -- | |
| 山羊抗兔IgG | HuaBio | -- | |
| ECL化学发光试剂 | Beyotime | -- | |
| RNA提取 | HiPure组织RNA小提试剂盒 | Magen | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green荧光染料 | Vazyme | -- |
| 引物 | Sangon Biotech | -- | |
| RNA测序 | Illumina Novaseq6000测序平台 | Illumina | -- |
| RNA质量评估 | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| DNA提取 | TIANamp基因组DNA试剂盒 | TIANGEN | -- |
| 动物实验 | 链脲佐菌素 | -- | -- |
| 腺相关病毒9型 | GenePharma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DKD小鼠模型建立 | STZ注射剂量(60 mg/kg)和频率(5天),高脂饮食(60%脂肪热量),ISG15 KO遗传背景(C57BL/6) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.1节 |
| 细胞培养与HG处理 | TECs培养基(DMEM/F12含5% FBS),HG浓度(40 mM),处理时间(48小时),渗透压对照(40 mM甘露醇) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.2节 |
| siRNA转染 | siRNA浓度(50 nM),转染试剂(Lipofectamine 2000),转染时间(未明确),si-Isg15序列 阅读提示:参见Materials and Methods 2.2节和Table 1 |
| 焦亡检测 | Annexin V/PI双阳性率检测方法,LDH释放检测,IL-18 ELISA,ROS检测(DCFH-DA和MitoSOX) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.5, 2.6, 2.8节 |
| 信号通路抑制 | Mito-TEMPO(25 µM),MCC950(2 µM),C-176(10 µM)预处理时间(1.5小时) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.2节 |
| 线粒体功能检测 | MitoTracker浓度(1 µM),MitoSOX浓度(5 µM),JC-1染色,mtDNA拷贝数检测方法(qPCR) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.3, 2.10节 |